Protein–RNA interactions for Protein: Q00587

CDC42EP1, Cdc42 effector protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 391 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDC42EP1Q00587 CALCA-203ENST00000396372 581 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CDC42EP1Q00587 TMEM243-202ENST00000423734 601 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CDC42EP1Q00587 AC022447.6-201ENST00000515522 438 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
CDC42EP1Q00587 SIRT3-210ENST00000529382 1225 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CDC42EP1Q00587 NEU3-205ENST00000531619 582 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CDC42EP1Q00587 AC099811.3-201ENST00000586351 425 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CDC42EP1Q00587 TMEM205-210ENST00000588560 840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CDC42EP1Q00587 IMPA2-207ENST00000588927 787 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CDC42EP1Q00587 SRD5A3-AS1-211ENST00000599135 737 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CDC42EP1Q00587 SIGLEC18P-201ENST00000602271 909 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
CDC42EP1Q00587 LINC00923-205ENST00000615399 932 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CDC42EP1Q00587 AC009560.1-201ENST00000620208 434 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
CDC42EP1Q00587 CNOT7-213ENST00000628418 432 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CDC42EP1Q00587 MBD3L2B-201ENST00000636986 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CDC42EP1Q00587 CNGB1-201ENST00000251102 5641 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CDC42EP1Q00587 SNPH-203ENST00000614659 5354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CDC42EP1Q00587 BICD2-202ENST00000375512 4636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CDC42EP1Q00587 TOMM34-201ENST00000372813 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CDC42EP1Q00587 DBF4-201ENST00000265728 3907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CDC42EP1Q00587 GHDC-207ENST00000587427 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CDC42EP1Q00587 BNIP1-201ENST00000231668 1339 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CDC42EP1Q00587 SYBU-209ENST00000446070 2919 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CDC42EP1Q00587 GRAP-201ENST00000284154 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CDC42EP1Q00587 MVB12B-206ENST00000489637 2666 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CDC42EP1Q00587 LGALS8-203ENST00000341872 2437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CDC42EP1Q00587 AC006262.1-203ENST00000598170 1634 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CDC42EP1Q00587 TAF12-201ENST00000263974 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CDC42EP1Q00587 C19orf54-201ENST00000378313 2753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CDC42EP1Q00587 C3orf62-201ENST00000343010 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CDC42EP1Q00587 ENDOV-204ENST00000518137 2815 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CDC42EP1Q00587 CCAR2-202ENST00000389279 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CDC42EP1Q00587 SLC29A1-204ENST00000371731 2258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CDC42EP1Q00587 MRGPRX4-201ENST00000314254 1444 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CDC42EP1Q00587 ECHDC1-220ENST00000528402 1449 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CDC42EP1Q00587 SLC26A11-202ENST00000411502 2872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CDC42EP1Q00587 PTBP1-204ENST00000394601 3185 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CDC42EP1Q00587 NAXD-202ENST00000424185 2311 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CDC42EP1Q00587 PYGM-202ENST00000377432 2611 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CDC42EP1Q00587 AC007603.1-201ENST00000563124 2085 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CDC42EP1Q00587 SPAG6-201ENST00000313311 2421 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CDC42EP1Q00587 AVL9-201ENST00000318709 6982 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CDC42EP1Q00587 AL353803.2-201ENST00000436510 1846 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CDC42EP1Q00587 MPI-203ENST00000535694 1523 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CDC42EP1Q00587 TIGD4-201ENST00000304337 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CDC42EP1Q00587 UBTF-201ENST00000302904 4997 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CDC42EP1Q00587 ALK-201ENST00000389048 6220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CDC42EP1Q00587 ARHGAP39-201ENST00000276826 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CDC42EP1Q00587 CBX3-202ENST00000396386 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CDC42EP1Q00587 GJB1-203ENST00000374029 1587 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CDC42EP1Q00587 ZNF559-202ENST00000393883 5095 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CDC42EP1Q00587 SLC35C2-204ENST00000372230 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CDC42EP1Q00587 UBL4A-201ENST00000369653 711 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CDC42EP1Q00587 CITED1-202ENST00000373619 886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CDC42EP1Q00587 OR2K2-202ENST00000374428 1038 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
CDC42EP1Q00587 MIR557-201ENST00000385239 98 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
CDC42EP1Q00587 HCFC1-AS1-201ENST00000438219 350 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CDC42EP1Q00587 AC093151.3-202ENST00000445073 709 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CDC42EP1Q00587 HOXB-AS3-206ENST00000474040 741 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CDC42EP1Q00587 UPK1B-205ENST00000497685 981 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CDC42EP1Q00587 AL049833.2-202ENST00000556773 626 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CDC42EP1Q00587 SNHG21-204ENST00000559366 674 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CDC42EP1Q00587 AC129507.4-201ENST00000570501 411 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CDC42EP1Q00587 MIR3677-201ENST00000578964 60 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
CDC42EP1Q00587 AC008763.1-201ENST00000601797 843 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CDC42EP1Q00587 CNN1-201ENST00000252456 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CDC42EP1Q00587 ZNF683-201ENST00000349618 1610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CDC42EP1Q00587 CBS-204ENST00000398165 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CDC42EP1Q00587 ISCA2-204ENST00000556816 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CDC42EP1Q00587 PCSK5-205ENST00000545128 9538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CDC42EP1Q00587 CACNB3-201ENST00000301050 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CDC42EP1Q00587 INO80-201ENST00000361937 6439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CDC42EP1Q00587 UBXN2B-201ENST00000399598 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CDC42EP1Q00587 ALDH1A2-201ENST00000249750 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CDC42EP1Q00587 MEF2D-201ENST00000348159 5965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CDC42EP1Q00587 ANKRD50-202ENST00000515641 4212 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CDC42EP1Q00587 MKRN2-201ENST00000170447 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CDC42EP1Q00587 CPEB1-211ENST00000615198 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CDC42EP1Q00587 LRIF1-202ENST00000485275 1796 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CDC42EP1Q00587 FBXL7-203ENST00000510662 1758 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CDC42EP1Q00587 AC021683.1-201ENST00000585798 1767 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CDC42EP1Q00587 NR4A3-201ENST00000330847 4982 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CDC42EP1Q00587 C1orf228-218ENST00000458657 1818 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CDC42EP1Q00587 GDAP1L1-207ENST00000612599 2585 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CDC42EP1Q00587 ERG-207ENST00000398919 1868 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CDC42EP1Q00587 KIAA1211-206ENST00000541073 4117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CDC42EP1Q00587 THBS2-206ENST00000617924 5280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CDC42EP1Q00587 TICAM2-201ENST00000427199 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CDC42EP1Q00587 ZNF557-201ENST00000252840 2268 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CDC42EP1Q00587 DUS2-201ENST00000358896 1933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CDC42EP1Q00587 DIXDC1-201ENST00000440460 5897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CDC42EP1Q00587 MYCBPAP-201ENST00000323776 3186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CDC42EP1Q00587 CLCN2-202ENST00000344937 3187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CDC42EP1Q00587 SLC39A8-202ENST00000394833 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CDC42EP1Q00587 ELMSAN1-201ENST00000286523 8091 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CDC42EP1Q00587 MFSD13A-201ENST00000238936 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CDC42EP1Q00587 DEFB123-201ENST00000376309 467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CDC42EP1Q00587 GSG1L-201ENST00000380897 1173 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CDC42EP1Q00587 AL583805.1-201ENST00000391389 531 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
CDC42EP1Q00587 GGCT-203ENST00000409144 836 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CDC42EP1Q00587 Z82214.1-201ENST00000419643 988 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.4 ms