Protein–RNA interactions for Protein: P51531

SMARCA2, Probable global transcription activator SNF2L2, humanhuman

Predictions only

Length 1,590 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCA2P51531 HFE-209ENST00000461397 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SMARCA2P51531 AC105133.1-201ENST00000559749 742 ntTSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
SMARCA2P51531 GSTT2-202ENST00000621118 1112 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
SMARCA2P51531 AC048382.6-201ENST00000621980 1223 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
SMARCA2P51531 AC245100.4-201ENST00000634549 1082 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
SMARCA2P51531 F8-201ENST00000330287 2620 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SMARCA2P51531 SUGP2-202ENST00000337018 3640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SMARCA2P51531 SLC46A2-201ENST00000374228 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SMARCA2P51531 RFX8-201ENST00000428343 1686 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
SMARCA2P51531 AGAP7P-201ENST00000582299 2062 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
SMARCA2P51531 AGAP14-201ENST00000624701 2060 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
SMARCA2P51531 FAM9B-201ENST00000327220 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SMARCA2P51531 LMBRD1-202ENST00000370577 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SMARCA2P51531 SDC4-201ENST00000372733 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SMARCA2P51531 EGOT-201ENST00000414938 1464 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SMARCA2P51531 SLC20A2-207ENST00000520179 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SMARCA2P51531 SLC37A3-201ENST00000326232 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SMARCA2P51531 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SMARCA2P51531 AGPAT1-201ENST00000336984 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SMARCA2P51531 AGPAT1-202ENST00000375104 2017 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
SMARCA2P51531 LILRP2-202ENST00000413572 1383 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
SMARCA2P51531 TPM3-205ENST00000328159 1771 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
SMARCA2P51531 RHOH-220ENST00000615083 2156 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.06■■□□□ 1.6
SMARCA2P51531 TMEM209-202ENST00000462753 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
SMARCA2P51531 B3GNT4-206ENST00000546192 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
SMARCA2P51531 AIFM1-203ENST00000346424 1200 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
SMARCA2P51531 RHOC-207ENST00000369638 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
SMARCA2P51531 PITHD1-202ENST00000374524 1292 ntTSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
SMARCA2P51531 BPIFA4P-201ENST00000375465 1203 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SMARCA2P51531 NPPA-202ENST00000376480 855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SMARCA2P51531 FAM197Y6-201ENST00000420524 766 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
SMARCA2P51531 AC108724.1-201ENST00000481669 352 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
SMARCA2P51531 AC092910.2-201ENST00000491262 348 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
SMARCA2P51531 FAM167A-AS1-202ENST00000533578 1222 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
SMARCA2P51531 AC011603.2-203ENST00000547387 897 ntTSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
SMARCA2P51531 NPPA-203ENST00000610706 849 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
SMARCA2P51531 TRIM23-202ENST00000274327 1829 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SMARCA2P51531 ARFGAP1-201ENST00000353546 2776 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SMARCA2P51531 ELMO3-202ENST00000393997 2531 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
SMARCA2P51531 ATP6V1C1-202ENST00000518738 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SMARCA2P51531 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SMARCA2P51531 AL928654.2-201ENST00000551271 2279 ntTSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
SMARCA2P51531 AL008638.4-201ENST00000624792 1315 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
SMARCA2P51531 TBCE-202ENST00000406207 2012 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
SMARCA2P51531 FBXO18-201ENST00000362091 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SMARCA2P51531 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SMARCA2P51531 RSPH6A-203ENST00000600188 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
SMARCA2P51531 SFXN4-201ENST00000355697 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SMARCA2P51531 AC215219.1-201ENST00000400706 1817 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
SMARCA2P51531 DDX1-201ENST00000233084 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SMARCA2P51531 CBL-204ENST00000634840 4813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
SMARCA2P51531 CRAT-201ENST00000318080 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SMARCA2P51531 MAPK8IP2-202ENST00000329492 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SMARCA2P51531 FUNDC2P2-201ENST00000331369 1223 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SMARCA2P51531 ANO10-202ENST00000350459 2039 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SMARCA2P51531 AIG1-203ENST00000367596 559 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
SMARCA2P51531 IFNA2-201ENST00000380206 1135 ntAPPRIS P1 BASIC25.05■■□□□ 1.6
SMARCA2P51531 GGTLC4P-201ENST00000402176 664 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
SMARCA2P51531 SNCAIP-206ENST00000414317 1591 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SMARCA2P51531 PHBP10-201ENST00000416467 784 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
SMARCA2P51531 HNRNPA1P25-201ENST00000422644 937 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
SMARCA2P51531 FRGCA-201ENST00000424933 422 ntTSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
SMARCA2P51531 LINC00399-201ENST00000439008 414 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
SMARCA2P51531 RN7SL684P-201ENST00000465665 294 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
SMARCA2P51531 HS6ST2-204ENST00000521489 2607 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
SMARCA2P51531 C1orf198-207ENST00000523410 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
SMARCA2P51531 MYMX-201ENST00000573382 817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
SMARCA2P51531 ADAM9-206ENST00000481513 2387 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
SMARCA2P51531 UGP2-207ENST00000467648 2057 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SMARCA2P51531 TBC1D3G-201ENST00000569055 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SMARCA2P51531 TBC1D3H-201ENST00000610350 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SMARCA2P51531 TBC1D3L-202ENST00000617678 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SMARCA2P51531 TRIM9-202ENST00000338969 3312 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
SMARCA2P51531 RPAIN-202ENST00000381208 1394 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SMARCA2P51531 C22orf42-201ENST00000382097 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SMARCA2P51531 GLB1L2-201ENST00000339772 3152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
SMARCA2P51531 NAIF1-201ENST00000373078 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SMARCA2P51531 AC092384.2-204ENST00000565053 2566 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
SMARCA2P51531 AC093525.2-201ENST00000564543 1944 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
SMARCA2P51531 PHKG1-201ENST00000297373 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SMARCA2P51531 RPL10L-201ENST00000298283 812 ntAPPRIS P1 BASIC25.04■■□□□ 1.6
SMARCA2P51531 ADRB3-201ENST00000345060 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SMARCA2P51531 TOMM5-203ENST00000401811 789 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
SMARCA2P51531 CLEC18C-210ENST00000569347 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SMARCA2P51531 AC026412.1-203ENST00000507841 2338 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SMARCA2P51531 TRIP10-210ENST00000600428 2249 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
SMARCA2P51531 SALL3-206ENST00000616649 2958 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
SMARCA2P51531 NGFR-201ENST00000172229 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SMARCA2P51531 NRBP1-201ENST00000233557 2887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
SMARCA2P51531 REC8-209ENST00000611366 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SMARCA2P51531 INPP5J-207ENST00000405300 2515 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SMARCA2P51531 EML2-203ENST00000536630 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
SMARCA2P51531 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SMARCA2P51531 MED15P3-201ENST00000413613 326 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
SMARCA2P51531 RIC3-205ENST00000425599 867 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SMARCA2P51531 TRAPPC4-202ENST00000434101 794 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
SMARCA2P51531 C10orf91-203ENST00000490765 462 ntTSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
SMARCA2P51531 RNASEK-204ENST00000552039 591 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SMARCA2P51531 GRAMD4P6-201ENST00000556999 244 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
SMARCA2P51531 RN7SL605P-201ENST00000577229 281 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.6 ms