Protein–RNA interactions for Protein: Q13562

NEUROD1, Neurogenic differentiation factor 1, humanhuman

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Length 356 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEUROD1Q13562 BNIP3P29-201ENST00000598302 571 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
NEUROD1Q13562 AC073413.1-201ENST00000603927 732 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
NEUROD1Q13562 AC133552.6-201ENST00000613406 534 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
NEUROD1Q13562 AC011447.5-201ENST00000616168 564 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
NEUROD1Q13562 ZFP36L1-201ENST00000336440 3026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
NEUROD1Q13562 DNM2-204ENST00000408974 3013 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
NEUROD1Q13562 PPP5D1-201ENST00000414155 1882 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
NEUROD1Q13562 KIAA0513-207ENST00000567328 1873 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
NEUROD1Q13562 CLCNKA-201ENST00000331433 2475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
NEUROD1Q13562 TMEM51-204ENST00000428417 1942 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
NEUROD1Q13562 CDH20-201ENST00000262717 3882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
NEUROD1Q13562 CHMP7-202ENST00000397677 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
NEUROD1Q13562 EGOT-201ENST00000414938 1464 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
NEUROD1Q13562 KRT8P4-201ENST00000509735 1454 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
NEUROD1Q13562 C15orf41-208ENST00000566621 2866 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
NEUROD1Q13562 INTS11-204ENST00000421495 1868 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
NEUROD1Q13562 CDH23-202ENST00000299366 3954 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
NEUROD1Q13562 TMUB2-202ENST00000357984 1921 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
NEUROD1Q13562 NFATC2-203ENST00000414705 2974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
NEUROD1Q13562 RUBCNL-212ENST00000631139 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
NEUROD1Q13562 PAPD7-207ENST00000631941 1902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
NEUROD1Q13562 EPHB4-210ENST00000616502 3737 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
NEUROD1Q13562 ZNF587-203ENST00000423137 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
NEUROD1Q13562 SELENOM-201ENST00000400299 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
NEUROD1Q13562 PEX13-202ENST00000401576 1108 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
NEUROD1Q13562 AC017104.1-201ENST00000415129 720 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
NEUROD1Q13562 AC099552.1-201ENST00000431083 744 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
NEUROD1Q13562 KRT223P-202ENST00000449164 1292 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
NEUROD1Q13562 ATG10-207ENST00000513443 978 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
NEUROD1Q13562 FLJ27354-203ENST00000526694 851 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
NEUROD1Q13562 SLC35G4-201ENST00000588001 1017 ntAPPRIS P1 BASIC21.71■■□□□ 1.07
NEUROD1Q13562 AC020911.1-201ENST00000591038 578 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
NEUROD1Q13562 ADI1-201ENST00000327435 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
NEUROD1Q13562 RBPJ-206ENST00000361572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
NEUROD1Q13562 EHMT2-201ENST00000375528 4047 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
NEUROD1Q13562 ARHGEF28-202ENST00000296799 4424 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
NEUROD1Q13562 MYO15B-237ENST00000642007 4893 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
NEUROD1Q13562 LRRC20-204ENST00000373224 3095 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
NEUROD1Q13562 GOLGA8R-201ENST00000327271 1896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
NEUROD1Q13562 TBC1D9B-208ENST00000519746 2755 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
NEUROD1Q13562 RCOR1-201ENST00000262241 5754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
NEUROD1Q13562 SCAF11-204ENST00000395454 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
NEUROD1Q13562 RABL2B-202ENST00000395590 2380 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.07
NEUROD1Q13562 KIRREL2-203ENST00000360202 2942 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
NEUROD1Q13562 TPM3P9-201ENST00000424846 2920 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
NEUROD1Q13562 MARK4-202ENST00000300843 5209 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
NEUROD1Q13562 AC011474.4-201ENST00000623523 2076 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
NEUROD1Q13562 MAMLD1-203ENST00000370401 4854 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
NEUROD1Q13562 SAMD15-201ENST00000216471 2564 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
NEUROD1Q13562 CYP1A1-207ENST00000567032 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
NEUROD1Q13562 RUFY1-204ENST00000437570 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
NEUROD1Q13562 LDHAL6B-201ENST00000307144 1693 ntAPPRIS P1 BASIC21.7■■□□□ 1.06
NEUROD1Q13562 TPM3-205ENST00000328159 1771 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
NEUROD1Q13562 CARTPT-201ENST00000296777 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
NEUROD1Q13562 KLK11-201ENST00000319720 1198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
NEUROD1Q13562 NOL4L-202ENST00000326071 701 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
NEUROD1Q13562 PFDN5-202ENST00000334478 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
NEUROD1Q13562 SHBG-202ENST00000380450 1271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
NEUROD1Q13562 STX1A-203ENST00000395155 783 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
NEUROD1Q13562 FAM221A-203ENST00000409653 761 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
NEUROD1Q13562 FAM221A-204ENST00000409994 1136 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
NEUROD1Q13562 AC092614.1-201ENST00000419640 909 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
NEUROD1Q13562 LLPH-AS1-201ENST00000510317 623 ntTSL 4 BASIC21.7■■□□□ 1.06
NEUROD1Q13562 MIR6805-201ENST00000615055 62 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
NEUROD1Q13562 MDGA1-203ENST00000434837 10736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
NEUROD1Q13562 ACE-201ENST00000290863 2479 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
NEUROD1Q13562 PHYHD1-202ENST00000353176 1374 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
NEUROD1Q13562 PSEN2-201ENST00000366782 2465 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
NEUROD1Q13562 AC093668.2-201ENST00000481893 3569 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
NEUROD1Q13562 AC105052.1-201ENST00000519541 3569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
NEUROD1Q13562 FFAR4-202ENST00000371483 3653 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
NEUROD1Q13562 FLOT2-210ENST00000585169 2585 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
NEUROD1Q13562 SLC35G3-201ENST00000297307 2004 ntAPPRIS P1 BASIC21.7■■□□□ 1.06
NEUROD1Q13562 NAA60-203ENST00000414063 2619 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
NEUROD1Q13562 GSTCD-206ENST00000507281 2091 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
NEUROD1Q13562 ZMIZ2-202ENST00000309315 5144 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
NEUROD1Q13562 STIP1-203ENST00000358794 2743 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
NEUROD1Q13562 CYB561D2-202ENST00000418577 1533 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
NEUROD1Q13562 AL512306.2-201ENST00000444037 2219 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
NEUROD1Q13562 ZNF782-205ENST00000481138 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
NEUROD1Q13562 VPS26B-201ENST00000281187 3691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
NEUROD1Q13562 AC083964.2-201ENST00000623988 2396 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
NEUROD1Q13562 RIMS3-202ENST00000372684 7235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
NEUROD1Q13562 BIRC5-203ENST00000374948 2446 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
NEUROD1Q13562 LIG1-203ENST00000536218 3179 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
NEUROD1Q13562 AC022028.2-201ENST00000474115 2619 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
NEUROD1Q13562 TARS2-203ENST00000369054 1998 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
NEUROD1Q13562 DIP2A-201ENST00000400274 7023 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
NEUROD1Q13562 GABRA1-201ENST00000023897 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
NEUROD1Q13562 TOMM34-201ENST00000372813 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
NEUROD1Q13562 WDR54-201ENST00000348227 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
NEUROD1Q13562 SNX21-203ENST00000372541 771 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
NEUROD1Q13562 MB-205ENST00000406324 582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
NEUROD1Q13562 MCFD2-204ENST00000409207 1113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
NEUROD1Q13562 CD8B2-202ENST00000417670 633 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
NEUROD1Q13562 STAG3L2-201ENST00000426587 2130 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
NEUROD1Q13562 PRSS30P-204ENST00000489864 650 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
NEUROD1Q13562 AP001790.1-201ENST00000511947 570 ntTSL 4 BASIC21.69■■□□□ 1.06
NEUROD1Q13562 MFF-223ENST00000524634 647 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
NEUROD1Q13562 AP001453.3-201ENST00000545800 853 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
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