Protein–RNA interactions for Protein: P59942

MCCD1, Mitochondrial coiled-coil domain protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 119 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCCD1P59942 IFITM3-204ENST00000602735 713 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
MCCD1P59942 LINC02028-216ENST00000609015 732 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
MCCD1P59942 AL136295.7-201ENST00000619226 1200 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
MCCD1P59942 PPFIBP2-201ENST00000299492 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
MCCD1P59942 AC011462.1-202ENST00000540732 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
MCCD1P59942 MAP1S-201ENST00000324096 3419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
MCCD1P59942 DMTN-203ENST00000381470 2601 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
MCCD1P59942 COL5A1-201ENST00000371817 8471 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
MCCD1P59942 GLUL-201ENST00000311223 4719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
MCCD1P59942 ACVR1C-204ENST00000409680 1786 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
MCCD1P59942 GABRB2-205ENST00000517901 1779 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
MCCD1P59942 LRP10-203ENST00000546834 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
MCCD1P59942 MLEC-201ENST00000228506 6626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
MCCD1P59942 ADD3-202ENST00000356080 3081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
MCCD1P59942 LINC01873-201ENST00000428647 1679 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
MCCD1P59942 ST3GAL5-203ENST00000393805 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
MCCD1P59942 C1R-202ENST00000536053 2347 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
MCCD1P59942 ELP4-228ENST00000640954 1612 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
MCCD1P59942 EXO5-201ENST00000296380 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
MCCD1P59942 CHIT1-201ENST00000255427 1598 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
MCCD1P59942 ODF2L-204ENST00000370566 2155 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
MCCD1P59942 AP002414.2-201ENST00000591780 3365 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
MCCD1P59942 PPP1R1B-203ENST00000394267 1504 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
MCCD1P59942 DDO-202ENST00000368924 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
MCCD1P59942 KATNBL1-201ENST00000256544 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
MCCD1P59942 DBNDD1-203ENST00000392973 2689 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
MCCD1P59942 ALG1-204ENST00000588623 2671 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
MCCD1P59942 SEC13-208ENST00000397109 1467 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
MCCD1P59942 YIPF3-213ENST00000506469 1444 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
MCCD1P59942 EPS8L3-202ENST00000361965 1971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
MCCD1P59942 C7orf33-201ENST00000307003 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
MCCD1P59942 UBL7-201ENST00000361351 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
MCCD1P59942 PSEN2-201ENST00000366782 2465 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
MCCD1P59942 LDB3-207ENST00000542786 1889 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
MCCD1P59942 FKBP9-201ENST00000242209 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
MCCD1P59942 KIF6-201ENST00000229913 1330 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
MCCD1P59942 KLK11-207ENST00000594768 1347 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
MCCD1P59942 ARHGEF26-203ENST00000465817 2353 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
MCCD1P59942 RAB40AL-201ENST00000218249 1029 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
MCCD1P59942 C1orf123-201ENST00000294360 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
MCCD1P59942 MRPS12-201ENST00000308018 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
MCCD1P59942 LBH-202ENST00000401506 485 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
MCCD1P59942 PTPA-213ENST00000419582 952 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
MCCD1P59942 MUC1-218ENST00000471283 635 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
MCCD1P59942 AC108725.1-201ENST00000495472 409 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
MCCD1P59942 LIAS-205ENST00000509519 1005 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
MCCD1P59942 SELENOW-201ENST00000509570 881 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
MCCD1P59942 EID1-202ENST00000560490 584 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
MCCD1P59942 RN7SL121P-201ENST00000584223 273 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
MCCD1P59942 SELENOW-204ENST00000595615 535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
MCCD1P59942 AC091271.1-201ENST00000611877 1162 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
MCCD1P59942 SELENOW-216ENST00000612212 875 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
MCCD1P59942 AL157813.1-201ENST00000612996 587 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
MCCD1P59942 MIR6869-201ENST00000619434 62 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
MCCD1P59942 AC006453.2-202ENST00000635968 827 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
MCCD1P59942 LINC00665-206ENST00000590622 1749 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
MCCD1P59942 CLTCL1-212ENST00000622493 1714 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
MCCD1P59942 PAX6-203ENST00000379109 3182 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
MCCD1P59942 MAPKAP1-204ENST00000373498 3131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
MCCD1P59942 KCNN3-202ENST00000358505 1658 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
MCCD1P59942 ARHGEF40-201ENST00000298694 5919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
MCCD1P59942 ZNF165-201ENST00000377325 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
MCCD1P59942 ARMCX3-203ENST00000471229 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
MCCD1P59942 SIGLEC16-202ENST00000602139 2510 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
MCCD1P59942 NOP58-201ENST00000264279 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
MCCD1P59942 ADGRA1-203ENST00000607359 6004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
MCCD1P59942 NFE2L2-201ENST00000397062 2853 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
MCCD1P59942 PRSS30P-203ENST00000476276 2855 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
MCCD1P59942 PATL2-201ENST00000434130 1950 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
MCCD1P59942 ABAT-213ENST00000567812 1959 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
MCCD1P59942 CCNG1-202ENST00000393929 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
MCCD1P59942 TMPRSS2-202ENST00000398585 3240 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
MCCD1P59942 RAB31-207ENST00000578921 4055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
MCCD1P59942 NBEA-201ENST00000310336 10794 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
MCCD1P59942 NBEA-208ENST00000629018 10791 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
MCCD1P59942 SUPT4H1-201ENST00000225504 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
MCCD1P59942 SYNM-201ENST00000328642 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
MCCD1P59942 ACSL3-202ENST00000392066 3147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
MCCD1P59942 P2RX3-201ENST00000263314 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
MCCD1P59942 LGALS12-204ENST00000415491 1816 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
MCCD1P59942 C3orf33-205ENST00000534941 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
MCCD1P59942 C1R-201ENST00000535233 2211 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
MCCD1P59942 FAM83A-202ENST00000518448 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
MCCD1P59942 BBS2-201ENST00000245157 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
MCCD1P59942 MAGI3-203ENST00000369615 6508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
MCCD1P59942 KIF26B-202ENST00000407071 7287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
MCCD1P59942 SCN3B-202ENST00000392770 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
MCCD1P59942 ARHGEF4-205ENST00000409359 5489 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
MCCD1P59942 NFATC2-206ENST00000609943 5690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
MCCD1P59942 SMG9-211ENST00000601170 2387 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
MCCD1P59942 MRPL32-201ENST00000223324 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
MCCD1P59942 TMEM40-201ENST00000264728 984 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
MCCD1P59942 C8orf74-201ENST00000304519 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
MCCD1P59942 LSM10-201ENST00000315732 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
MCCD1P59942 KRTAP21-2-201ENST00000333892 440 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
MCCD1P59942 UBE4B-203ENST00000377153 1273 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
MCCD1P59942 DYNC1I1-203ENST00000413338 958 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
MCCD1P59942 AC244250.1-201ENST00000438185 451 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
MCCD1P59942 AC044849.1-201ENST00000519737 1188 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
MCCD1P59942 SNHG14-213ENST00000551077 638 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57 ms