Protein–RNA interactions for Protein: P17861

XBP1, X-box-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XBP1P17861 HIF3A-206ENST00000472815 1709 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
XBP1P17861 GAS2L2-203ENST00000618498 2655 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
XBP1P17861 IMPDH1-201ENST00000338791 2881 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
XBP1P17861 IMPDH1-217ENST00000626419 2862 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
XBP1P17861 TKT-201ENST00000296289 1931 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
XBP1P17861 FANCG-201ENST00000378643 2631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
XBP1P17861 ROCK1-201ENST00000399799 9484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
XBP1P17861 CELF1-201ENST00000310513 4583 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
XBP1P17861 ELF3-202ENST00000367283 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
XBP1P17861 CDK16-202ENST00000357227 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
XBP1P17861 CD48-203ENST00000613788 1500 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
XBP1P17861 SIGLEC9-202ENST00000440804 1960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
XBP1P17861 DMTN-205ENST00000432128 2508 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
XBP1P17861 AIPL1-207ENST00000574506 2074 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
XBP1P17861 FBXO3-203ENST00000526785 5798 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
XBP1P17861 FSTL4-201ENST00000265342 5419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
XBP1P17861 RPP14-202ENST00000445193 7985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
XBP1P17861 WASHC2A-203ENST00000351071 4642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
XBP1P17861 UBASH3A-203ENST00000398367 1733 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
XBP1P17861 MCM3AP-AS1-203ENST00000421927 2280 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
XBP1P17861 LCN9-201ENST00000277526 531 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
XBP1P17861 NPPC-201ENST00000295440 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
XBP1P17861 RBM38-204ENST00000371219 760 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
XBP1P17861 TCEAL1-203ENST00000372626 721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
XBP1P17861 SKA2-202ENST00000437036 625 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
XBP1P17861 RNASEH1-AS1-202ENST00000438436 1218 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
XBP1P17861 AC010745.3-201ENST00000439745 415 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
XBP1P17861 IFI27L1-210ENST00000556381 804 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
XBP1P17861 SORD2P-201ENST00000558556 1069 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
XBP1P17861 AC110285.3-201ENST00000574472 665 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
XBP1P17861 AC011447.3-204ENST00000585498 883 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
XBP1P17861 HIST1H3I-201ENST00000616365 411 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
XBP1P17861 LCN9-204ENST00000619315 528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
XBP1P17861 SLC7A8-212ENST00000529705 1819 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
XBP1P17861 PXN-221ENST00000637617 3246 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
XBP1P17861 NEDD4L-238ENST00000635997 4402 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
XBP1P17861 PNPLA6-201ENST00000221249 4617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
XBP1P17861 RIC1-201ENST00000251879 4127 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
XBP1P17861 RHOH-220ENST00000615083 2156 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.96■□□□□ 0.31
XBP1P17861 DTX3L-201ENST00000296161 5868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
XBP1P17861 PCM1-201ENST00000325083 6820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
XBP1P17861 PLXNB3-209ENST00000538966 6377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
XBP1P17861 GAD2-201ENST00000259271 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
XBP1P17861 WARS-203ENST00000358655 2466 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
XBP1P17861 KCTD3-201ENST00000259154 3931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
XBP1P17861 PDE8A-203ENST00000394553 3912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
XBP1P17861 ADORA1-201ENST00000309502 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
XBP1P17861 AKR1A1-202ENST00000372070 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
XBP1P17861 DISC1-222ENST00000622252 6927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
XBP1P17861 AC026992.2-202ENST00000565312 1934 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
XBP1P17861 PODN-202ENST00000371500 3287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
XBP1P17861 AC152010.1-201ENST00000415779 2006 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
XBP1P17861 ADGRA1-AS1-202ENST00000444433 2646 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
XBP1P17861 PHTF1-202ENST00000369598 3000 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
XBP1P17861 ACSL1-201ENST00000281455 3832 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
XBP1P17861 CLRN1-203ENST00000328863 738 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
XBP1P17861 CSAG1-202ENST00000370287 875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
XBP1P17861 PLAC9-201ENST00000372263 785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
XBP1P17861 TPO-206ENST00000382269 1155 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
XBP1P17861 STX1A-203ENST00000395155 783 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
XBP1P17861 RBAK-RBAKDN-201ENST00000396904 766 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC16.96■□□□□ 0.31
XBP1P17861 RBAK-RBAKDN-202ENST00000407184 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
XBP1P17861 AC079178.1-201ENST00000420915 656 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
XBP1P17861 GEMIN4-202ENST00000437269 1182 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
XBP1P17861 AL354710.2-201ENST00000468244 550 ntTSL 4 BASIC16.96■□□□□ 0.31
XBP1P17861 AC104596.1-201ENST00000507826 579 ntTSL 4 BASIC16.96■□□□□ 0.31
XBP1P17861 AC027237.1-201ENST00000560942 655 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
XBP1P17861 DYNLRB2-205ENST00000568035 409 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
XBP1P17861 C1QTNF1-AS1-202ENST00000581579 865 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
XBP1P17861 MIR6775-201ENST00000617557 69 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
XBP1P17861 CYP1B1-AS1-221ENST00000627172 995 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
XBP1P17861 LYRM1-203ENST00000412082 1399 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
XBP1P17861 KRT8P28-201ENST00000433288 1390 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
XBP1P17861 PSMC3-209ENST00000530912 1390 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
XBP1P17861 PDZD7-206ENST00000619208 4135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
XBP1P17861 OGFOD1-209ENST00000568397 1681 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
XBP1P17861 PRELP-201ENST00000343110 5747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
XBP1P17861 FOS-201ENST00000303562 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
XBP1P17861 SYT9-201ENST00000318881 3955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
XBP1P17861 TRPM1-203ENST00000542188 6004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
XBP1P17861 AC090826.2-201ENST00000568496 4946 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
XBP1P17861 PLEKHN1-203ENST00000379410 2404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
XBP1P17861 SPATS2-203ENST00000547865 1810 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.3
XBP1P17861 PLTP-203ENST00000372431 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
XBP1P17861 HHEX-202ENST00000472590 1605 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.3
XBP1P17861 ERC1-219ENST00000546231 4390 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
XBP1P17861 STYXL1-201ENST00000248600 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
XBP1P17861 IGHA2-202ENST00000497872 1320 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
XBP1P17861 MEN1-207ENST00000377326 3150 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
XBP1P17861 AIFM2-202ENST00000373248 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
XBP1P17861 TRIM67-201ENST00000366653 3936 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
XBP1P17861 PRPSAP2-216ENST00000536323 1872 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
XBP1P17861 TBC1D24-207ENST00000627285 4382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
XBP1P17861 HACD2-201ENST00000383657 4257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
XBP1P17861 AC093520.1-201ENST00000567545 1767 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
XBP1P17861 PREP-201ENST00000369110 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
XBP1P17861 BCL10-201ENST00000370580 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
XBP1P17861 MTCL1-202ENST00000359865 6093 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
XBP1P17861 FGD5-AS1-202ENST00000424349 3792 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
XBP1P17861 IGF2BP2-202ENST00000382199 3688 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.9 ms