Protein–RNA interactions for Protein: Q13033

STRN3, Striatin-3, humanhuman

Predictions only

Length 797 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STRN3Q13033 PLEKHB1-206ENST00000535129 1049 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
STRN3Q13033 CCDC86-203ENST00000545580 697 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
STRN3Q13033 ATF7-204ENST00000548118 774 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
STRN3Q13033 CD63-208ENST00000549117 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
STRN3Q13033 C15orf40-211ENST00000565712 559 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
STRN3Q13033 SLC13A5-208ENST00000573648 1723 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
STRN3Q13033 C19orf70-204ENST00000587950 655 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
STRN3Q13033 ELOF1-208ENST00000591912 899 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
STRN3Q13033 PRCD-210ENST00000592014 462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
STRN3Q13033 PTOV1-214ENST00000600603 1443 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
STRN3Q13033 TCP10-210ENST00000617120 2182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
STRN3Q13033 AL008638.5-201ENST00000623814 1298 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
STRN3Q13033 AC009093.10-201ENST00000641956 1442 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
STRN3Q13033 SNX30-201ENST00000374232 7622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
STRN3Q13033 ABCG4-205ENST00000619701 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
STRN3Q13033 AC007191.1-201ENST00000623179 2995 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
STRN3Q13033 SLCO6A1-205ENST00000506729 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
STRN3Q13033 THY1-206ENST00000528522 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
STRN3Q13033 AMT-239ENST00000636865 1914 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
STRN3Q13033 MAGEB2-201ENST00000378988 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
STRN3Q13033 AC006262.1-203ENST00000598170 1634 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
STRN3Q13033 CAMK2A-203ENST00000398376 1493 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
STRN3Q13033 ZNF711-201ENST00000276123 2887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
STRN3Q13033 LBHD1-201ENST00000354588 1320 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
STRN3Q13033 SPIN2A-201ENST00000374906 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
STRN3Q13033 TXNDC5-204ENST00000473453 1301 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
STRN3Q13033 GRN-222ENST00000639447 1314 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
STRN3Q13033 NUP98-201ENST00000324932 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
STRN3Q13033 F2RL1-201ENST00000296677 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
STRN3Q13033 TRMT2B-201ENST00000372935 2921 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
STRN3Q13033 AC015656.1-201ENST00000624209 3578 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
STRN3Q13033 CDH23-202ENST00000299366 3954 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
STRN3Q13033 KDELC2-201ENST00000323468 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
STRN3Q13033 TNFRSF10C-201ENST00000356864 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
STRN3Q13033 INSC-208ENST00000530161 1702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
STRN3Q13033 PXN-221ENST00000637617 3246 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
STRN3Q13033 ZNF485-201ENST00000361807 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
STRN3Q13033 TFAP2A-213ENST00000482890 2071 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
STRN3Q13033 PUS1-202ENST00000376649 4094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
STRN3Q13033 AC015712.6-201ENST00000431060 5068 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
STRN3Q13033 AC006504.5-208ENST00000588784 2401 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
STRN3Q13033 STIP1-207ENST00000538945 1900 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
STRN3Q13033 TSFM-207ENST00000540550 1935 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
STRN3Q13033 FLI1-205ENST00000527786 4127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
STRN3Q13033 KHSRPP1-201ENST00000427983 1768 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
STRN3Q13033 ARMCX6-207ENST00000538627 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
STRN3Q13033 STARD8-202ENST00000374597 4820 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
STRN3Q13033 BTBD11-204ENST00000420571 3478 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
STRN3Q13033 CCDC88B-201ENST00000301897 870 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
STRN3Q13033 EMC3-AS1-202ENST00000366264 559 ntTSL 4 BASIC16.14■□□□□ 0.17
STRN3Q13033 CDKN1A-202ENST00000373711 793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
STRN3Q13033 PPP1R14B-202ENST00000392210 600 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
STRN3Q13033 HNRNPA1P27-201ENST00000412087 955 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
STRN3Q13033 LIMS1-206ENST00000414829 439 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
STRN3Q13033 AL157902.1-202ENST00000425010 763 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
STRN3Q13033 AL139010.1-202ENST00000452528 1041 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
STRN3Q13033 RASA3-IT1-201ENST00000454005 380 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
STRN3Q13033 LIMS3-205ENST00000487150 782 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
STRN3Q13033 PPP1R32-205ENST00000538185 1107 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
STRN3Q13033 TUBB8-202ENST00000562809 820 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
STRN3Q13033 AL445483.1-201ENST00000568695 736 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
STRN3Q13033 MIR4783-201ENST00000580343 82 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
STRN3Q13033 NAT9-222ENST00000583476 583 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
STRN3Q13033 FBXL12-204ENST00000586469 544 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
STRN3Q13033 LINC00479-204ENST00000589300 718 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
STRN3Q13033 MRPL34-203ENST00000595444 863 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
STRN3Q13033 IGHV1OR21-1-201ENST00000622028 353 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
STRN3Q13033 PDE3B-202ENST00000455098 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
STRN3Q13033 KIF1A-201ENST00000320389 8832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
STRN3Q13033 TMEM132E-203ENST00000631683 4379 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
STRN3Q13033 PMM2-201ENST00000268261 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
STRN3Q13033 LINC00924-202ENST00000556053 2682 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
STRN3Q13033 HPGD-202ENST00000296522 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
STRN3Q13033 BRF1-211ENST00000547530 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
STRN3Q13033 STOML1-206ENST00000561656 1833 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
STRN3Q13033 PAK1-201ENST00000278568 2543 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
STRN3Q13033 CASP6-202ENST00000352981 1347 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
STRN3Q13033 CXorf40B-202ENST00000370404 1316 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
STRN3Q13033 GSDMA-203ENST00000635792 1546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
STRN3Q13033 GPSM1-202ENST00000354753 3533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
STRN3Q13033 CYLD-202ENST00000398568 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
STRN3Q13033 POU5F1-204ENST00000471529 1723 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
STRN3Q13033 SLC4A9-203ENST00000506545 2838 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
STRN3Q13033 TMTC1-207ENST00000552618 3915 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
STRN3Q13033 RANBP1-208ENST00000430524 1389 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
STRN3Q13033 KRT8P28-201ENST00000433288 1390 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
STRN3Q13033 UBXN11-202ENST00000357089 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
STRN3Q13033 RPARP-AS1-202ENST00000492465 1556 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
STRN3Q13033 RNF145-212ENST00000611185 3624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
STRN3Q13033 DLX6-202ENST00000518156 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
STRN3Q13033 SCLY-202ENST00000409736 1774 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
STRN3Q13033 FECH-202ENST00000382873 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
STRN3Q13033 NMUR1-201ENST00000305141 3298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
STRN3Q13033 TSC22D1-211ENST00000501704 4026 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
STRN3Q13033 ZNF664-202ENST00000392404 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
STRN3Q13033 CRHR2-202ENST00000348438 1600 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
STRN3Q13033 RNF170-209ENST00000534961 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
STRN3Q13033 PHF3-209ENST00000509330 2969 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
STRN3Q13033 AC114490.1-201ENST00000417456 3163 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
STRN3Q13033 CD8A-203ENST00000409511 3048 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 317 ms