Protein–RNA interactions for Protein: P26232

CTNNA2, Catenin alpha-2, humanhuman

Predictions only

Length 953 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTNNA2P26232 HDAC9-208ENST00000417496 2524 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CTNNA2P26232 FHDC1-202ENST00000511601 6583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CTNNA2P26232 KRT17-201ENST00000311208 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CTNNA2P26232 LINC01648-201ENST00000445180 1519 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CTNNA2P26232 RSPO3-201ENST00000356698 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CTNNA2P26232 GSN-209ENST00000449733 2702 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CTNNA2P26232 CCDC88A-204ENST00000413716 9586 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CTNNA2P26232 ALDH3A1-201ENST00000225740 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CTNNA2P26232 ELN-203ENST00000320492 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CTNNA2P26232 ELF4-201ENST00000308167 4165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CTNNA2P26232 NUBPL-201ENST00000281081 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CTNNA2P26232 SEMA4D-204ENST00000420101 1837 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CTNNA2P26232 SF3A1-201ENST00000215793 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CTNNA2P26232 SPAST-201ENST00000315285 5117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CTNNA2P26232 EXO5-201ENST00000296380 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CTNNA2P26232 ZKSCAN4-201ENST00000377294 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CTNNA2P26232 SMG9-211ENST00000601170 2387 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CTNNA2P26232 POLM-202ENST00000335195 2444 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CTNNA2P26232 AP1B1-208ENST00000432560 4146 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CTNNA2P26232 CCSER2-203ENST00000372088 7657 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CTNNA2P26232 PDE4A-209ENST00000592685 2707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CTNNA2P26232 PFAS-201ENST00000314666 5371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CTNNA2P26232 RPL39L-201ENST00000296277 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CTNNA2P26232 CKS1B-202ENST00000368436 820 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CTNNA2P26232 ADM2-201ENST00000395737 535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CTNNA2P26232 PGGT1BP2-201ENST00000398621 1028 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
CTNNA2P26232 ADAMTSL1-210ENST00000431052 824 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CTNNA2P26232 LINC01818-201ENST00000437118 368 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CTNNA2P26232 MYCLP2-201ENST00000449268 967 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
CTNNA2P26232 FO681548.1-201ENST00000455617 1132 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
CTNNA2P26232 AC092183.1-201ENST00000469884 875 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
CTNNA2P26232 AC064807.1-203ENST00000520357 575 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CTNNA2P26232 AC084125.2-203ENST00000532766 821 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CTNNA2P26232 BCAT2-203ENST00000545387 1272 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CTNNA2P26232 VPS18-202ENST00000558474 873 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CTNNA2P26232 CLUHP6-201ENST00000580789 941 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
CTNNA2P26232 TUBB6-203ENST00000586653 788 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CTNNA2P26232 AC011491.2-201ENST00000599584 447 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CTNNA2P26232 AC133539.2-201ENST00000604757 467 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
CTNNA2P26232 AC004233.3-201ENST00000607794 1269 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
CTNNA2P26232 OLFML2A-203ENST00000373580 6425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CTNNA2P26232 ZDHHC11B-204ENST00000622126 1301 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CTNNA2P26232 VASH1-203ENST00000554237 1462 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CTNNA2P26232 CD81-201ENST00000263645 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CTNNA2P26232 MIIP-201ENST00000235332 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CTNNA2P26232 PRAMEF8-202ENST00000614831 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CTNNA2P26232 PRAMEF7-202ENST00000616979 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CTNNA2P26232 NT5C3A-213ENST00000610140 1670 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CTNNA2P26232 DHRS4-AS1-204ENST00000555045 1848 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CTNNA2P26232 STRA6-205ENST00000432245 1889 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CTNNA2P26232 PGLYRP4-202ENST00000368739 2116 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CTNNA2P26232 GATB-201ENST00000263985 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CTNNA2P26232 GSE1-202ENST00000393243 7140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CTNNA2P26232 FAM189A2-201ENST00000257515 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CTNNA2P26232 GPRC5A-201ENST00000014914 7362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CTNNA2P26232 ADAM15-206ENST00000368412 2804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CTNNA2P26232 CARMIL2-202ENST00000545661 4119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CTNNA2P26232 MAPRE2-201ENST00000300249 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CTNNA2P26232 KBTBD7-201ENST00000379483 4734 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CTNNA2P26232 IRAK1-203ENST00000369980 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CTNNA2P26232 TRIM65-201ENST00000269383 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CTNNA2P26232 FAM160A2-202ENST00000449352 3354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CTNNA2P26232 SLC25A35-201ENST00000380067 2785 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CTNNA2P26232 HSD17B4-222ENST00000515320 2494 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CTNNA2P26232 MSTO1-202ENST00000368341 2245 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CTNNA2P26232 MPP2-214ENST00000523501 2121 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CTNNA2P26232 SDHAF2-201ENST00000301761 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CTNNA2P26232 AC087521.1-201ENST00000501541 2045 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CTNNA2P26232 ARAP1-202ENST00000359373 5767 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CTNNA2P26232 ABAT-203ENST00000425191 1923 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CTNNA2P26232 STRCP1-201ENST00000509801 5328 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
CTNNA2P26232 AAAS-217ENST00000550286 1652 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CTNNA2P26232 CRISPLD2-203ENST00000564567 1651 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CTNNA2P26232 AC015688.4-201ENST00000580780 1647 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
CTNNA2P26232 XAF1-201ENST00000346752 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CTNNA2P26232 NTMT1-204ENST00000372486 1487 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CTNNA2P26232 PKIG-204ENST00000372889 1489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CTNNA2P26232 LRRC8C-201ENST00000370454 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CTNNA2P26232 SNRNP27-202ENST00000409116 1339 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CTNNA2P26232 NCR3-201ENST00000340027 1042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CTNNA2P26232 FAM104B-202ENST00000358460 1179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CTNNA2P26232 TAF8-202ENST00000372978 794 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CTNNA2P26232 MRPS6-201ENST00000399312 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CTNNA2P26232 CDRT15-201ENST00000420162 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CTNNA2P26232 LNCPRESS1-201ENST00000429254 756 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CTNNA2P26232 CDRT15-202ENST00000431716 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CTNNA2P26232 SNHG11-209ENST00000440918 556 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CTNNA2P26232 AC026774.1-201ENST00000503652 691 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CTNNA2P26232 CPLX2-206ENST00000512824 518 ntTSL 4 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CTNNA2P26232 SBSN-202ENST00000518157 957 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CTNNA2P26232 ENPP7P5-201ENST00000541031 1031 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
CTNNA2P26232 FKBP11-208ENST00000550765 1030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CTNNA2P26232 AC009088.3-201ENST00000563605 357 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CTNNA2P26232 DHRS7C-202ENST00000571134 984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CTNNA2P26232 AC068473.4-201ENST00000587527 585 ntTSL 4 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CTNNA2P26232 ERCC1-212ENST00000591636 836 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CTNNA2P26232 AL356481.3-201ENST00000630523 575 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CTNNA2P26232 DDN-201ENST00000421952 3749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CTNNA2P26232 IGF2BP2-202ENST00000382199 3688 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CTNNA2P26232 MFSD11-211ENST00000588460 3612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 88.9 ms