Protein–RNA interactions for Protein: P23327

HRC, Sarcoplasmic reticulum histidine-rich calcium-binding protein, humanhuman

Predictions only

Length 699 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HRCP23327 TEX26-AS1-201ENST00000411835 1203 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
HRCP23327 AP006294.1-201ENST00000415407 339 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
HRCP23327 MRNIP-220ENST00000523084 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
HRCP23327 C14orf178-204ENST00000557011 474 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
HRCP23327 AP001063.1-201ENST00000568332 529 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
HRCP23327 FP236240.1-202ENST00000624019 601 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
HRCP23327 ARHGEF4-217ENST00000611048 3486 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
HRCP23327 KIAA1211L-201ENST00000397899 3907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
HRCP23327 PTPRS-205ENST00000588012 5993 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
HRCP23327 RPUSD4-201ENST00000298317 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
HRCP23327 SLC25A3-217ENST00000552981 1351 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
HRCP23327 PSMG3-AS1-201ENST00000437621 5701 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
HRCP23327 AUTS2-217ENST00000611706 4583 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
HRCP23327 PIK3CD-206ENST00000536656 5483 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
HRCP23327 DHRS4-AS1-204ENST00000555045 1848 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
HRCP23327 PIK3CD-208ENST00000628140 5483 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
HRCP23327 CENPL-202ENST00000356198 2357 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
HRCP23327 ALDH8A1-204ENST00000367847 1587 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
HRCP23327 DIS3L2-205ENST00000409401 2048 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
HRCP23327 SP6-202ENST00000536300 3848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
HRCP23327 CCDC110-209ENST00000510617 2592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
HRCP23327 AC016245.1-201ENST00000570335 3204 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
HRCP23327 AC073869.1-201ENST00000415574 2762 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
HRCP23327 FOXJ2-201ENST00000162391 5523 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
HRCP23327 SNAP91-215ENST00000521743 4263 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
HRCP23327 CCDC47-201ENST00000225726 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
HRCP23327 VRK3-207ENST00000594092 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
HRCP23327 GRIN2C-201ENST00000293190 4261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
HRCP23327 KIAA1468-202ENST00000398130 6178 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
HRCP23327 TEX12-201ENST00000280358 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
HRCP23327 LINC01116-202ENST00000339037 838 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
HRCP23327 AC099548.2-204ENST00000481651 2106 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
HRCP23327 AC022137.2-201ENST00000503482 481 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
HRCP23327 AC008750.2-202ENST00000532688 729 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
HRCP23327 AC105339.1-202ENST00000559535 1283 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
HRCP23327 AC111170.2-201ENST00000585369 768 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
HRCP23327 AP005019.2-201ENST00000615104 511 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
HRCP23327 TP53INP1-201ENST00000342697 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
HRCP23327 NCF2-201ENST00000367535 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
HRCP23327 AC072061.1-201ENST00000569710 2234 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
HRCP23327 FYCO1-205ENST00000535325 8578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
HRCP23327 NPHP4-201ENST00000378156 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
HRCP23327 CD34-203ENST00000367036 2538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
HRCP23327 PCDH10-201ENST00000264360 8489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
HRCP23327 TFR2-205ENST00000462107 3131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
HRCP23327 TMEM30B-202ENST00000555868 4471 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.24
HRCP23327 JOSD1-201ENST00000216039 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
HRCP23327 TTC14-202ENST00000382584 2274 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
HRCP23327 LINC01285-201ENST00000412422 2289 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
HRCP23327 CRACR2A-203ENST00000440314 2697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
HRCP23327 GNS-201ENST00000258145 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
HRCP23327 AL360270.3-201ENST00000609118 1348 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
HRCP23327 ITGAV-202ENST00000374907 6903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
HRCP23327 CIART-203ENST00000369095 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
HRCP23327 OIT3-202ENST00000622652 1602 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
HRCP23327 HMGA1-203ENST00000374116 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
HRCP23327 PIGT-202ENST00000279036 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
HRCP23327 OSBPL9-201ENST00000361556 2721 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
HRCP23327 NUTM2E-202ENST00000602967 3623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
HRCP23327 MBD1-224ENST00000591416 4905 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
HRCP23327 FBLIM1-203ENST00000375771 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
HRCP23327 AC004846.1-201ENST00000554614 3050 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
HRCP23327 CTNNBL1-209ENST00000621317 1990 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
HRCP23327 CFAP157-206ENST00000614677 1796 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
HRCP23327 SNUPN-206ENST00000564675 1682 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
HRCP23327 LGALSL-201ENST00000238875 3926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
HRCP23327 LSM5-207ENST00000410044 687 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
HRCP23327 RN7SL692P-201ENST00000464677 288 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
HRCP23327 CDK2AP2-205ENST00000531506 634 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
HRCP23327 SNX12-206ENST00000622259 661 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
HRCP23327 RNF145-202ENST00000424310 3613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
HRCP23327 S100PBP-203ENST00000373476 3320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
HRCP23327 ENG-202ENST00000373203 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
HRCP23327 NIPA1-201ENST00000337435 6567 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
HRCP23327 ZNF331-217ENST00000512387 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
HRCP23327 DUS2-201ENST00000358896 1933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
HRCP23327 RBM47-203ENST00000381795 4473 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
HRCP23327 RGR-201ENST00000358110 1349 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
HRCP23327 ITGB3-201ENST00000559488 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
HRCP23327 AC006504.5-203ENST00000590628 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
HRCP23327 PKD1P5-201ENST00000532415 10291 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
HRCP23327 RSPO1-202ENST00000401068 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
HRCP23327 CREB3L4-204ENST00000368603 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
HRCP23327 TANGO2-205ENST00000401886 1559 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
HRCP23327 TSPEAR-AS1-202ENST00000451035 2108 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
HRCP23327 PTGFRN-201ENST00000393203 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
HRCP23327 CCDC88C-201ENST00000331194 3104 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
HRCP23327 DDC-213ENST00000617822 1809 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
HRCP23327 ENO2-205ENST00000535366 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
HRCP23327 VCX2-201ENST00000317103 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
HRCP23327 LDLRAD1-201ENST00000371360 785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
HRCP23327 C9orf24-204ENST00000379127 596 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
HRCP23327 AL929472.3-201ENST00000433474 700 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
HRCP23327 AC114812.1-204ENST00000449669 728 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
HRCP23327 TMEM191A-209ENST00000452055 788 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
HRCP23327 AC005342.2-201ENST00000544163 315 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
HRCP23327 AC005262.2-201ENST00000587701 452 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
HRCP23327 VCX-203ENST00000620630 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
HRCP23327 BX539320.1-201ENST00000623759 877 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
HRCP23327 AL603764.1-201ENST00000636452 321 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.5 ms