Protein–RNA interactions for Protein: Q00403

GTF2B, Transcription initiation factor IIB, humanhuman

Predictions only

Length 316 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2BQ00403 CHIA-204ENST00000369740 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
GTF2BQ00403 GOLGA8VP-201ENST00000559009 1798 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
GTF2BQ00403 ABAT-203ENST00000425191 1923 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
GTF2BQ00403 ANKRD17-201ENST00000330838 7734 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
GTF2BQ00403 FYN-202ENST00000354650 3628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
GTF2BQ00403 PRKAG2-215ENST00000492843 2699 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
GTF2BQ00403 MLEC-201ENST00000228506 6626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
GTF2BQ00403 WARS2-202ENST00000369426 2811 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
GTF2BQ00403 TMCO3-207ENST00000474393 2843 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
GTF2BQ00403 IER3-201ENST00000259874 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
GTF2BQ00403 NPFF-201ENST00000267017 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
GTF2BQ00403 MIR1247-201ENST00000408206 136 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
GTF2BQ00403 AL139412.1-202ENST00000452465 675 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
GTF2BQ00403 ROPN1B-210ENST00000514116 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
GTF2BQ00403 ANO1-AS1-201ENST00000524987 646 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
GTF2BQ00403 AC127024.2-201ENST00000581019 789 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
GTF2BQ00403 NFIC-204ENST00000586919 1221 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
GTF2BQ00403 PSENEN-203ENST00000591949 833 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
GTF2BQ00403 IRF3-223ENST00000599223 1055 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
GTF2BQ00403 AC243960.2-201ENST00000600996 747 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
GTF2BQ00403 ZCCHC4-206ENST00000612982 938 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
GTF2BQ00403 AC092299.1-201ENST00000632679 757 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
GTF2BQ00403 CHD1L-211ENST00000639534 1144 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
GTF2BQ00403 DYDC2-204ENST00000372199 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
GTF2BQ00403 CREBBP-201ENST00000262367 10803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
GTF2BQ00403 BCL11B-202ENST00000357195 7559 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
GTF2BQ00403 ADAMTSL1-204ENST00000380545 1562 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
GTF2BQ00403 SGCE-202ENST00000415788 1871 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
GTF2BQ00403 WDR5-201ENST00000358625 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
GTF2BQ00403 AL022313.4-201ENST00000562756 2046 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
GTF2BQ00403 NACAD-202ENST00000490531 4780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
GTF2BQ00403 GGT1-201ENST00000248923 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
GTF2BQ00403 SUOX-202ENST00000356124 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
GTF2BQ00403 WDR20-203ENST00000335263 2616 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
GTF2BQ00403 WAC-AS1-202ENST00000528337 2608 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
GTF2BQ00403 USP25-201ENST00000285679 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
GTF2BQ00403 TMBIM1-201ENST00000258412 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
GTF2BQ00403 TMEM139-201ENST00000359333 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
GTF2BQ00403 AL139082.1-201ENST00000613982 3433 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
GTF2BQ00403 ARID4B-202ENST00000349213 5811 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
GTF2BQ00403 MDFIC-202ENST00000393486 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.14
GTF2BQ00403 SLC26A11-201ENST00000361193 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
GTF2BQ00403 PORCN-204ENST00000361988 1672 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
GTF2BQ00403 ABI2-215ENST00000430418 1676 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
GTF2BQ00403 KIR3DL2-201ENST00000270442 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
GTF2BQ00403 SP6-201ENST00000342234 3800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
GTF2BQ00403 ARHGAP4-203ENST00000370028 3372 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
GTF2BQ00403 UBXN11-206ENST00000374222 2043 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
GTF2BQ00403 EIF4G3-205ENST00000400422 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
GTF2BQ00403 AC022007.1-201ENST00000383808 1897 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
GTF2BQ00403 KCNQ4-201ENST00000347132 4099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
GTF2BQ00403 HLA-DPA1-242ENST00000419277 1704 ntAPPRIS P2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
GTF2BQ00403 IDH3B-212ENST00000613370 1400 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
GTF2BQ00403 DYNLL2-201ENST00000579991 6805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
GTF2BQ00403 PLEKHB2-206ENST00000409612 2210 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
GTF2BQ00403 GSTT2B-201ENST00000290765 1099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
GTF2BQ00403 AL022323.1-201ENST00000366110 957 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
GTF2BQ00403 UBE4B-203ENST00000377153 1273 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
GTF2BQ00403 AC016700.1-201ENST00000429424 312 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
GTF2BQ00403 KRT8P13-201ENST00000463294 1010 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
GTF2BQ00403 SELENOW-201ENST00000509570 881 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
GTF2BQ00403 RPL27A-202ENST00000524496 558 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
GTF2BQ00403 AL356756.1-201ENST00000550941 551 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
GTF2BQ00403 SYT17-208ENST00000568433 812 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
GTF2BQ00403 SELENOW-204ENST00000595615 535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
GTF2BQ00403 TUBB4A-212ENST00000601152 590 ntTSL 4 BASIC15.89■□□□□ 0.13
GTF2BQ00403 SELENOW-216ENST00000612212 875 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
GTF2BQ00403 MEF2C-227ENST00000626391 1182 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
GTF2BQ00403 MEF2C-231ENST00000628656 1254 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
GTF2BQ00403 ELP4-201ENST00000350638 1907 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
GTF2BQ00403 MUTYH-210ENST00000450313 1929 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
GTF2BQ00403 PPP1R16B-202ENST00000373331 6106 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
GTF2BQ00403 DDX59-206ENST00000447706 2900 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
GTF2BQ00403 PCBP2-215ENST00000549863 1619 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
GTF2BQ00403 MARK2-206ENST00000425897 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
GTF2BQ00403 PPP1R13L-202ENST00000418234 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
GTF2BQ00403 HARS2-201ENST00000230771 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
GTF2BQ00403 KIAA1191-201ENST00000298569 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
GTF2BQ00403 ADARB1-202ENST00000360697 6604 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
GTF2BQ00403 TPBG-201ENST00000369750 6484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
GTF2BQ00403 SLC4A9-203ENST00000506545 2838 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
GTF2BQ00403 TMCO3-202ENST00000434316 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
GTF2BQ00403 NCBP2-206ENST00000447325 2216 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
GTF2BQ00403 AC020907.1-201ENST00000616460 1350 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
GTF2BQ00403 FBXL21-202ENST00000467490 1742 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
GTF2BQ00403 SLC35C2-201ENST00000243896 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
GTF2BQ00403 PBX3-201ENST00000342287 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
GTF2BQ00403 MBNL1-202ENST00000282488 6458 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
GTF2BQ00403 PNPLA3-201ENST00000216180 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
GTF2BQ00403 CICP16-201ENST00000502609 2813 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
GTF2BQ00403 ZNF785-202ENST00000470110 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
GTF2BQ00403 SLCO6A1-207ENST00000513675 1611 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
GTF2BQ00403 ZBTB7C-204ENST00000586438 4899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
GTF2BQ00403 CCT3-201ENST00000295688 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
GTF2BQ00403 PCDHA10-201ENST00000307360 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
GTF2BQ00403 ABHD4-201ENST00000216327 716 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
GTF2BQ00403 MRPS12-201ENST00000308018 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
GTF2BQ00403 C3orf22-201ENST00000318225 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
GTF2BQ00403 VSIG2-201ENST00000326621 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
GTF2BQ00403 CDKN1A-202ENST00000373711 793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 71.6 ms