Protein–RNA interactions for Protein: Q13296

SCGB2A2, Mammaglobin-A, humanhuman

Predictions only

Length 93 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCGB2A2Q13296 PPCDC-201ENST00000342932 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
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SCGB2A2Q13296 AIFM2-202ENST00000373248 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
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