Protein–RNA interactions for Protein: Q00444

HOXC5, Homeobox protein Hox-C5, humanhuman

Predictions only

Length 222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXC5Q00444 SNAI3-AS1-206ENST00000569786 588 ntTSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
HOXC5Q00444 ANAPC11-215ENST00000578550 599 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
HOXC5Q00444 PRCD-204ENST00000586148 630 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
HOXC5Q00444 AC233723.1-201ENST00000635921 386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
HOXC5Q00444 PLD2-201ENST00000263088 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
HOXC5Q00444 SNPH-203ENST00000614659 5354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
HOXC5Q00444 ZNF362-201ENST00000373428 2936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
HOXC5Q00444 B3GNT4-202ENST00000535274 2938 ntAPPRIS P1 BASIC13.64□□□□□ -0.23
HOXC5Q00444 TFDP1-201ENST00000375370 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
HOXC5Q00444 SGCZ-201ENST00000382080 2234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
HOXC5Q00444 HNRNPH1-204ENST00000442819 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
HOXC5Q00444 RIC8B-202ENST00000392837 5135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
HOXC5Q00444 SP8-203ENST00000617581 3496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
HOXC5Q00444 CHFR-205ENST00000450056 3250 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
HOXC5Q00444 BAIAP2-201ENST00000321280 1939 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
HOXC5Q00444 APBB3-201ENST00000354402 1810 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
HOXC5Q00444 SPATS2-203ENST00000547865 1810 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
HOXC5Q00444 CTCFL-205ENST00000423479 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
HOXC5Q00444 HS1BP3-201ENST00000304031 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
HOXC5Q00444 OSBPL1A-201ENST00000319481 4195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
HOXC5Q00444 RBL1-201ENST00000344359 3225 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
HOXC5Q00444 SFSWAP-210ENST00000541286 3219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
HOXC5Q00444 SLC25A36-201ENST00000324194 1301 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
HOXC5Q00444 MRPL37P1-201ENST00000592451 1337 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
HOXC5Q00444 ADAMTS14-201ENST00000373207 5260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
HOXC5Q00444 NFATC1-205ENST00000427363 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
HOXC5Q00444 CILP2-202ENST00000586018 4234 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
HOXC5Q00444 HNRNPA0-201ENST00000314940 8726 ntAPPRIS P1 BASIC13.63□□□□□ -0.23
HOXC5Q00444 RN7SL832P-201ENST00000607781 1756 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
HOXC5Q00444 SLC19A1-201ENST00000311124 3811 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
HOXC5Q00444 RBPJ-206ENST00000361572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
HOXC5Q00444 TRAK1-203ENST00000396175 5033 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
HOXC5Q00444 TRIM10-204ENST00000449742 3546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
HOXC5Q00444 ZNF619-201ENST00000314686 2233 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
HOXC5Q00444 ZFYVE28-210ENST00000515169 1590 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
HOXC5Q00444 SMARCA4-214ENST00000589677 5181 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
HOXC5Q00444 CAMK2A-203ENST00000398376 1493 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
HOXC5Q00444 HARS2-201ENST00000230771 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
HOXC5Q00444 LDHA-203ENST00000379412 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
HOXC5Q00444 RER1-207ENST00000488353 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
HOXC5Q00444 DDX49-214ENST00000629999 1912 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
HOXC5Q00444 AC105206.1-202ENST00000314927 2368 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
HOXC5Q00444 ADI1-201ENST00000327435 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
HOXC5Q00444 AC215219.1-201ENST00000400706 1817 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
HOXC5Q00444 STK3-201ENST00000419617 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
HOXC5Q00444 ACSM2A-209ENST00000573854 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
HOXC5Q00444 SS18L2-201ENST00000011691 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
HOXC5Q00444 NAT8-201ENST00000272425 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
HOXC5Q00444 UEVLD-201ENST00000300038 995 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
HOXC5Q00444 FAM169B-201ENST00000332908 579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
HOXC5Q00444 GLIPR1L1-202ENST00000378695 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
HOXC5Q00444 METTL21A-202ENST00000406927 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
HOXC5Q00444 AC073283.1-201ENST00000421759 860 ntTSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
HOXC5Q00444 AC233976.1-201ENST00000425150 451 ntTSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
HOXC5Q00444 AC131206.1-201ENST00000538078 1211 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
HOXC5Q00444 AIPL1-204ENST00000570466 1196 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
HOXC5Q00444 MIR5189-201ENST00000577370 114 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
HOXC5Q00444 AC011489.1-202ENST00000586556 618 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
HOXC5Q00444 PTPRS-208ENST00000590509 893 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
HOXC5Q00444 AC010641.1-201ENST00000591757 529 ntTSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
HOXC5Q00444 AC092364.2-202ENST00000597012 1073 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
HOXC5Q00444 AC010319.3-201ENST00000597028 470 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
HOXC5Q00444 HACD2-201ENST00000383657 4257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
HOXC5Q00444 ARHGAP45-202ENST00000539243 4184 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
HOXC5Q00444 CEP135-202ENST00000422247 2092 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
HOXC5Q00444 SYN2-205ENST00000620175 3871 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
HOXC5Q00444 PTPN9-206ENST00000618819 7813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
HOXC5Q00444 MAPKBP1-215ENST00000514566 5394 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
HOXC5Q00444 ALDH3A2-226ENST00000631291 3822 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
HOXC5Q00444 B3GAT2-201ENST00000230053 6565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
HOXC5Q00444 MAP2K7-203ENST00000397983 3396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
HOXC5Q00444 FLOT2-210ENST00000585169 2585 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
HOXC5Q00444 LINC01782-201ENST00000591212 2908 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
HOXC5Q00444 TPM3-206ENST00000330188 2108 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
HOXC5Q00444 ZIM2-AS1-201ENST00000595954 2129 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
HOXC5Q00444 COMT-205ENST00000406520 1339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
HOXC5Q00444 CARHSP1-216ENST00000610831 2841 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
HOXC5Q00444 RGS3-208ENST00000394646 2716 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
HOXC5Q00444 AFDN-203ENST00000366806 5962 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
HOXC5Q00444 ZBTB2-201ENST00000325144 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
HOXC5Q00444 CDC25B-205ENST00000439880 3096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
HOXC5Q00444 FGF12-207ENST00000454309 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
HOXC5Q00444 GPER1-203ENST00000397092 2971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
HOXC5Q00444 VGLL4-202ENST00000413604 1554 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
HOXC5Q00444 ACSF2-202ENST00000427954 2251 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
HOXC5Q00444 INTS11-248ENST00000545578 2263 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
HOXC5Q00444 DNAJC27-201ENST00000264711 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
HOXC5Q00444 ARHGEF7-201ENST00000218789 5233 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
HOXC5Q00444 PRSS54-201ENST00000219301 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
HOXC5Q00444 AC090505.1-201ENST00000430515 1834 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
HOXC5Q00444 RNASEH2C-201ENST00000308418 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
HOXC5Q00444 PRAME-214ENST00000543184 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
HOXC5Q00444 PARP1-203ENST00000366794 3958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
HOXC5Q00444 FFAR4-201ENST00000371481 3605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
HOXC5Q00444 TNFRSF10C-201ENST00000356864 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
HOXC5Q00444 AC016397.2-201ENST00000624848 1985 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
HOXC5Q00444 DAAM2-201ENST00000274867 6194 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
HOXC5Q00444 SCARF1-201ENST00000263071 3443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
HOXC5Q00444 PRKCSH-212ENST00000591462 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
HOXC5Q00444 LINC01138-206ENST00000622328 2212 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.8 ms