Protein–RNA interactions for Protein: P35452

HOXD12, Homeobox protein Hox-D12, humanhuman

Predictions only

Length 270 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD12P35452 NAT9-211ENST00000580632 799 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
HOXD12P35452 ALKBH2-208ENST00000619381 895 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
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HOXD12P35452 FADS2-202ENST00000278840 3630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
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HOXD12P35452 CCNE1-202ENST00000357943 1641 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
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HOXD12P35452 CDPF1-203ENST00000404583 1439 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
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HOXD12P35452 CKMT1A-204ENST00000434505 1779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
HOXD12P35452 LINC00476-204ENST00000429781 2825 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
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HOXD12P35452 PPM1E-201ENST00000308249 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
HOXD12P35452 C14orf93-202ENST00000341470 2221 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
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HOXD12P35452 PPP4R3A-205ENST00000554684 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
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HOXD12P35452 PTPRO-201ENST00000281171 5301 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
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HOXD12P35452 AL031728.1-201ENST00000449034 2479 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
HOXD12P35452 RABL2B-204ENST00000395593 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
HOXD12P35452 DEPDC7-202ENST00000311388 2012 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
HOXD12P35452 PML-203ENST00000354026 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
HOXD12P35452 AC026688.2-201ENST00000518984 1734 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
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