Protein–RNA interactions for Protein: P68133

ACTA1, Actin, alpha skeletal muscle, humanhuman

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Length 377 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTA1P68133 RUBCNL-204ENST00000378797 3206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
ACTA1P68133 ABCC6-201ENST00000205557 5747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
ACTA1P68133 LRRC8D-201ENST00000337338 3950 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
ACTA1P68133 SP8-203ENST00000617581 3496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
ACTA1P68133 L3MBTL1-206ENST00000427442 3157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
ACTA1P68133 APBB1-203ENST00000389906 2684 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
ACTA1P68133 ATL2-210ENST00000452935 2199 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
ACTA1P68133 LINC02346-201ENST00000383019 1967 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
ACTA1P68133 TUBGCP6-201ENST00000248846 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
ACTA1P68133 LINC00665-203ENST00000438368 1863 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
ACTA1P68133 SELENON-201ENST00000354177 4227 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
ACTA1P68133 CGB5-201ENST00000301408 841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
ACTA1P68133 NCR3-204ENST00000376073 1097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
ACTA1P68133 C1QBPP1-201ENST00000400117 770 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
ACTA1P68133 PMS2P2-201ENST00000425039 1128 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
ACTA1P68133 RNASE10-202ENST00000430083 1172 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
ACTA1P68133 EIF3FP3-201ENST00000434851 1086 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
ACTA1P68133 AC092809.2-202ENST00000436706 790 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
ACTA1P68133 FOLR3-201ENST00000442948 805 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
ACTA1P68133 TMEM147-AS1-201ENST00000444728 487 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
ACTA1P68133 PLXNB2-207ENST00000449103 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
ACTA1P68133 LINC01160-202ENST00000450155 894 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
ACTA1P68133 TSC22D3-213ENST00000506081 956 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
ACTA1P68133 AC114956.2-201ENST00000512498 572 ntTSL 4 BASIC13.13□□□□□ -0.31
ACTA1P68133 TPRX2P-201ENST00000535362 881 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
ACTA1P68133 STOM-203ENST00000538954 1257 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
ACTA1P68133 TOMM5-205ENST00000544379 635 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
ACTA1P68133 AP006333.2-201ENST00000544948 732 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
ACTA1P68133 ARL6IP1-202ENST00000546206 1107 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
ACTA1P68133 SORD2P-201ENST00000558556 1069 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
ACTA1P68133 AC009407.1-201ENST00000568958 598 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
ACTA1P68133 AC040162.1-202ENST00000573493 573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
ACTA1P68133 AC106028.4-201ENST00000614509 607 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
ACTA1P68133 LINC01663-201ENST00000614596 535 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
ACTA1P68133 PHTF2-206ENST00000422959 3525 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
ACTA1P68133 STAB1-201ENST00000321725 7928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
ACTA1P68133 TMEM231-207ENST00000568377 2920 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
ACTA1P68133 ATN1-201ENST00000356654 4351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
ACTA1P68133 MST1-202ENST00000449682 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
ACTA1P68133 MYLK-203ENST00000359169 7585 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
ACTA1P68133 TLE1-203ENST00000376499 3893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
ACTA1P68133 MAGI2-218ENST00000630991 2349 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
ACTA1P68133 FAM219B-201ENST00000357635 3550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
ACTA1P68133 SOX21-AS1-201ENST00000438290 3287 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
ACTA1P68133 MYD88-201ENST00000396334 2850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
ACTA1P68133 TCHH-202ENST00000614923 6995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
ACTA1P68133 RTN4-202ENST00000337526 4790 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
ACTA1P68133 EHD1-202ENST00000359393 3618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
ACTA1P68133 TMEM184B-202ENST00000361906 3611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
ACTA1P68133 IFNA6-202ENST00000380210 1544 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
ACTA1P68133 RIPOR3-202ENST00000327979 4377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
ACTA1P68133 HS1BP3-201ENST00000304031 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
ACTA1P68133 ATP6AP2-211ENST00000636196 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
ACTA1P68133 AXL-202ENST00000359092 3206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
ACTA1P68133 ATP6V0A4-201ENST00000310018 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
ACTA1P68133 FAM86B1-203ENST00000448228 2096 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
ACTA1P68133 THUMPD3-AS1-202ENST00000468186 3253 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
ACTA1P68133 ADCY7-208ENST00000566433 2535 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
ACTA1P68133 ADD3-202ENST00000356080 3081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
ACTA1P68133 ABCA2-203ENST00000371605 8151 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
ACTA1P68133 PFAS-201ENST00000314666 5371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
ACTA1P68133 RTFDC1-203ENST00000395881 1572 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
ACTA1P68133 TSEN2-202ENST00000402228 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
ACTA1P68133 GPBAR1-203ENST00000521462 1465 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
ACTA1P68133 FEM1A-201ENST00000269856 9593 ntAPPRIS P1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
ACTA1P68133 SDC1-201ENST00000254351 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
ACTA1P68133 NCBP2-204ENST00000427641 1946 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
ACTA1P68133 IFRD1-205ENST00000429071 1938 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
ACTA1P68133 C7orf57-204ENST00000435376 1925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
ACTA1P68133 SCLT1-204ENST00000503215 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
ACTA1P68133 C7orf57-206ENST00000539619 1927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
ACTA1P68133 AC111170.3-201ENST00000624282 2464 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
ACTA1P68133 MPZ-204ENST00000491222 1824 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
ACTA1P68133 H2BFWT-201ENST00000217926 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
ACTA1P68133 C16orf92-201ENST00000300575 895 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
ACTA1P68133 DUPD1-201ENST00000338487 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
ACTA1P68133 H3F3C-201ENST00000340398 1057 ntAPPRIS P1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
ACTA1P68133 CRYAA-202ENST00000398132 826 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
ACTA1P68133 TNFRSF14-202ENST00000409119 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
ACTA1P68133 GGCT-205ENST00000409436 954 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
ACTA1P68133 HLA-DRB6-201ENST00000411500 1235 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
ACTA1P68133 AC007319.1-202ENST00000412276 829 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
ACTA1P68133 YAE1D1-202ENST00000432096 968 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
ACTA1P68133 LEKR1-211ENST00000498839 616 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
ACTA1P68133 AC020659.2-201ENST00000510176 585 ntTSL 4 BASIC13.12□□□□□ -0.31
ACTA1P68133 RIC8B-209ENST00000549643 571 ntTSL 4 BASIC13.12□□□□□ -0.31
ACTA1P68133 RPL28-205ENST00000558131 444 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
ACTA1P68133 AC103988.2-201ENST00000561804 725 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
ACTA1P68133 IFT20-206ENST00000578122 834 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
ACTA1P68133 IFT20-208ENST00000578985 831 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
ACTA1P68133 AC011499.1-201ENST00000586012 581 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
ACTA1P68133 PAX4-207ENST00000611453 1235 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
ACTA1P68133 CREB3L2-208ENST00000620715 1053 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
ACTA1P68133 FP236240.1-204ENST00000624932 712 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
ACTA1P68133 ISLR-202ENST00000395118 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
ACTA1P68133 OSBPL8-201ENST00000261183 7239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
ACTA1P68133 OSBPL8-218ENST00000611266 7239 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
ACTA1P68133 USP51-201ENST00000500968 4407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
ACTA1P68133 CLIC5-208ENST00000544153 2051 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
ACTA1P68133 RMDN3-201ENST00000260385 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
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