Protein–RNA interactions for Protein: P49356

FNTB, Protein farnesyltransferase subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 437 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FNTBP49356 TMBIM4-208ENST00000542724 770 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
FNTBP49356 AC027237.1-201ENST00000560942 655 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
FNTBP49356 HERC2P11-201ENST00000562845 725 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
FNTBP49356 AC100756.2-201ENST00000569537 736 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
FNTBP49356 SRRM2-205ENST00000570971 1132 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
FNTBP49356 HKR1-225ENST00000592168 566 ntTSL 4 BASIC14.61□□□□□ -0.07
FNTBP49356 TMIGD2-204ENST00000600349 333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
FNTBP49356 AP000322.3-201ENST00000608665 388 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
FNTBP49356 AL022334.2-201ENST00000610000 484 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
FNTBP49356 HIST1H3F-201ENST00000618052 411 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
FNTBP49356 AC114296.1-204ENST00000637197 1173 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
FNTBP49356 DUSP18-201ENST00000334679 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
FNTBP49356 LGR6-205ENST00000439764 2487 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
FNTBP49356 TPD52L2-204ENST00000351424 2302 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
FNTBP49356 PABPC4-201ENST00000372856 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
FNTBP49356 ATP2A2-204ENST00000539276 4094 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
FNTBP49356 USP4-203ENST00000415188 1454 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
FNTBP49356 OTX1-201ENST00000282549 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
FNTBP49356 OTX1-202ENST00000366671 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
FNTBP49356 KIAA1211-206ENST00000541073 4117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
FNTBP49356 TRIM46-211ENST00000611379 3082 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
FNTBP49356 SLC29A2-207ENST00000619145 2380 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
FNTBP49356 PDK2-201ENST00000007708 2384 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
FNTBP49356 CDC45-202ENST00000404724 1693 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
FNTBP49356 SLC8B1-202ENST00000546737 1656 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
FNTBP49356 KLK3-216ENST00000617027 1341 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
FNTBP49356 NANOS1-202ENST00000425699 4017 ntAPPRIS P2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
FNTBP49356 KCNG3-202ENST00000394973 3656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
FNTBP49356 RAB5B-202ENST00000448789 1530 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
FNTBP49356 HSD17B6-206ENST00000555159 1525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
FNTBP49356 HAUS2-208ENST00000568876 1702 ntTSL 4 BASIC14.61□□□□□ -0.07
FNTBP49356 TSPAN5-201ENST00000305798 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
FNTBP49356 VASH2-204ENST00000366966 1369 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
FNTBP49356 AFF4-201ENST00000265343 9552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
FNTBP49356 TOM1-209ENST00000447733 2317 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
FNTBP49356 CDC25B-203ENST00000344256 3071 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
FNTBP49356 HORMAD1-201ENST00000322343 1771 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
FNTBP49356 MYH14-204ENST00000440075 4247 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
FNTBP49356 TNR-201ENST00000263525 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
FNTBP49356 MOGAT2-201ENST00000198801 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
FNTBP49356 DEPDC5-203ENST00000400242 2395 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
FNTBP49356 ALOX15B-204ENST00000572022 2396 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
FNTBP49356 GHDC-207ENST00000587427 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
FNTBP49356 TNFRSF14-AS1-201ENST00000416860 3522 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
FNTBP49356 FLAD1-205ENST00000368431 1803 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
FNTBP49356 THUMPD3-AS1-212ENST00000520447 1809 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
FNTBP49356 MFSD5-202ENST00000534842 2038 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
FNTBP49356 LAPTM5-201ENST00000294507 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
FNTBP49356 LCE3B-201ENST00000335633 288 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
FNTBP49356 OPA1-204ENST00000361828 6381 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
FNTBP49356 TRBJ2-6-201ENST00000390418 53 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
FNTBP49356 HCG27-204ENST00000424675 895 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
FNTBP49356 BCAS2P2-201ENST00000425064 674 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
FNTBP49356 PTPA-215ENST00000432124 567 ntTSL 4 BASIC14.6□□□□□ -0.07
FNTBP49356 AC093484.1-201ENST00000441875 477 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
FNTBP49356 DPY19L2P5-201ENST00000456300 331 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
FNTBP49356 FRMD4A-208ENST00000493380 1149 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
FNTBP49356 AC105390.1-201ENST00000511330 560 ntTSL 4 BASIC14.6□□□□□ -0.07
FNTBP49356 LINC02062-201ENST00000513175 478 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
FNTBP49356 RNA5SP417-201ENST00000516459 108 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
FNTBP49356 NEU3-207ENST00000534628 746 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
FNTBP49356 AC138701.2-201ENST00000553634 226 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
FNTBP49356 AC020659.1-202ENST00000564432 531 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
FNTBP49356 AC012645.2-201ENST00000566190 553 ntTSL 4 BASIC14.6□□□□□ -0.07
FNTBP49356 AC136624.2-201ENST00000574883 542 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
FNTBP49356 KRT16P3-202ENST00000580113 1012 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
FNTBP49356 KRT16P1-203ENST00000581027 1012 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
FNTBP49356 AC073592.2-201ENST00000623062 780 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
FNTBP49356 MVK-217ENST00000639206 367 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
FNTBP49356 PTGES3L-AARSD1-202ENST00000409103 1670 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
FNTBP49356 CNBP-201ENST00000422453 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
FNTBP49356 IQCF3-205ENST00000456080 1685 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
FNTBP49356 TM9SF1-202ENST00000396854 2055 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
FNTBP49356 MIEF1-202ENST00000402881 2269 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
FNTBP49356 GAS2L2-201ENST00000604063 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
FNTBP49356 BAIAP2-201ENST00000321280 1939 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
FNTBP49356 PIMREG-205ENST00000572447 1948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
FNTBP49356 FBXL21-202ENST00000467490 1742 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
FNTBP49356 HGNC:18790-202ENST00000421177 4172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
FNTBP49356 RELL1-201ENST00000314117 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
FNTBP49356 STIP1-201ENST00000305218 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
FNTBP49356 SEMA4F-201ENST00000339773 2177 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
FNTBP49356 INPPL1-207ENST00000538751 4656 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
FNTBP49356 TMA16-201ENST00000358572 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
FNTBP49356 FAM198B-203ENST00000585682 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
FNTBP49356 BID-213ENST00000615414 2236 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
FNTBP49356 FDFT1-224ENST00000618539 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
FNTBP49356 LCOR-202ENST00000356016 4834 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
FNTBP49356 RALGPS1-203ENST00000373434 2466 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
FNTBP49356 TCP10-201ENST00000366827 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
FNTBP49356 BTBD8-201ENST00000342818 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
FNTBP49356 GPR153-201ENST00000377893 4082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
FNTBP49356 AC087481.3-201ENST00000602886 1894 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
FNTBP49356 TUBB4A-201ENST00000264071 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
FNTBP49356 SGK2-206ENST00000423407 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
FNTBP49356 SEPT11-203ENST00000502584 2615 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
FNTBP49356 FERD3L-201ENST00000275461 640 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
FNTBP49356 NHP2-202ENST00000314397 599 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
FNTBP49356 TMEM176B-201ENST00000326442 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
FNTBP49356 KRTAP19-5-201ENST00000334151 461 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.4 ms