Protein–RNA interactions for Protein: Q09428

ABCC8, ATP-binding cassette sub-family C member 8, humanhuman

Predictions only

Length 1,581 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCC8Q09428 PGAM2-201ENST00000297283 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
ABCC8Q09428 SUMO4-201ENST00000326669 1066 ntAPPRIS P1 BASIC24.29■■□□□ 1.48
ABCC8Q09428 SFT2D2-202ENST00000367829 491 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
ABCC8Q09428 IGHV5-51-201ENST00000390626 410 ntAPPRIS P1 BASIC24.29■■□□□ 1.48
ABCC8Q09428 AC004522.1-201ENST00000419978 654 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
ABCC8Q09428 KRT18P4-201ENST00000422599 1288 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
ABCC8Q09428 CCDC12-202ENST00000425441 1097 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
ABCC8Q09428 TAGLN3-203ENST00000455401 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
ABCC8Q09428 AC087269.1-202ENST00000519147 400 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
ABCC8Q09428 KRT18P37-201ENST00000520711 1282 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
ABCC8Q09428 AC136601.1-201ENST00000521803 666 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
ABCC8Q09428 KNOP1P1-201ENST00000542108 989 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
ABCC8Q09428 AC018846.1-201ENST00000568231 183 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
ABCC8Q09428 NAV1-210ENST00000593583 726 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
ABCC8Q09428 TMEM9-203ENST00000367333 1564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
ABCC8Q09428 ZDHHC6-201ENST00000369404 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
ABCC8Q09428 PRIMPOL-211ENST00000515774 2007 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
ABCC8Q09428 CCNI2-204ENST00000614847 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
ABCC8Q09428 HSPA12B-201ENST00000254963 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
ABCC8Q09428 NDRG1-202ENST00000414097 3755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
ABCC8Q09428 ANXA6-211ENST00000521512 1793 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
ABCC8Q09428 DSCAM-AS1-202ENST00000427451 1640 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
ABCC8Q09428 ISCA2-204ENST00000556816 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
ABCC8Q09428 ZNF586-203ENST00000396154 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
ABCC8Q09428 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
ABCC8Q09428 CHRNA1-204ENST00000409323 1585 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
ABCC8Q09428 SEC13-202ENST00000350697 1425 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
ABCC8Q09428 ZNF575-202ENST00000458714 2285 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
ABCC8Q09428 ZNF614-202ENST00000356322 1293 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
ABCC8Q09428 TRAPPC3-201ENST00000373159 590 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
ABCC8Q09428 RPL3P2-204ENST00000413027 1203 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
ABCC8Q09428 BX679664.3-201ENST00000414070 555 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
ABCC8Q09428 PSAT1P2-201ENST00000426107 972 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
ABCC8Q09428 GRPEL2P1-201ENST00000453145 339 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
ABCC8Q09428 AC113935.1-201ENST00000471722 555 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
ABCC8Q09428 ANO3-205ENST00000531646 1264 ntTSL 4 BASIC24.29■■□□□ 1.48
ABCC8Q09428 DLK1-205ENST00000556051 469 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
ABCC8Q09428 LOXL1-AS1-207ENST00000565689 735 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
ABCC8Q09428 AC073578.2-201ENST00000618927 464 ntTSL 4 BASIC24.29■■□□□ 1.48
ABCC8Q09428 FOXP3-203ENST00000376207 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
ABCC8Q09428 BRF1-205ENST00000440513 2368 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
ABCC8Q09428 SVOPL-203ENST00000421622 1653 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
ABCC8Q09428 FOXE1-201ENST00000375123 3462 ntAPPRIS P1 BASIC24.28■■□□□ 1.48
ABCC8Q09428 ESPN-216ENST00000636330 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
ABCC8Q09428 TCP10-202ENST00000397829 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
ABCC8Q09428 UBASH3A-203ENST00000398367 1733 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
ABCC8Q09428 BIN3-202ENST00000399977 1340 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
ABCC8Q09428 LAMP5-202ENST00000427562 1309 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
ABCC8Q09428 LAT2-202ENST00000344995 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
ABCC8Q09428 FGD5P1-202ENST00000614866 2498 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
ABCC8Q09428 OGFOD2-202ENST00000397389 2308 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
ABCC8Q09428 PSMG2-201ENST00000317615 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
ABCC8Q09428 TSFM-207ENST00000540550 1935 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
ABCC8Q09428 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
ABCC8Q09428 BEAN1-201ENST00000299694 2160 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
ABCC8Q09428 KCNK18-201ENST00000334549 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
ABCC8Q09428 BCAS2-201ENST00000369541 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
ABCC8Q09428 COPS7B-204ENST00000409091 806 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
ABCC8Q09428 AC006372.2-201ENST00000433660 292 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
ABCC8Q09428 C21orf62-204ENST00000490358 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
ABCC8Q09428 AL021707.6-201ENST00000609212 491 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
ABCC8Q09428 ADAMTS9-AS1-216ENST00000626280 882 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
ABCC8Q09428 IL18BP-205ENST00000393705 1549 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
ABCC8Q09428 UBE2A-202ENST00000371558 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
ABCC8Q09428 TADA3-204ENST00000440161 1617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
ABCC8Q09428 CDCP2-201ENST00000371330 2723 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
ABCC8Q09428 RPN2-202ENST00000373622 2348 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
ABCC8Q09428 CTTN-202ENST00000346329 3272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ABCC8Q09428 FAM227B-212ENST00000561064 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ABCC8Q09428 CBL-204ENST00000634840 4813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
ABCC8Q09428 PDE1C-201ENST00000321453 2898 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
ABCC8Q09428 AC009053.1-204ENST00000429810 2355 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
ABCC8Q09428 JADE2-201ENST00000282605 2748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
ABCC8Q09428 FGR-203ENST00000374005 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ABCC8Q09428 LZTS3-202ENST00000337576 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
ABCC8Q09428 TPD52L2-205ENST00000352482 2339 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ABCC8Q09428 TPD52L2-210ENST00000615907 2310 ntTSL 4 BASIC24.27■■□□□ 1.48
ABCC8Q09428 SULT1A1-201ENST00000314752 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ABCC8Q09428 HNRNPA1-201ENST00000330752 1294 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
ABCC8Q09428 CD300LG-203ENST00000377203 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
ABCC8Q09428 VCX3A-202ENST00000398729 808 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
ABCC8Q09428 UBE2I-206ENST00000403747 1217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
ABCC8Q09428 LINC01523-201ENST00000425385 450 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
ABCC8Q09428 LINC00892-203ENST00000454385 686 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
ABCC8Q09428 AC128689.1-202ENST00000459861 827 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
ABCC8Q09428 AC005740.1-201ENST00000515639 522 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
ABCC8Q09428 ORAOV1-205ENST00000535657 709 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
ABCC8Q09428 SELENOW-212ENST00000601048 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ABCC8Q09428 OSMR-AS1-204ENST00000636516 850 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
ABCC8Q09428 SURF4-209ENST00000618229 3200 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
ABCC8Q09428 HIF3A-206ENST00000472815 1709 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
ABCC8Q09428 MSANTD2P1-201ENST00000445341 1368 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
ABCC8Q09428 TRPC3-202ENST00000379645 3548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ABCC8Q09428 PAIP2-201ENST00000265192 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ABCC8Q09428 ARMCX6-208ENST00000539247 1928 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.27■■□□□ 1.48
ABCC8Q09428 TNFSF13-202ENST00000349228 2036 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ABCC8Q09428 NFE2L3-201ENST00000056233 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ABCC8Q09428 NUDT16P1-202ENST00000499077 2208 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
ABCC8Q09428 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ABCC8Q09428 SLC26A11-202ENST00000411502 2872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.5 ms