Protein–RNA interactions for Protein: P84550

SKOR1, SKI family transcriptional corepressor 1, humanhuman

Predictions only

Length 965 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKOR1P84550 MAGEA12-203ENST00000393900 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SKOR1P84550 HLA-K-203ENST00000430151 1046 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
SKOR1P84550 AC114730.3-201ENST00000435195 584 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SKOR1P84550 ZNF707-203ENST00000442058 562 ntTSL 4 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SKOR1P84550 GGTLC2-202ENST00000448514 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SKOR1P84550 AP001582.1-201ENST00000525856 295 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
SKOR1P84550 LINC02298-201ENST00000546968 965 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SKOR1P84550 AC004477.1-202ENST00000584428 539 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SKOR1P84550 ELOF1-208ENST00000591912 899 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SKOR1P84550 TXNL4A-212ENST00000592957 546 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SKOR1P84550 AC005252.2-201ENST00000624630 1141 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
SKOR1P84550 PRSS30P-206ENST00000641773 873 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
SKOR1P84550 MAPK4-201ENST00000400384 4770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SKOR1P84550 TBC1D24-207ENST00000627285 4382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SKOR1P84550 SNX30-201ENST00000374232 7622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SKOR1P84550 GABARAP-201ENST00000302386 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SKOR1P84550 MRPL11-201ENST00000310999 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SKOR1P84550 ELOA2-202ENST00000620522 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SKOR1P84550 FRMD5-201ENST00000402883 4091 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SKOR1P84550 LARGE1-201ENST00000354992 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SKOR1P84550 MTF2-202ENST00000370303 1951 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SKOR1P84550 AL157414.3-201ENST00000624276 1954 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
SKOR1P84550 GNAS-215ENST00000371102 3438 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SKOR1P84550 SPPL3-201ENST00000353487 4148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SKOR1P84550 INF2-203ENST00000392634 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SKOR1P84550 MFAP4-202ENST00000395592 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SKOR1P84550 ZNF655-212ENST00000424881 4666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SKOR1P84550 ZBED8-202ENST00000523213 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SKOR1P84550 ATL3-203ENST00000538786 1920 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SKOR1P84550 SMARCA4-214ENST00000589677 5181 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SKOR1P84550 PRPF3-201ENST00000324862 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SKOR1P84550 BEND3P3-201ENST00000611030 2440 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
SKOR1P84550 KIF7-201ENST00000394412 4551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SKOR1P84550 CAMK2D-205ENST00000394524 5294 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SKOR1P84550 SNUPN-206ENST00000564675 1682 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SKOR1P84550 TRAK1-208ENST00000484786 2008 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SKOR1P84550 CD93-201ENST00000246006 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SKOR1P84550 CES1-203ENST00000422046 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SKOR1P84550 MX1-218ENST00000619682 1980 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SKOR1P84550 PLEKHB2-205ENST00000409279 2488 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SKOR1P84550 AMZ1-201ENST00000312371 5516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SKOR1P84550 SPAG11A-201ENST00000326558 612 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SKOR1P84550 POLDIP3-202ENST00000339677 783 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SKOR1P84550 KIAA0907-201ENST00000368319 1155 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SKOR1P84550 KRTAP1-4-201ENST00000377747 408 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SKOR1P84550 HOPX-203ENST00000381255 1164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SKOR1P84550 MIR658-201ENST00000385210 100 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
SKOR1P84550 AL645937.2-201ENST00000396808 931 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
SKOR1P84550 LINC01784-201ENST00000438401 378 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SKOR1P84550 AC004522.2-201ENST00000456499 680 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SKOR1P84550 AC012531.3-201ENST00000513209 777 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SKOR1P84550 LSM1-203ENST00000520755 975 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SKOR1P84550 ENPP7P5-201ENST00000541031 1031 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
SKOR1P84550 AC021054.1-202ENST00000543884 599 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SKOR1P84550 ATXN2-AS-201ENST00000547021 485 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SKOR1P84550 HOPX-210ENST00000553379 1001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SKOR1P84550 HOPX-212ENST00000555760 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SKOR1P84550 HOPX-213ENST00000556376 1064 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SKOR1P84550 CLUHP6-201ENST00000580789 941 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
SKOR1P84550 AC005262.2-201ENST00000587701 452 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SKOR1P84550 AL606495.2-201ENST00000605867 535 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
SKOR1P84550 TPTE2P2-205ENST00000606711 505 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SKOR1P84550 IL32-235ENST00000613483 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SKOR1P84550 RTEL1-203ENST00000360203 4623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SKOR1P84550 ZBTB47-201ENST00000232974 3781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SKOR1P84550 UCP3-202ENST00000426995 1406 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SKOR1P84550 DRD2-201ENST00000346454 2433 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SKOR1P84550 SLC22A2-202ENST00000366953 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SKOR1P84550 ARFIP1-204ENST00000429148 1599 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SKOR1P84550 DOK1-202ENST00000340004 1722 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SKOR1P84550 LSS-202ENST00000397728 4936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SKOR1P84550 LRP8-201ENST00000306052 7648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SKOR1P84550 EGR1-201ENST00000239938 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SKOR1P84550 ARHGAP10-201ENST00000336498 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SKOR1P84550 BTBD10-208ENST00000528120 1662 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SKOR1P84550 SPDYE6-201ENST00000563237 1691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SKOR1P84550 IRF2BP2-201ENST00000366609 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SKOR1P84550 NIPA1-201ENST00000337435 6567 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SKOR1P84550 PCDHA5-201ENST00000529619 4157 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SKOR1P84550 DMRT2-202ENST00000302441 1495 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SKOR1P84550 KLHDC3-203ENST00000332245 1494 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SKOR1P84550 ZDHHC4-203ENST00000396707 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SKOR1P84550 OIT3-202ENST00000622652 1602 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SKOR1P84550 DIP2A-201ENST00000400274 7023 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SKOR1P84550 ATRN-202ENST00000446916 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SKOR1P84550 SCFD1-203ENST00000458591 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SKOR1P84550 CCT4-201ENST00000394440 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SKOR1P84550 ATG9A-204ENST00000409422 2512 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SKOR1P84550 CROT-203ENST00000419147 2959 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SKOR1P84550 DPP8-202ENST00000321147 3125 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SKOR1P84550 PDPK1-202ENST00000342085 7241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SKOR1P84550 AHNAK-201ENST00000257247 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SKOR1P84550 SLC19A1-201ENST00000311124 3811 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SKOR1P84550 MSI2-202ENST00000322684 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SKOR1P84550 KRTAP19-7-201ENST00000334849 440 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SKOR1P84550 TPGS2-202ENST00000383056 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SKOR1P84550 SZT2-AS1-201ENST00000396885 699 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SKOR1P84550 Z94721.1-201ENST00000444102 385 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SKOR1P84550 AC097717.1-202ENST00000457577 740 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SKOR1P84550 RN7SL837P-201ENST00000463010 287 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46 ms