Protein–RNA interactions for Protein: Q05209

PTPN12, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 12, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 780 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN12Q05209 SLC29A4-203ENST00000406453 2734 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
PTPN12Q05209 TOB1-AS1-201ENST00000416263 1351 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
PTPN12Q05209 LIMS2-209ENST00000410038 1695 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
PTPN12Q05209 OR3A2-205ENST00000641164 2033 ntAPPRIS P1 BASIC17.89■□□□□ 0.46
PTPN12Q05209 SH3RF1-201ENST00000284637 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
PTPN12Q05209 ARVCF-202ENST00000401994 2700 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
PTPN12Q05209 AC005912.2-201ENST00000619492 2400 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
PTPN12Q05209 PHF12-205ENST00000577226 7679 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
PTPN12Q05209 GCKR-201ENST00000264717 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
PTPN12Q05209 CDKL3-206ENST00000521118 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
PTPN12Q05209 AGPAT3-218ENST00000546158 2199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
PTPN12Q05209 RNA5SP359-201ENST00000364838 113 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
PTPN12Q05209 SDHAF4-201ENST00000370474 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
PTPN12Q05209 SYNGR1-204ENST00000381535 1295 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
PTPN12Q05209 LINC00686-201ENST00000435412 332 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
PTPN12Q05209 HVCN1-203ENST00000439744 1215 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
PTPN12Q05209 SRSF10-211ENST00000484146 1089 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
PTPN12Q05209 AP001547.1-201ENST00000527440 374 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
PTPN12Q05209 REC114-202ENST00000560581 833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
PTPN12Q05209 AC011498.6-201ENST00000592034 510 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
PTPN12Q05209 LINC00116-203ENST00000611969 441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
PTPN12Q05209 NDUFB5-216ENST00000611971 951 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
PTPN12Q05209 MBD3L2B-201ENST00000636986 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
PTPN12Q05209 CDC42EP4-202ENST00000439510 2879 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
PTPN12Q05209 CD1E-206ENST00000368161 1689 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
PTPN12Q05209 KDM4B-203ENST00000536461 5027 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
PTPN12Q05209 ELF2-202ENST00000379549 3005 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
PTPN12Q05209 RPUSD2-201ENST00000315616 2358 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
PTPN12Q05209 TNFRSF10A-201ENST00000221132 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
PTPN12Q05209 CBX6-201ENST00000216083 3191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
PTPN12Q05209 TBC1D2-203ENST00000375064 3174 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
PTPN12Q05209 SVOPL-201ENST00000288513 1413 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
PTPN12Q05209 CBX6-202ENST00000407418 6122 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
PTPN12Q05209 CDCA7-202ENST00000347703 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
PTPN12Q05209 JAK3-201ENST00000458235 5432 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
PTPN12Q05209 BACE1-201ENST00000313005 6326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PTPN12Q05209 PRSS8-201ENST00000317508 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PTPN12Q05209 DLGAP4-205ENST00000401952 4881 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
PTPN12Q05209 GMPR2-204ENST00000420554 1864 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PTPN12Q05209 GMPR2-223ENST00000559836 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PTPN12Q05209 WNK1-206ENST00000535572 9886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PTPN12Q05209 OARD1-203ENST00000463088 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
PTPN12Q05209 AC082651.3-201ENST00000474667 1947 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
PTPN12Q05209 LINC00680-205ENST00000450081 1593 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PTPN12Q05209 ASCC2-201ENST00000307790 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PTPN12Q05209 VIPAS39-202ENST00000343765 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PTPN12Q05209 GRK6-203ENST00000393576 2792 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
PTPN12Q05209 GDF6-201ENST00000287020 3701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PTPN12Q05209 TNNT2-206ENST00000367320 1007 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PTPN12Q05209 AC093151.3-202ENST00000445073 709 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
PTPN12Q05209 Z82198.1-201ENST00000447396 437 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
PTPN12Q05209 LINC02046-201ENST00000469812 378 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
PTPN12Q05209 UBE3B-206ENST00000536398 1120 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PTPN12Q05209 LINC01475-201ENST00000548010 766 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PTPN12Q05209 AC021016.3-201ENST00000608367 477 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
PTPN12Q05209 AL022334.2-201ENST00000610000 484 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
PTPN12Q05209 NR2F2-AS1-215ENST00000620029 1223 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
PTPN12Q05209 AL591471.1-201ENST00000621855 229 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
PTPN12Q05209 FRMPD2B-201ENST00000431305 1347 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
PTPN12Q05209 AC093520.1-201ENST00000567545 1767 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
PTPN12Q05209 TERF1-201ENST00000276602 3268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PTPN12Q05209 BPI-201ENST00000262865 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PTPN12Q05209 KNSTRN-202ENST00000416151 1899 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
PTPN12Q05209 GATB-201ENST00000263985 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PTPN12Q05209 PIGC-201ENST00000344529 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PTPN12Q05209 SLC9A6-203ENST00000370701 4755 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PTPN12Q05209 AL928970.1-201ENST00000422679 2923 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
PTPN12Q05209 NDOR1-202ENST00000371521 2497 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PTPN12Q05209 POLL-204ENST00000370168 1536 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PTPN12Q05209 AC008125.1-201ENST00000548488 1538 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
PTPN12Q05209 METTL17-221ENST00000556670 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PTPN12Q05209 IMPDH1-203ENST00000354269 2580 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PTPN12Q05209 IQCE-201ENST00000325979 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PTPN12Q05209 AGPAT1-205ENST00000395497 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PTPN12Q05209 FAM184B-201ENST00000265018 6622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PTPN12Q05209 NCOA1-205ENST00000406961 7289 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PTPN12Q05209 MAPKAP1-201ENST00000265960 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PTPN12Q05209 MAGEA1-201ENST00000356661 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PTPN12Q05209 C1orf159-202ENST00000379320 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PTPN12Q05209 F2RL1-201ENST00000296677 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PTPN12Q05209 AC021683.1-201ENST00000585798 1767 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PTPN12Q05209 FAM219A-206ENST00000379087 3573 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PTPN12Q05209 ACBD5-202ENST00000375897 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PTPN12Q05209 KIAA0513-207ENST00000567328 1873 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PTPN12Q05209 TMPRSS6-204ENST00000406856 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PTPN12Q05209 DKK4-201ENST00000220812 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PTPN12Q05209 ESD-202ENST00000378720 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PTPN12Q05209 AL590617.2-201ENST00000432673 917 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PTPN12Q05209 PPP2R1A-209ENST00000477989 444 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PTPN12Q05209 RHEB-207ENST00000496004 744 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PTPN12Q05209 AC011825.3-201ENST00000583184 565 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PTPN12Q05209 AL031665.1-201ENST00000619766 572 ntTSL 4 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PTPN12Q05209 CCNH-201ENST00000256897 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PTPN12Q05209 MBD1-224ENST00000591416 4905 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PTPN12Q05209 PROSER3-202ENST00000396908 2149 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PTPN12Q05209 PRG2-201ENST00000311862 1424 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PTPN12Q05209 MRGPRX4-201ENST00000314254 1444 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PTPN12Q05209 BTBD8-201ENST00000342818 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PTPN12Q05209 FETUB-207ENST00000450521 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PTPN12Q05209 TAS1R1-201ENST00000333172 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.3 ms