Protein–RNA interactions for Protein: Q06546

GABPA, GA-binding protein alpha chain, humanhuman

Predictions only

Length 454 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABPAQ06546 SBSPON-201ENST00000297354 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
GABPAQ06546 CES1-202ENST00000361503 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
GABPAQ06546 CDH7-203ENST00000536984 3766 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
GABPAQ06546 LAP3P2-201ENST00000454686 1454 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
GABPAQ06546 ZBTB17-201ENST00000375733 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
GABPAQ06546 UBAP1-201ENST00000297661 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
GABPAQ06546 C4B-AS1-205ENST00000415626 2095 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
GABPAQ06546 C4A-AS1-204ENST00000458633 2095 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
GABPAQ06546 LAT2-202ENST00000344995 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
GABPAQ06546 SPRY4-202ENST00000434127 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
GABPAQ06546 STK40-204ENST00000373132 3621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
GABPAQ06546 RALGAPA1-203ENST00000389698 7864 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
GABPAQ06546 ARHGAP9-201ENST00000393791 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
GABPAQ06546 RUSC1-205ENST00000368354 3114 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
GABPAQ06546 PRICKLE3-204ENST00000453382 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
GABPAQ06546 AC082651.3-201ENST00000474667 1947 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
GABPAQ06546 ATL3-203ENST00000538786 1920 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
GABPAQ06546 MAD1L1-202ENST00000399654 2762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
GABPAQ06546 AMHR2-201ENST00000257863 1863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
GABPAQ06546 RASSF3-202ENST00000336061 1030 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
GABPAQ06546 IGHV3-48-201ENST00000390624 432 ntAPPRIS P1 BASIC17.04■□□□□ 0.32
GABPAQ06546 HSPB7-203ENST00000406363 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
GABPAQ06546 AC060234.1-201ENST00000422966 474 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
GABPAQ06546 LINC01088-201ENST00000437737 973 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
GABPAQ06546 TAC3-208ENST00000441881 731 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
GABPAQ06546 NAGK-204ENST00000443872 878 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
GABPAQ06546 AP000358.1-201ENST00000456260 156 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
GABPAQ06546 AC078852.2-201ENST00000504748 527 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
GABPAQ06546 CD164-210ENST00000512821 964 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
GABPAQ06546 AC022447.6-201ENST00000515522 438 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
GABPAQ06546 AC138230.1-201ENST00000525893 664 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
GABPAQ06546 SIRT3-210ENST00000529382 1225 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
GABPAQ06546 PPFIBP1-204ENST00000535047 875 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
GABPAQ06546 AP001160.1-201ENST00000535817 565 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
GABPAQ06546 AC025154.2-201ENST00000550530 445 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
GABPAQ06546 AC099811.3-201ENST00000586351 425 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
GABPAQ06546 AC021016.3-201ENST00000608367 477 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
GABPAQ06546 AC073352.2-201ENST00000609385 439 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
GABPAQ06546 TAC3-211ENST00000615887 1120 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
GABPAQ06546 CMC2-224ENST00000630396 481 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
GABPAQ06546 AC009053.1-204ENST00000429810 2355 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
GABPAQ06546 LDLR-202ENST00000455727 2333 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
GABPAQ06546 FAH-201ENST00000261755 1471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
GABPAQ06546 MTA2-201ENST00000278823 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
GABPAQ06546 LANCL3-201ENST00000378619 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
GABPAQ06546 MAPK7-203ENST00000395602 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
GABPAQ06546 INPPL1-207ENST00000538751 4656 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
GABPAQ06546 SH3BP2-207ENST00000503393 9158 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
GABPAQ06546 UBAC2-202ENST00000376440 2525 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
GABPAQ06546 SEMA4B-202ENST00000411539 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
GABPAQ06546 MOGAT2-201ENST00000198801 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
GABPAQ06546 GMIP-204ENST00000587238 2987 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
GABPAQ06546 TCP10-210ENST00000617120 2182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
GABPAQ06546 NBEA-208ENST00000629018 10791 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
GABPAQ06546 NUDT16-203ENST00000537561 5943 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
GABPAQ06546 CC2D1B-202ENST00000371586 5642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
GABPAQ06546 PIDD1-202ENST00000411829 2886 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
GABPAQ06546 NCOA6-206ENST00000612493 4082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
GABPAQ06546 PDE8B-202ENST00000333194 2572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
GABPAQ06546 ELF2-204ENST00000394235 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
GABPAQ06546 ALDOA-209ENST00000563060 1550 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
GABPAQ06546 COLCA2-202ENST00000526216 1332 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
GABPAQ06546 AC064801.2-201ENST00000625052 1303 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
GABPAQ06546 GTF3C4-201ENST00000372146 9043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
GABPAQ06546 LACTB2-201ENST00000276590 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
GABPAQ06546 TMEM256-201ENST00000302422 486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
GABPAQ06546 IGHV3-21-201ENST00000390607 430 ntAPPRIS P1 BASIC17.03■□□□□ 0.32
GABPAQ06546 PCBP3-201ENST00000400304 1086 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
GABPAQ06546 SLC13A3-205ENST00000417157 876 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
GABPAQ06546 AC098934.1-204ENST00000430114 631 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
GABPAQ06546 GDAP1-202ENST00000434412 1228 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
GABPAQ06546 BX276092.5-201ENST00000439926 886 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
GABPAQ06546 PCBP3-208ENST00000449640 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
GABPAQ06546 MYL7-209ENST00000458240 791 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
GABPAQ06546 RN7SL277P-201ENST00000481521 288 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
GABPAQ06546 PGAP2-224ENST00000490830 810 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
GABPAQ06546 AC009487.3-201ENST00000505579 560 ntTSL 4 BASIC17.03■□□□□ 0.32
GABPAQ06546 LINC01598-205ENST00000508763 719 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
GABPAQ06546 PARP8-218ENST00000513738 596 ntTSL 4 BASIC17.03■□□□□ 0.32
GABPAQ06546 AC114947.1-202ENST00000514136 344 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
GABPAQ06546 SNHG21-204ENST00000559366 674 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
GABPAQ06546 NAT9-224ENST00000583757 583 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
GABPAQ06546 WDR7-208ENST00000589935 544 ntTSL 4 BASIC17.03■□□□□ 0.32
GABPAQ06546 PGPEP1-206ENST00000597431 545 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
GABPAQ06546 AC103810.10-201ENST00000606504 343 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
GABPAQ06546 YRDCP1-201ENST00000621419 643 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
GABPAQ06546 UBASH3A-203ENST00000398367 1733 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
GABPAQ06546 GNAI2-201ENST00000266027 2169 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
GABPAQ06546 ZMIZ2-202ENST00000309315 5144 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
GABPAQ06546 GNE-202ENST00000396594 5298 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
GABPAQ06546 OPA1-208ENST00000392438 6340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
GABPAQ06546 SPIRE1-201ENST00000309836 1877 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
GABPAQ06546 SUGP2-202ENST00000337018 3640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
GABPAQ06546 CPA5-201ENST00000393213 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
GABPAQ06546 FGR-203ENST00000374005 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
GABPAQ06546 UROC1-202ENST00000383579 2735 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
GABPAQ06546 UBE3C-202ENST00000389103 1626 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
GABPAQ06546 TMEM144-209ENST00000509278 1633 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
GABPAQ06546 TAF12-201ENST00000263974 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
GABPAQ06546 ZNF84-202ENST00000392319 7020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 76.4 ms