Protein–RNA interactions for Protein: Q12950

FOXD4, Forkhead box protein D4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 439 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXD4Q12950 FGF7P3-202ENST00000640245 1707 ntTSL 4 BASIC14.12□□□□□ -0.15
FOXD4Q12950 SEPT6-204ENST00000360156 2609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
FOXD4Q12950 AC012508.2-201ENST00000567613 1472 ntBASIC14.12□□□□□ -0.15
FOXD4Q12950 AC007541.1-201ENST00000570282 1469 ntBASIC14.12□□□□□ -0.15
FOXD4Q12950 AC027020.2-201ENST00000602585 2389 ntBASIC14.12□□□□□ -0.15
FOXD4Q12950 PAQR3-209ENST00000512733 9811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
FOXD4Q12950 AL805961.2-201ENST00000642139 4817 ntBASIC14.12□□□□□ -0.15
FOXD4Q12950 TYK2-210ENST00000529370 3176 ntTSL 2 BASIC14.12□□□□□ -0.15
FOXD4Q12950 SEMA3F-201ENST00000002829 3802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
FOXD4Q12950 CAMKV-201ENST00000296471 2913 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
FOXD4Q12950 AC060234.2-201ENST00000428825 1610 ntTSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
FOXD4Q12950 CAMKV-215ENST00000488336 2905 ntTSL 2 BASIC14.12□□□□□ -0.15
FOXD4Q12950 SGMS1-202ENST00000361781 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
FOXD4Q12950 AL358933.1-201ENST00000565046 2830 ntBASIC14.12□□□□□ -0.15
FOXD4Q12950 TEX28-203ENST00000617225 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
FOXD4Q12950 ACRBP-201ENST00000229243 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
FOXD4Q12950 BBS1-225ENST00000630659 1934 ntTSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
FOXD4Q12950 AC017083.4-201ENST00000406334 2306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.12□□□□□ -0.15
FOXD4Q12950 ZNF663P-201ENST00000400371 2722 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
FOXD4Q12950 DAB2IP-202ENST00000309989 3500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
FOXD4Q12950 ZNF747-202ENST00000395094 3504 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
FOXD4Q12950 NOP14-203ENST00000416614 3538 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
FOXD4Q12950 OR10AC1-201ENST00000439431 2898 ntAPPRIS P1 BASIC14.12□□□□□ -0.15
FOXD4Q12950 MBD4-201ENST00000249910 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
FOXD4Q12950 OLA1-202ENST00000344357 1656 ntTSL 2 BASIC14.12□□□□□ -0.15
FOXD4Q12950 G6PD-203ENST00000393564 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
FOXD4Q12950 NDUFS8-201ENST00000313468 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
FOXD4Q12950 UBE2G2-201ENST00000330942 721 ntTSL 3 BASIC14.12□□□□□ -0.15
FOXD4Q12950 PSMB9-207ENST00000374859 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
FOXD4Q12950 MIR658-201ENST00000385210 100 ntBASIC14.12□□□□□ -0.15
FOXD4Q12950 PSMB9-208ENST00000395330 792 ntTSL 3 BASIC14.12□□□□□ -0.15
FOXD4Q12950 ATP5J-205ENST00000400094 589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.12□□□□□ -0.15
FOXD4Q12950 GHSR-202ENST00000427970 912 ntBASIC14.12□□□□□ -0.15
FOXD4Q12950 INE1-201ENST00000456273 945 ntBASIC14.12□□□□□ -0.15
FOXD4Q12950 AC092658.1-201ENST00000505836 891 ntBASIC14.12□□□□□ -0.15
FOXD4Q12950 AP002008.1-201ENST00000530283 1155 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
FOXD4Q12950 AC008969.1-205ENST00000553254 876 ntTSL 2 BASIC14.12□□□□□ -0.15
FOXD4Q12950 AC016727.1-204ENST00000578974 420 ntTSL 3 BASIC14.12□□□□□ -0.15
FOXD4Q12950 AC243964.2-202ENST00000591312 752 ntTSL 2 BASIC14.12□□□□□ -0.15
FOXD4Q12950 AL138828.2-201ENST00000615812 383 ntBASIC14.12□□□□□ -0.15
FOXD4Q12950 AL162274.1-201ENST00000617191 1098 ntBASIC14.12□□□□□ -0.15
FOXD4Q12950 HOTAIRM1_1.1-201ENST00000622675 125 ntBASIC14.12□□□□□ -0.15
FOXD4Q12950 SEZ6L-206ENST00000404234 3444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
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FOXD4Q12950 STIM1-201ENST00000300737 4038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
FOXD4Q12950 POLG2-201ENST00000539111 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
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FOXD4Q12950 RBM6-201ENST00000266022 3750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
FOXD4Q12950 OSBPL7-211ENST00000613735 2836 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
FOXD4Q12950 GMEB2-203ENST00000370077 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
FOXD4Q12950 TNN-202ENST00000621086 4234 ntTSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
FOXD4Q12950 SLC35G3-201ENST00000297307 2004 ntAPPRIS P1 BASIC14.12□□□□□ -0.15
FOXD4Q12950 CACNA1G-211ENST00000503485 6768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
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FOXD4Q12950 KIAA0895-203ENST00000338533 4132 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
FOXD4Q12950 ASPH-214ENST00000519234 2874 ntTSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
FOXD4Q12950 LINC00163-201ENST00000434081 2155 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
FOXD4Q12950 SUN2-201ENST00000405018 4022 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
FOXD4Q12950 NR1H3-211ENST00000441012 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
FOXD4Q12950 CTSD-207ENST00000636571 1790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
FOXD4Q12950 SLC39A9-209ENST00000556605 2065 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
FOXD4Q12950 NHSL1-204ENST00000427025 7500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
FOXD4Q12950 RAB11FIP1-202ENST00000330843 7811 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
FOXD4Q12950 BTRC-202ENST00000370187 6134 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
FOXD4Q12950 CXorf36-201ENST00000377934 2513 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
FOXD4Q12950 TLR6-202ENST00000436693 5880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
FOXD4Q12950 MOG-215ENST00000376888 1529 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
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FOXD4Q12950 C9orf106-201ENST00000316786 3145 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
FOXD4Q12950 UBE2I-204ENST00000397515 3109 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.11□□□□□ -0.15
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FOXD4Q12950 PDE4A-209ENST00000592685 2707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
FOXD4Q12950 LINC02395-201ENST00000546821 3157 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
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FOXD4Q12950 PKIG-202ENST00000372886 1180 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.11□□□□□ -0.15
FOXD4Q12950 YTHDF2-201ENST00000373812 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
FOXD4Q12950 C11orf88-202ENST00000375618 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
FOXD4Q12950 YBEY-203ENST00000397691 764 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.11□□□□□ -0.15
FOXD4Q12950 EFHD1-202ENST00000409613 1156 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
FOXD4Q12950 TMEM247-204ENST00000434431 680 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
FOXD4Q12950 RN7SL618P-201ENST00000477850 296 ntBASIC14.11□□□□□ -0.15
FOXD4Q12950 TRAK1-208ENST00000484786 2008 ntTSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
FOXD4Q12950 C8orf88-201ENST00000517562 894 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.11□□□□□ -0.15
FOXD4Q12950 CNOT8-210ENST00000519404 945 ntTSL 2 BASIC14.11□□□□□ -0.15
FOXD4Q12950 CNOT8-214ENST00000520671 923 ntTSL 2 BASIC14.11□□□□□ -0.15
FOXD4Q12950 CNOT8-218ENST00000521583 1151 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
FOXD4Q12950 AP006621.2-201ENST00000533938 284 ntTSL 3 BASIC14.11□□□□□ -0.15
FOXD4Q12950 CD2BP2-203ENST00000569466 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
FOXD4Q12950 TBCB-211ENST00000589996 724 ntTSL 3 BASIC14.11□□□□□ -0.15
FOXD4Q12950 EI24-214ENST00000620753 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
FOXD4Q12950 ALDH1A3-202ENST00000346623 3104 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
FOXD4Q12950 SPOCK3-201ENST00000357154 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
FOXD4Q12950 ALOX15-201ENST00000293761 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
FOXD4Q12950 PIGT-202ENST00000279036 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
FOXD4Q12950 SCFD2-201ENST00000388940 2221 ntTSL 2 BASIC14.11□□□□□ -0.15
FOXD4Q12950 LRRC32-201ENST00000260061 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
FOXD4Q12950 USP37-202ENST00000338465 1771 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
FOXD4Q12950 Z97205.2-201ENST00000564697 1639 ntBASIC14.11□□□□□ -0.15
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