Protein–RNA interactions for Protein: P43304

GPD2, Glycerol-3-phosphate dehydrogenase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 727 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPD2P43304 LIMS1-206ENST00000414829 439 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GPD2P43304 MIR663AHG-201ENST00000427348 1213 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GPD2P43304 VDAC1P1-201ENST00000439229 848 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
GPD2P43304 RPL18P13-201ENST00000478088 569 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
GPD2P43304 SNHG12-210ENST00000483436 682 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GPD2P43304 AC021723.1-201ENST00000486306 515 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
GPD2P43304 LIMS3-205ENST00000487150 782 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GPD2P43304 AC012574.2-201ENST00000520375 443 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GPD2P43304 RCE1-204ENST00000525356 1270 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GPD2P43304 DPF3-210ENST00000556509 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GPD2P43304 LINC02332-201ENST00000557232 386 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GPD2P43304 GSTZ1-219ENST00000557639 873 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GPD2P43304 JMJD8-203ENST00000562824 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GPD2P43304 AC009134.1-201ENST00000571939 443 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GPD2P43304 AC007663.3-201ENST00000609632 465 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
GPD2P43304 AP000346.4-201ENST00000614827 381 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
GPD2P43304 CNTNAP2-225ENST00000639247 2064 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GPD2P43304 SLC22A12-203ENST00000377572 2887 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GPD2P43304 GPSM1-202ENST00000354753 3533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GPD2P43304 ZNF133-203ENST00000377671 2701 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GPD2P43304 LCOR-202ENST00000356016 4834 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GPD2P43304 SLC35C2-201ENST00000243896 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GPD2P43304 IARS2-201ENST00000366922 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GPD2P43304 ALOX15-202ENST00000570836 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GPD2P43304 MPP2-214ENST00000523501 2121 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GPD2P43304 GLUL-203ENST00000339526 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GPD2P43304 ATXN10-202ENST00000381061 3135 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GPD2P43304 DIABLO-203ENST00000353548 1345 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GPD2P43304 SPIN2A-201ENST00000374906 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GPD2P43304 SAPCD2-201ENST00000409687 3848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GPD2P43304 KCNT1-208ENST00000488444 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GPD2P43304 NIPAL3-202ENST00000339255 1676 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GPD2P43304 B4GALNT3-201ENST00000266383 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GPD2P43304 CNBP-208ENST00000504813 1549 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GPD2P43304 ACSM2A-202ENST00000396104 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GPD2P43304 CTBP1-209ENST00000510568 4250 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GPD2P43304 AC004899.1-201ENST00000424687 1714 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
GPD2P43304 SMAD2-212ENST00000591214 1714 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GPD2P43304 CDKN2AIP-201ENST00000302350 2646 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GPD2P43304 DEF8-219ENST00000567874 1554 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GPD2P43304 PLPPR1-201ENST00000374874 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GPD2P43304 ZNF74-209ENST00000611540 3714 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GPD2P43304 DDC-AS1-201ENST00000454521 1776 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GPD2P43304 SPEG-205ENST00000396698 3379 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GPD2P43304 ARHGEF5-201ENST00000056217 5544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GPD2P43304 SLCO6A1-205ENST00000506729 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GPD2P43304 PRDM6-201ENST00000407847 9267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GPD2P43304 DUSP27-201ENST00000271385 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GPD2P43304 FAM120A-202ENST00000375389 3585 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GPD2P43304 ZFYVE28-201ENST00000290974 4131 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GPD2P43304 XK-201ENST00000378616 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GPD2P43304 TFE3-201ENST00000315869 3415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GPD2P43304 IER5-201ENST00000367577 4188 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GPD2P43304 EMC3-AS1-202ENST00000366264 559 ntTSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GPD2P43304 KRTAP10-13P-201ENST00000412914 571 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
GPD2P43304 ACTBP11-201ENST00000436287 1126 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
GPD2P43304 AC006122.1-201ENST00000493323 440 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
GPD2P43304 HLA-J-204ENST00000495278 958 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
GPD2P43304 GTF2H2C-215ENST00000514162 610 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GPD2P43304 FKBP5-203ENST00000539068 3827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GPD2P43304 AL122035.1-201ENST00000556640 550 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GPD2P43304 MUC1-226ENST00000614519 1093 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GPD2P43304 ABBA01031663.1-201ENST00000635630 790 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
GPD2P43304 CYP20A1-203ENST00000429815 1812 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GPD2P43304 SYT13-201ENST00000020926 5144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GPD2P43304 ELMSAN1-201ENST00000286523 8091 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GPD2P43304 IGF2BP2-202ENST00000382199 3688 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GPD2P43304 UBXN11-206ENST00000374222 2043 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GPD2P43304 DPY19L2P2-201ENST00000312132 4078 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GPD2P43304 TIGD1-201ENST00000408957 2625 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GPD2P43304 EML4-201ENST00000318522 5549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GPD2P43304 NXPH3-202ENST00000513748 1530 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GPD2P43304 RAB37-206ENST00000392615 2655 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GPD2P43304 POLR2B-205ENST00000441246 3839 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GPD2P43304 SPON1-201ENST00000576479 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GPD2P43304 RNF182-208ENST00000544682 3495 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GPD2P43304 LINC00475-202ENST00000416438 2506 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GPD2P43304 MTA1-202ENST00000405646 2709 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GPD2P43304 FAM90A7P-201ENST00000382628 1395 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
GPD2P43304 FAM90A23P-201ENST00000400136 1395 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
GPD2P43304 ATE1-203ENST00000369043 4900 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GPD2P43304 PAK3-208ENST00000446737 2550 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GPD2P43304 KIF19-202ENST00000389916 3643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GPD2P43304 TMCO3-207ENST00000474393 2843 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GPD2P43304 MAP3K11-208ENST00000530153 2830 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GPD2P43304 TNIP1-214ENST00000522226 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GPD2P43304 TMEM127-201ENST00000258439 6266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GPD2P43304 ZSWIM8-201ENST00000398706 6062 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GPD2P43304 ZBTB7C-204ENST00000586438 4899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GPD2P43304 WNT9B-202ENST00000393461 2654 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GPD2P43304 HARS2-201ENST00000230771 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GPD2P43304 MCL1-202ENST00000369026 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GPD2P43304 RAD51D-203ENST00000394589 2287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GPD2P43304 TIFA-201ENST00000361717 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GPD2P43304 ABR-228ENST00000574437 3196 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GPD2P43304 MPV17-201ENST00000233545 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GPD2P43304 RAB4B-201ENST00000357052 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GPD2P43304 MRPL55-214ENST00000366741 603 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GPD2P43304 MRPL55-218ENST00000366747 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GPD2P43304 BRWD1P1-201ENST00000401091 371 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.6 ms