Protein–RNA interactions for Protein: Q13535

ATR, Serine/threonine-protein kinase ATR, humanhuman

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Length 2,644 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATRQ13535 AD000864.1-201ENST00000624076 2295 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
ATRQ13535 C2CD4C-201ENST00000332235 3129 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.32□□□□□ -0.6
ATRQ13535 SLC35G3-201ENST00000297307 2004 ntAPPRIS P1 BASIC11.32□□□□□ -0.6
ATRQ13535 BLK-205ENST00000529894 2017 ntTSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
ATRQ13535 KRT35-201ENST00000246639 1778 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
ATRQ13535 SLC1A5-201ENST00000412532 1750 ntTSL 2 BASIC11.31□□□□□ -0.6
ATRQ13535 ST3GAL2-201ENST00000342907 4450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
ATRQ13535 PAPD7-207ENST00000631941 1902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
ATRQ13535 CCL5-201ENST00000603197 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
ATRQ13535 KIR3DL2-201ENST00000270442 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
ATRQ13535 SMPDL3B-201ENST00000373888 1548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
ATRQ13535 ZNF821-203ENST00000446827 1822 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
ATRQ13535 CBSL-202ENST00000617706 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
ATRQ13535 LEF1-201ENST00000265165 3068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
ATRQ13535 NAT8B-201ENST00000377712 765 ntAPPRIS P1 BASIC11.31□□□□□ -0.6
ATRQ13535 TOMM5-203ENST00000401811 789 ntTSL 2 BASIC11.31□□□□□ -0.6
ATRQ13535 MDM1-205ENST00000430606 2170 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
ATRQ13535 EIF2B5-202ENST00000432569 984 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
ATRQ13535 ASS1P2-201ENST00000439895 1223 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
ATRQ13535 RN7SL564P-201ENST00000496309 250 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
ATRQ13535 LRRC6-205ENST00000519595 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
ATRQ13535 NKAPP1-204ENST00000555168 557 ntTSL 4 BASIC11.31□□□□□ -0.6
ATRQ13535 AC140912.1-202ENST00000561802 194 ntTSL 3 BASIC11.31□□□□□ -0.6
ATRQ13535 AC120498.7-201ENST00000562876 330 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
ATRQ13535 DUS2-207ENST00000565263 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
ATRQ13535 CBR3-AS1-210ENST00000623484 392 ntTSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
ATRQ13535 CBR3-AS1-215ENST00000624086 594 ntTSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
ATRQ13535 AL807740.1-201ENST00000636971 567 ntTSL 4 BASIC11.31□□□□□ -0.6
ATRQ13535 ST3GAL5-229ENST00000638986 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
ATRQ13535 LONRF3-201ENST00000304778 2989 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
ATRQ13535 FARP1-242ENST00000627049 5103 ntTSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
ATRQ13535 AP001122.1-202ENST00000501648 1916 ntTSL 2 BASIC11.31□□□□□ -0.6
ATRQ13535 TMEM132E-201ENST00000321639 5631 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
ATRQ13535 PODNL1-204ENST00000538517 2744 ntTSL 2 BASIC11.31□□□□□ -0.6
ATRQ13535 ADAM22-204ENST00000398204 9334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
ATRQ13535 LINC00682-202ENST00000499082 1384 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
ATRQ13535 WDR20-211ENST00000556807 2382 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
ATRQ13535 MLF1-201ENST00000355893 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
ATRQ13535 SYNGR1-203ENST00000328933 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
ATRQ13535 MAP7D1-203ENST00000373150 3238 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.31□□□□□ -0.6
ATRQ13535 ZNF281-203ENST00000367353 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
ATRQ13535 MFSD1-203ENST00000415822 2423 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
ATRQ13535 MRGPRX4-201ENST00000314254 1444 ntAPPRIS P1 BASIC11.31□□□□□ -0.6
ATRQ13535 SIRPB3P-201ENST00000340424 1216 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
ATRQ13535 SAT1-201ENST00000379251 801 ntTSL 2 BASIC11.31□□□□□ -0.6
ATRQ13535 SAT1-202ENST00000379253 909 ntTSL 2 BASIC11.31□□□□□ -0.6
ATRQ13535 SAT1-203ENST00000379254 868 ntTSL 3 BASIC11.31□□□□□ -0.6
ATRQ13535 SAT1-204ENST00000379270 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
ATRQ13535 AL663074.1-201ENST00000436642 299 ntTSL 3 BASIC11.31□□□□□ -0.6
ATRQ13535 STAG3L3-203ENST00000436857 1033 ntTSL 2 BASIC11.31□□□□□ -0.6
ATRQ13535 TSTD1-206ENST00000466967 477 ntTSL 2 BASIC11.31□□□□□ -0.6
ATRQ13535 AC025594.1-201ENST00000469533 543 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
ATRQ13535 RN7SL340P-201ENST00000470792 296 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
ATRQ13535 TBX5-AS1-202ENST00000531024 766 ntTSL 3 BASIC11.31□□□□□ -0.6
ATRQ13535 LOXL1-AS1-207ENST00000565689 735 ntTSL 3 BASIC11.31□□□□□ -0.6
ATRQ13535 Metazoa_SRP.200-201ENST00000622073 282 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
ATRQ13535 AK6-202ENST00000380822 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
ATRQ13535 INHBA-203ENST00000442711 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
ATRQ13535 YTHDF2-209ENST00000542507 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
ATRQ13535 PLEKHG3-202ENST00000394691 4397 ntTSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
ATRQ13535 CCNI2-201ENST00000378731 2355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
ATRQ13535 SDHAF2-201ENST00000301761 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
ATRQ13535 DDX5-201ENST00000225792 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
ATRQ13535 PCED1B-201ENST00000432328 1862 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.31□□□□□ -0.6
ATRQ13535 RAB5B-202ENST00000448789 1530 ntTSL 2 BASIC11.31□□□□□ -0.6
ATRQ13535 SAMD5-201ENST00000367474 6089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.31□□□□□ -0.6
ATRQ13535 KHNYN-202ENST00000553935 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
ATRQ13535 PLA2G12A-201ENST00000243501 5226 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
ATRQ13535 MVB12B-206ENST00000489637 2666 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
ATRQ13535 SREBF1-201ENST00000261646 4178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
ATRQ13535 SASH1-201ENST00000367467 7711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
ATRQ13535 MEX3C-204ENST00000616921 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
ATRQ13535 BID-213ENST00000615414 2236 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
ATRQ13535 EWSR1-222ENST00000629659 2446 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
ATRQ13535 UCN3-201ENST00000380433 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
ATRQ13535 CD79B-203ENST00000392795 1254 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
ATRQ13535 ATP6V1E1-202ENST00000399796 1208 ntTSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
ATRQ13535 SPTLC1P3-201ENST00000403408 259 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
ATRQ13535 PSAT1P2-201ENST00000426107 972 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
ATRQ13535 CBR3-AS1-202ENST00000427491 741 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
ATRQ13535 HNRNPA1P2-207ENST00000432375 960 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
ATRQ13535 RPSAP12-201ENST00000435879 888 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
ATRQ13535 B9D1-206ENST00000461069 923 ntTSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
ATRQ13535 ANO1-AS2-202ENST00000533327 498 ntTSL 3 BASIC11.3□□□□□ -0.6
ATRQ13535 AC145422.1-201ENST00000541574 544 ntTSL 3 BASIC11.3□□□□□ -0.6
ATRQ13535 TNFSF13B-206ENST00000542136 495 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
ATRQ13535 AC016582.2-202ENST00000587765 1094 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
ATRQ13535 CBR3-AS1-207ENST00000608641 777 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
ATRQ13535 ZFAS1-208ENST00000618800 597 ntTSL 3 BASIC11.3□□□□□ -0.6
ATRQ13535 AC079779.4-201ENST00000619113 548 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
ATRQ13535 Metazoa_SRP.128-201ENST00000620543 314 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
ATRQ13535 LINC01012-203ENST00000628762 743 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
ATRQ13535 LINC01029-204ENST00000583106 1465 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
ATRQ13535 COL25A1-201ENST00000399126 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
ATRQ13535 AC254629.1-202ENST00000618276 2112 ntTSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
ATRQ13535 PCCB-204ENST00000462637 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.3□□□□□ -0.6
ATRQ13535 ARL8B-208ENST00000611208 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
ATRQ13535 SLC52A1-201ENST00000254853 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
ATRQ13535 NELFA-203ENST00000411638 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
ATRQ13535 TMPRSS13-203ENST00000524993 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
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