Protein–RNA interactions for Protein: P23469

PTPRE, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase epsilon, humanhuman

Predictions only

Length 700 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPREP23469 AL589740.1-203ENST00000433637 1984 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
PTPREP23469 AC015802.1-201ENST00000588104 1449 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
PTPREP23469 UBC-205ENST00000536769 3745 ntAPPRIS P1 BASIC17.11■□□□□ 0.33
PTPREP23469 GPBAR1-203ENST00000521462 1465 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
PTPREP23469 AC068587.6-202ENST00000641839 5619 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
PTPREP23469 AC011840.2-201ENST00000563063 1520 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
PTPREP23469 ALOX15-202ENST00000570836 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
PTPREP23469 BCL10-201ENST00000370580 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PTPREP23469 ZBED1-201ENST00000381218 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PTPREP23469 TANGO2-205ENST00000401886 1559 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
PTPREP23469 GJD2-201ENST00000290374 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PTPREP23469 TNFAIP8L3-201ENST00000327536 2262 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PTPREP23469 GABPB1-202ENST00000359031 1633 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
PTPREP23469 JRK-210ENST00000614134 8932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PTPREP23469 SLC39A6-202ENST00000440549 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PTPREP23469 TPGS2-202ENST00000383056 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PTPREP23469 COMP-201ENST00000222271 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PTPREP23469 PLA1A-205ENST00000494440 1775 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PTPREP23469 GGT1-202ENST00000400380 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PTPREP23469 NF2-210ENST00000413209 4733 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PTPREP23469 BMP7-201ENST00000395863 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PTPREP23469 AC020910.5-201ENST00000623668 1865 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
PTPREP23469 DNAJC10-210ENST00000616986 5783 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PTPREP23469 GLG1-203ENST00000447066 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
PTPREP23469 INHBA-205ENST00000638023 2002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
PTPREP23469 GSTCD-206ENST00000507281 2091 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
PTPREP23469 NRP2-203ENST00000357785 2926 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PTPREP23469 USP45-201ENST00000327681 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PTPREP23469 TEAD3-201ENST00000338863 2983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PTPREP23469 VCPKMT-201ENST00000395859 795 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PTPREP23469 HNRNPA1P41-201ENST00000397777 928 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
PTPREP23469 AC073316.1-202ENST00000402115 988 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
PTPREP23469 ISCA2P1-201ENST00000425548 448 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
PTPREP23469 SRSF10-211ENST00000484146 1089 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
PTPREP23469 HLA-J-204ENST00000495278 958 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
PTPREP23469 CPLX2-209ENST00000515094 576 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.1■□□□□ 0.33
PTPREP23469 EEF1D-218ENST00000526838 926 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
PTPREP23469 AC008736.2-201ENST00000587554 516 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
PTPREP23469 AC011498.6-201ENST00000592034 510 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
PTPREP23469 NDUFB5-216ENST00000611971 951 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
PTPREP23469 SCP2-217ENST00000640998 1101 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
PTPREP23469 SIK1-201ENST00000270162 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PTPREP23469 CU639417.2-201ENST00000613488 4705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PTPREP23469 FZD4-201ENST00000531380 7383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PTPREP23469 GLG1-201ENST00000205061 8261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PTPREP23469 ARHGEF16-203ENST00000378378 3061 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
PTPREP23469 FBXO5-202ENST00000367241 2221 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PTPREP23469 LPAR5-201ENST00000329858 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PTPREP23469 CYP4F11-203ENST00000402119 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PTPREP23469 PIGC-201ENST00000344529 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PTPREP23469 DLX4-202ENST00000411890 1404 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PTPREP23469 SPRY4-202ENST00000434127 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PTPREP23469 PTOV1-214ENST00000600603 1443 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PTPREP23469 ALG12-201ENST00000330817 5350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PTPREP23469 MVK-214ENST00000629016 1591 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
PTPREP23469 SLCO6A1-205ENST00000506729 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PTPREP23469 GAS2L2-203ENST00000618498 2655 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PTPREP23469 FAM110C-201ENST00000327669 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PTPREP23469 CAMK2B-206ENST00000353625 1624 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PTPREP23469 MOCS1-205ENST00000373195 2852 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
PTPREP23469 POLR2E-211ENST00000612655 1749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
PTPREP23469 SRRT-217ENST00000618411 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PTPREP23469 ATG5-201ENST00000343245 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PTPREP23469 GOLGA8R-201ENST00000327271 1896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
PTPREP23469 DTX3-202ENST00000548198 3199 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
PTPREP23469 BRF1-211ENST00000547530 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PTPREP23469 PKD1P5-201ENST00000532415 10291 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
PTPREP23469 AL365205.1-204ENST00000359201 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PTPREP23469 VARS2-211ENST00000541562 3566 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
PTPREP23469 TIMP2-201ENST00000262768 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PTPREP23469 HNRNPUL1-201ENST00000263367 2952 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
PTPREP23469 BIRC2-214ENST00000621637 3331 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
PTPREP23469 RHOXF1-201ENST00000217999 769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PTPREP23469 CELA3B-201ENST00000337107 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PTPREP23469 RN7SKP230-201ENST00000365642 335 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
PTPREP23469 CD1E-202ENST00000368155 696 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PTPREP23469 CD1E-204ENST00000368157 399 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PTPREP23469 RBM38-204ENST00000371219 760 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
PTPREP23469 DYDC1-201ENST00000372202 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
PTPREP23469 TCEAL6-201ENST00000372773 983 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
PTPREP23469 NRM-202ENST00000376420 1228 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PTPREP23469 AC131097.2-203ENST00000401641 507 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
PTPREP23469 RPL17P11-201ENST00000417593 544 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
PTPREP23469 Z82214.1-201ENST00000419643 988 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
PTPREP23469 VDAC1P1-201ENST00000439229 848 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
PTPREP23469 CEP164P1-201ENST00000455142 418 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
PTPREP23469 TPT1P11-201ENST00000458482 498 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
PTPREP23469 LINC02046-201ENST00000469812 378 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
PTPREP23469 AC117500.3-201ENST00000537032 666 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PTPREP23469 NRN1L-202ENST00000576147 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
PTPREP23469 AC006453.1-201ENST00000636037 1257 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
PTPREP23469 TDRD6-201ENST00000316081 6817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PTPREP23469 STAMBPL1-204ENST00000371927 4184 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
PTPREP23469 SLC41A3-211ENST00000508835 1480 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
PTPREP23469 KRT17-201ENST00000311208 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PTPREP23469 CCNE1-202ENST00000357943 1641 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PTPREP23469 HCG27-201ENST00000383331 1720 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PTPREP23469 CRELD1-203ENST00000397170 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
PTPREP23469 BTNL8-206ENST00000508408 1717 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PTPREP23469 RNF122-201ENST00000256257 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.5 ms