Protein–RNA interactions for Protein: P17987

TCP1, T-complex protein 1 subunit alpha, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 556 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCP1P17987 NFATC3-203ENST00000349223 6328 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TCP1P17987 ATP2C1-201ENST00000328560 3484 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TCP1P17987 RAB37-216ENST00000613645 1653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TCP1P17987 PSMG3-201ENST00000252329 1007 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TCP1P17987 CA4-201ENST00000300900 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TCP1P17987 NRIP3-201ENST00000309166 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TCP1P17987 DERL3-204ENST00000406855 1063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TCP1P17987 KLF2P2-201ENST00000416807 1039 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
TCP1P17987 AL161785.2-201ENST00000427080 966 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TCP1P17987 COX10-202ENST00000429152 875 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TCP1P17987 NICN1-204ENST00000436744 1271 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TCP1P17987 BMP7-AS1-201ENST00000445956 436 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TCP1P17987 ST7-OT4-203ENST00000466018 894 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TCP1P17987 ZNF789-211ENST00000493485 556 ntTSL 4 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TCP1P17987 LINC01605-204ENST00000522718 1093 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TCP1P17987 AC009163.1-201ENST00000530512 573 ntTSL 4 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TCP1P17987 AC027088.1-201ENST00000557966 1117 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TCP1P17987 AC015911.4-201ENST00000588022 1070 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
TCP1P17987 BRI3BPP1-201ENST00000594224 787 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
TCP1P17987 AL671883.3-201ENST00000603274 991 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
TCP1P17987 LINC00623-201ENST00000613486 486 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TCP1P17987 HEPACAM-201ENST00000298251 3602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TCP1P17987 PML-202ENST00000268059 3029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TCP1P17987 C14orf39-201ENST00000321731 2813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TCP1P17987 TBC1D22A-201ENST00000337137 3787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TCP1P17987 PAWR-201ENST00000328827 9129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TCP1P17987 SMAD2-202ENST00000356825 10445 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TCP1P17987 LRP8-203ENST00000354412 2553 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TCP1P17987 SSBP2-220ENST00000615665 4465 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TCP1P17987 PPP6R2-203ENST00000395741 3304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TCP1P17987 ATP6AP2-211ENST00000636196 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TCP1P17987 ELAVL4-207ENST00000448907 1951 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TCP1P17987 TNFRSF11A-205ENST00000616710 3809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TCP1P17987 RGS9-210ENST00000635833 2308 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TCP1P17987 CCDC57-203ENST00000392343 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TCP1P17987 MIIP-201ENST00000235332 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TCP1P17987 RTFDC1-201ENST00000023939 1745 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TCP1P17987 MECP2-217ENST00000628176 1712 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TCP1P17987 SLC12A8-207ENST00000469902 2989 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TCP1P17987 SLC52A1-203ENST00000512825 2989 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TCP1P17987 CTCFL-210ENST00000481655 1512 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TCP1P17987 CPPED1-201ENST00000261660 1898 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TCP1P17987 YWHAQ-201ENST00000238081 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TCP1P17987 RPS28-203ENST00000600659 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TCP1P17987 UBA6-202ENST00000420827 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TCP1P17987 SDR16C5-202ENST00000396721 2399 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TCP1P17987 AP1B1-208ENST00000432560 4146 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TCP1P17987 CPSF1-212ENST00000616140 4494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TCP1P17987 DDX21-202ENST00000620315 4829 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TCP1P17987 ABCA7-202ENST00000433129 6704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TCP1P17987 NR3C1-201ENST00000231509 3556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TCP1P17987 ATXN7-201ENST00000295900 7224 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TCP1P17987 COG3-206ENST00000617493 1809 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TCP1P17987 FBP1-203ENST00000415431 1487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TCP1P17987 PLIN4-202ENST00000633942 6484 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TCP1P17987 TUNAR-201ENST00000503525 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TCP1P17987 RIPOR3-202ENST00000327979 4377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TCP1P17987 BANF1-201ENST00000312175 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TCP1P17987 FIBP-201ENST00000338369 1261 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TCP1P17987 UPF3AP3-201ENST00000420996 769 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
TCP1P17987 PNPO-202ENST00000434554 1196 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TCP1P17987 MOGAT3-203ENST00000440203 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TCP1P17987 FOLR3-201ENST00000442948 805 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TCP1P17987 VPS52-212ENST00000445902 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TCP1P17987 AC093879.1-201ENST00000508959 1176 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TCP1P17987 SPDYE18-201ENST00000510091 1050 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
TCP1P17987 CHCHD7-211ENST00000521831 573 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TCP1P17987 AC092718.3-202ENST00000564536 1032 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TCP1P17987 DHRS7C-202ENST00000571134 984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TCP1P17987 LINC01703-202ENST00000602806 595 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TCP1P17987 GRIFIN-202ENST00000614228 461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TCP1P17987 AGAP1-213ENST00000619456 1057 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TCP1P17987 FBXL7-203ENST00000510662 1758 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TCP1P17987 CLN8-204ENST00000519254 1769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TCP1P17987 GSTM4-204ENST00000369836 1412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TCP1P17987 BIN3-205ENST00000519513 1431 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TCP1P17987 NFIC-201ENST00000341919 1573 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TCP1P17987 REV1-202ENST00000393445 4686 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TCP1P17987 KARS-201ENST00000302445 2005 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TCP1P17987 PCMTD1-201ENST00000360540 4252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TCP1P17987 SLC26A6-213ENST00000455886 2460 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TCP1P17987 PHLDB2-203ENST00000412622 5996 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TCP1P17987 TRIM23-202ENST00000274327 1829 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TCP1P17987 PBX3-201ENST00000342287 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TCP1P17987 ALAS1-204ENST00000469224 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TCP1P17987 INPP5E-201ENST00000371712 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TCP1P17987 SLC4A8-205ENST00000535225 2262 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TCP1P17987 NAP1L2-201ENST00000373517 2550 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TCP1P17987 APBB2-211ENST00000506352 3316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TCP1P17987 DUSP28-202ENST00000405954 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TCP1P17987 NEFH-201ENST00000310624 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TCP1P17987 HELZ2-204ENST00000467148 8064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TCP1P17987 TLN1-201ENST00000314888 8823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TCP1P17987 ABCG8-201ENST00000272286 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TCP1P17987 CLCN7-201ENST00000262318 3717 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TCP1P17987 FOXP1-202ENST00000318789 7114 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TCP1P17987 TSPAN4-201ENST00000346501 882 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TCP1P17987 CHIA-203ENST00000353665 1214 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TCP1P17987 LMAN2L-202ENST00000377079 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TCP1P17987 ACOT7-203ENST00000377845 1432 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.4 ms