Protein–RNA interactions for Protein: Q13029

PRDM2, PR domain zinc finger protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,718 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRDM2Q13029 HMOX2-201ENST00000219700 1621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
PRDM2Q13029 MSMO1-201ENST00000261507 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PRDM2Q13029 USH1C-207ENST00000527720 2278 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PRDM2Q13029 F10-201ENST00000375551 1509 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PRDM2Q13029 EFHC1-230ENST00000637263 2089 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
PRDM2Q13029 IL37-204ENST00000352179 709 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PRDM2Q13029 AL513165.1-201ENST00000413915 289 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
PRDM2Q13029 LINC01885-201ENST00000414300 609 ntTSL 4 BASIC23.92■■□□□ 1.42
PRDM2Q13029 KRT18P15-201ENST00000458108 1291 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
PRDM2Q13029 AL031705.1-201ENST00000566922 682 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
PRDM2Q13029 AL645608.7-201ENST00000607769 351 ntTSL 4 BASIC23.92■■□□□ 1.42
PRDM2Q13029 CHMP1A-202ENST00000535997 2295 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
PRDM2Q13029 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PRDM2Q13029 DMC1-207ENST00000616615 1595 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PRDM2Q13029 SLC35A3-209ENST00000638338 2890 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
PRDM2Q13029 AC093525.2-201ENST00000564543 1944 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
PRDM2Q13029 REC8-209ENST00000611366 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PRDM2Q13029 ACSM2A-202ENST00000396104 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PRDM2Q13029 TMEM143-203ENST00000435956 2272 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
PRDM2Q13029 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PRDM2Q13029 GPR45-201ENST00000258456 1307 ntAPPRIS P1 BASIC23.91■■□□□ 1.42
PRDM2Q13029 SLC12A9-AS1-201ENST00000412754 369 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
PRDM2Q13029 AL513211.1-201ENST00000429053 483 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
PRDM2Q13029 IGKV1OR-2-201ENST00000457995 350 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
PRDM2Q13029 AL162231.1-205ENST00000544078 338 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
PRDM2Q13029 ZFP1-207ENST00000567481 493 ntTSL 4 BASIC23.91■■□□□ 1.42
PRDM2Q13029 USP32P3-202ENST00000583574 611 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
PRDM2Q13029 LIMS2-206ENST00000409754 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PRDM2Q13029 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
PRDM2Q13029 ABHD16A-202ENST00000440843 1906 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
PRDM2Q13029 EPN2-210ENST00000571254 1883 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PRDM2Q13029 AC008125.1-201ENST00000548488 1538 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
PRDM2Q13029 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PRDM2Q13029 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PRDM2Q13029 JRK-211ENST00000615982 2823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PRDM2Q13029 LGALS12-204ENST00000415491 1816 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PRDM2Q13029 AC091951.1-201ENST00000512854 2465 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
PRDM2Q13029 LINC00479-201ENST00000412102 2033 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
PRDM2Q13029 ORMDL3-202ENST00000394169 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
PRDM2Q13029 FAM174B-201ENST00000327355 2792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PRDM2Q13029 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PRDM2Q13029 KDM1A-201ENST00000356634 3033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PRDM2Q13029 RFWD2-204ENST00000367669 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PRDM2Q13029 KIFC1-211ENST00000428849 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PRDM2Q13029 AC004889.1-201ENST00000498693 856 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
PRDM2Q13029 GRAMD4P6-201ENST00000556999 244 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
PRDM2Q13029 AC007610.1-201ENST00000568130 498 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
PRDM2Q13029 AC106782.5-201ENST00000616011 337 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
PRDM2Q13029 MIR8071-1-201ENST00000616769 65 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
PRDM2Q13029 MIR8071-2-201ENST00000616772 65 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
PRDM2Q13029 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
PRDM2Q13029 SNAPC2-206ENST00000597584 1413 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PRDM2Q13029 AC007603.1-201ENST00000563124 2085 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
PRDM2Q13029 FGF21-202ENST00000593756 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PRDM2Q13029 ARHGAP45-212ENST00000590577 3218 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
PRDM2Q13029 TVP23C-210ENST00000584811 2989 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PRDM2Q13029 AC068946.1-202ENST00000318673 2745 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
PRDM2Q13029 ANXA6-211ENST00000521512 1793 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
PRDM2Q13029 TMSB4X-202ENST00000380635 767 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
PRDM2Q13029 SYNGR1-204ENST00000381535 1295 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PRDM2Q13029 CD37-203ENST00000426897 1204 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
PRDM2Q13029 AC010086.2-201ENST00000428616 226 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
PRDM2Q13029 AL512288.1-201ENST00000448015 491 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
PRDM2Q13029 AC087071.1-201ENST00000469264 427 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
PRDM2Q13029 RNASEK-204ENST00000552039 591 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PRDM2Q13029 FAM192A-218ENST00000567439 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
PRDM2Q13029 IRF3-213ENST00000596765 710 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PRDM2Q13029 CCNG2-202ENST00000395640 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
PRDM2Q13029 ABTB1-206ENST00000468137 2065 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
PRDM2Q13029 AC103702.1-201ENST00000548801 2630 ntBASIC23.89■■□□□ 1.42
PRDM2Q13029 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
PRDM2Q13029 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
PRDM2Q13029 TRIM46-211ENST00000611379 3082 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
PRDM2Q13029 AL928654.2-201ENST00000551271 2279 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
PRDM2Q13029 DDX19B-213ENST00000568625 1681 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
PRDM2Q13029 GZMB-201ENST00000216341 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
PRDM2Q13029 TRPM3-205ENST00000361823 1260 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
PRDM2Q13029 AP001615.1-201ENST00000423276 461 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
PRDM2Q13029 AC147876.1-201ENST00000504408 322 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
PRDM2Q13029 FXYD6-208ENST00000529335 708 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
PRDM2Q13029 BCAT2-203ENST00000545387 1272 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
PRDM2Q13029 AC006986.1-201ENST00000612764 241 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
PRDM2Q13029 ZFAS1-208ENST00000618800 597 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
PRDM2Q13029 NAA60-203ENST00000414063 2619 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
PRDM2Q13029 CYP4X1-201ENST00000371901 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
PRDM2Q13029 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
PRDM2Q13029 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
PRDM2Q13029 TNIP1-220ENST00000610535 2726 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
PRDM2Q13029 RBBP4-204ENST00000414241 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
PRDM2Q13029 PHF10-205ENST00000612128 4395 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PRDM2Q13029 LHFPL1-201ENST00000371968 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PRDM2Q13029 ADARB1-204ENST00000389863 3563 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PRDM2Q13029 CNKSR1-214ENST00000531191 2673 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
PRDM2Q13029 REPS1-201ENST00000258062 3161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PRDM2Q13029 AIG1-203ENST00000367596 559 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
PRDM2Q13029 AC108724.1-201ENST00000481669 352 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
PRDM2Q13029 BLOC1S5-205ENST00000543936 368 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
PRDM2Q13029 AC132812.1-201ENST00000583145 892 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
PRDM2Q13029 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PRDM2Q13029 AC112484.1-201ENST00000508239 2291 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
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