Protein–RNA interactions for Protein: P18858

LIG1, DNA ligase 1, humanhuman

Predictions only

Length 919 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LIG1P18858 GP1BA-202ENST00000611961 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
LIG1P18858 ALDH3A1-201ENST00000225740 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
LIG1P18858 TRPV4-202ENST00000418703 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
LIG1P18858 JKAMP-207ENST00000554271 2137 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
LIG1P18858 MEFV-201ENST00000219596 3499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
LIG1P18858 SFMBT1-201ENST00000394752 4548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
LIG1P18858 CREB3L4-202ENST00000368600 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
LIG1P18858 ARAP1-203ENST00000393605 4778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
LIG1P18858 ADD3-202ENST00000356080 3081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
LIG1P18858 MST1-202ENST00000449682 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
LIG1P18858 ZFP64-203ENST00000361387 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
LIG1P18858 MGC16275-201ENST00000499670 2501 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
LIG1P18858 NUTM2G-201ENST00000354649 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
LIG1P18858 ZFYVE27-202ENST00000357540 2765 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
LIG1P18858 ZFYVE27-204ENST00000370610 2769 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
LIG1P18858 ZFP28-204ENST00000591844 3475 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
LIG1P18858 NDUFB7-201ENST00000215565 531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
LIG1P18858 VAPA-201ENST00000340541 1227 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
LIG1P18858 PRKN-203ENST00000366894 1157 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
LIG1P18858 COPS6-202ENST00000418625 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
LIG1P18858 AC112492.5-201ENST00000421897 457 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
LIG1P18858 NUS1P3-201ENST00000423502 862 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
LIG1P18858 Z98749.2-201ENST00000428294 700 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
LIG1P18858 CROCCP4-201ENST00000457096 498 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
LIG1P18858 TMEM161B-AS1-212ENST00000513011 833 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
LIG1P18858 ACRV1-202ENST00000527795 782 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
LIG1P18858 SLC25A47P1-201ENST00000531577 414 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
LIG1P18858 KRT17P8-201ENST00000540749 863 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
LIG1P18858 SMIM24-203ENST00000587847 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
LIG1P18858 UBE2E3-205ENST00000602475 602 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
LIG1P18858 TPTE2P2-205ENST00000606711 505 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
LIG1P18858 MXD1-206ENST00000540449 5580 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
LIG1P18858 KIF1C-201ENST00000320785 7919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
LIG1P18858 COQ8A-203ENST00000366779 5523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
LIG1P18858 EFCAB2-202ENST00000366522 6167 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
LIG1P18858 C2-205ENST00000418949 1658 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
LIG1P18858 PTPRO-201ENST00000281171 5301 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
LIG1P18858 AP5Z1-201ENST00000348624 2901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
LIG1P18858 HSPA8P5-201ENST00000456928 2069 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
LIG1P18858 HIPK3-203ENST00000456517 7399 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
LIG1P18858 IRF2BP2-201ENST00000366609 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
LIG1P18858 TMEM200C-202ENST00000581347 10638 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
LIG1P18858 INTS14-201ENST00000313182 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
LIG1P18858 TOMM40L-201ENST00000367987 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
LIG1P18858 ARMCX1-201ENST00000372829 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
LIG1P18858 FAM172A-204ENST00000505869 1387 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
LIG1P18858 NEU3-206ENST00000532963 1643 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
LIG1P18858 CGB5-201ENST00000301408 841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
LIG1P18858 SLC19A1-201ENST00000311124 3811 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
LIG1P18858 C1orf43-205ENST00000368519 1163 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
LIG1P18858 EIF1AX-201ENST00000379593 765 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
LIG1P18858 CPLX2-202ENST00000393745 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
LIG1P18858 AL121601.1-201ENST00000426367 326 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
LIG1P18858 ACTG1P3-201ENST00000431775 1114 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
LIG1P18858 GPR53P-205ENST00000457298 1084 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
LIG1P18858 AC068587.3-201ENST00000526613 355 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
LIG1P18858 RAB43P1-201ENST00000561790 589 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
LIG1P18858 AC007611.1-201ENST00000568150 826 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
LIG1P18858 AP001063.1-201ENST00000568332 529 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
LIG1P18858 AC005262.2-201ENST00000587701 452 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
LIG1P18858 ZSCAN30-208ENST00000592278 731 ntTSL 4 BASIC16.93■□□□□ 0.3
LIG1P18858 AC015936.2-201ENST00000593177 259 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
LIG1P18858 IER3IP1-202ENST00000639845 832 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
LIG1P18858 AC079447.1-201ENST00000424491 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
LIG1P18858 SIRT5-203ENST00000379262 2339 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
LIG1P18858 SLC12A8-207ENST00000469902 2989 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
LIG1P18858 UCP3-202ENST00000426995 1406 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
LIG1P18858 PHF24-201ENST00000242315 5718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
LIG1P18858 RUFY1-202ENST00000393438 2454 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
LIG1P18858 AC027288.3-202ENST00000550268 1820 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
LIG1P18858 MEX3B-201ENST00000329713 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
LIG1P18858 SPATA6-204ENST00000396199 4964 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
LIG1P18858 WBP4-201ENST00000379487 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
LIG1P18858 POLRMT-202ENST00000588649 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
LIG1P18858 COMT-205ENST00000406520 1339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
LIG1P18858 AC134312.5-201ENST00000568031 1313 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
LIG1P18858 ANKMY1-208ENST00000405002 3304 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
LIG1P18858 ADAT1-201ENST00000307921 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
LIG1P18858 TOM1L1-201ENST00000348161 1895 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
LIG1P18858 INPP5E-201ENST00000371712 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
LIG1P18858 ARMCX4-202ENST00000423738 7424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
LIG1P18858 PLLP-205ENST00000613167 7578 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
LIG1P18858 LHFPL4-201ENST00000287585 4880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
LIG1P18858 MLLT11-201ENST00000368921 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
LIG1P18858 CYP4B1-201ENST00000271153 2171 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
LIG1P18858 MFSD2B-201ENST00000338315 2850 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
LIG1P18858 AP002990.1-202ENST00000496634 5064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
LIG1P18858 LIG1-202ENST00000427526 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
LIG1P18858 TBCEL-205ENST00000529397 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
LIG1P18858 AL136172.1-201ENST00000598590 1394 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
LIG1P18858 RUBCNL-212ENST00000631139 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
LIG1P18858 CSNK1D-202ENST00000314028 3712 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
LIG1P18858 ANO9-201ENST00000332826 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
LIG1P18858 MPZ-204ENST00000491222 1824 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
LIG1P18858 UEVLD-201ENST00000300038 995 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
LIG1P18858 OR8S1-201ENST00000310194 1080 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
LIG1P18858 RHCE-205ENST00000349438 1235 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
LIG1P18858 PNRC1-203ENST00000369472 816 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
LIG1P18858 TEX30-203ENST00000376022 828 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
LIG1P18858 ATP5D-202ENST00000395633 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.1 ms