Protein–RNA interactions for Protein: P17405

SMPD1, Sphingomyelin phosphodiesterase, humanhuman

Predictions only

Length 629 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMPD1P17405 YIPF3-213ENST00000506469 1444 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SMPD1P17405 DLGAP1-213ENST00000534970 2365 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SMPD1P17405 GABRB2-205ENST00000517901 1779 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SMPD1P17405 SH3BP5-206ENST00000426925 2190 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SMPD1P17405 CACFD1-206ENST00000540581 2880 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SMPD1P17405 XKRX-202ENST00000468904 2249 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SMPD1P17405 CNOT10-202ENST00000331889 2573 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SMPD1P17405 CLCN7-202ENST00000382745 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SMPD1P17405 OXA1L-212ENST00000604262 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SMPD1P17405 DNASE2-201ENST00000222219 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SMPD1P17405 TDRP-205ENST00000613071 3421 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SMPD1P17405 MCFD2-201ENST00000319466 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SMPD1P17405 C7orf61-201ENST00000332375 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SMPD1P17405 BGLAP-201ENST00000368272 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SMPD1P17405 PTTG1IP-202ENST00000397886 755 ntTSL 4 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SMPD1P17405 Metazoa_SRP.9-201ENST00000415635 283 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
SMPD1P17405 RLN3-201ENST00000431365 580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SMPD1P17405 AL592301.1-201ENST00000439501 864 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SMPD1P17405 AC018638.5-201ENST00000450885 754 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
SMPD1P17405 AC095040.1-201ENST00000513286 675 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
SMPD1P17405 ALG1L6P-201ENST00000515248 758 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
SMPD1P17405 NME1-NME2-203ENST00000555572 1193 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SMPD1P17405 NPTN-204ENST00000562924 1094 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SMPD1P17405 MIR5196-201ENST00000578146 115 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
SMPD1P17405 SKA2-205ENST00000580541 689 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SMPD1P17405 SIGLEC22P-201ENST00000599104 714 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
SMPD1P17405 SIGLEC22P-202ENST00000602065 544 ntTSL 4 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SMPD1P17405 MIR6756-201ENST00000616240 63 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
SMPD1P17405 UBE2D3-207ENST00000394801 2368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SMPD1P17405 AGPAT1-201ENST00000336984 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SMPD1P17405 AGPAT1-202ENST00000375104 2017 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SMPD1P17405 CRAT-201ENST00000318080 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SMPD1P17405 ABLIM2-209ENST00000505872 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SMPD1P17405 PAX5-214ENST00000523241 1342 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SMPD1P17405 COLCA2-202ENST00000526216 1332 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SMPD1P17405 ORAOV1-201ENST00000279147 2478 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SMPD1P17405 TRMT2A-202ENST00000403707 2928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SMPD1P17405 BBS1-202ENST00000393994 1790 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SMPD1P17405 SLC32A1-201ENST00000217420 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SMPD1P17405 MARK3-204ENST00000416682 2969 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SMPD1P17405 RARS2-201ENST00000369536 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SMPD1P17405 AC215219.1-201ENST00000400706 1817 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
SMPD1P17405 TRIM45-203ENST00000369464 3495 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SMPD1P17405 IDH2-201ENST00000330062 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SMPD1P17405 AL591122.2-201ENST00000624125 1853 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
SMPD1P17405 UNC13A-204ENST00000550896 5200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SMPD1P17405 CCDC51-206ENST00000447018 1461 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SMPD1P17405 LINC01029-204ENST00000583106 1465 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SMPD1P17405 SYN1-202ENST00000340666 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SMPD1P17405 GBA2-203ENST00000378103 3611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SMPD1P17405 EXOG-201ENST00000287675 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SMPD1P17405 LINC01648-201ENST00000445180 1519 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SMPD1P17405 LGALS8-203ENST00000341872 2437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SMPD1P17405 PLAT-205ENST00000519510 2030 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SMPD1P17405 AC067931.2-201ENST00000623655 2003 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
SMPD1P17405 RAI1-207ENST00000640861 5172 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SMPD1P17405 PHRF1-203ENST00000416188 5227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SMPD1P17405 SH3RF1-201ENST00000284637 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SMPD1P17405 PRNP-203ENST00000430350 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SMPD1P17405 COPS7B-206ENST00000410017 2051 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SMPD1P17405 MBD1-225ENST00000591535 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SMPD1P17405 KIF18B-203ENST00000590129 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SMPD1P17405 ATP6V1C1-202ENST00000518738 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SMPD1P17405 MYCBPAP-201ENST00000323776 3186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SMPD1P17405 KDM5C-202ENST00000375379 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SMPD1P17405 CCNA2-201ENST00000274026 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SMPD1P17405 MBP-202ENST00000355994 2772 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SMPD1P17405 CST1-201ENST00000304749 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SMPD1P17405 NDUFS7-203ENST00000414651 841 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SMPD1P17405 IZUMO1R-202ENST00000440961 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SMPD1P17405 ZAP70-202ENST00000451498 1085 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SMPD1P17405 AC108462.1-201ENST00000457467 850 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SMPD1P17405 SOX2-OT-208ENST00000477928 902 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SMPD1P17405 AC091179.2-201ENST00000495536 532 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SMPD1P17405 AC233724.6-201ENST00000503184 1088 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SMPD1P17405 LINC00634-202ENST00000505157 222 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
SMPD1P17405 FXYD2-205ENST00000528014 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SMPD1P17405 OR5BD1P-201ENST00000532527 817 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
SMPD1P17405 LINC01154-201ENST00000548617 454 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SMPD1P17405 LINC01551-203ENST00000550266 455 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SMPD1P17405 AC068867.1-201ENST00000559855 150 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
SMPD1P17405 IGHV3OR16-12-201ENST00000570121 353 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SMPD1P17405 SPINT2-204ENST00000587090 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SMPD1P17405 AL133467.4-201ENST00000602953 725 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
SMPD1P17405 LINC00431-202ENST00000636375 159 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
SMPD1P17405 MKRN2-201ENST00000170447 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SMPD1P17405 ZBTB46-201ENST00000245663 5185 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SMPD1P17405 C4orf19-201ENST00000284437 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SMPD1P17405 HIBCH-202ENST00000392332 2463 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SMPD1P17405 GFRA2-208ENST00000524240 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SMPD1P17405 LILRA2-203ENST00000391737 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SMPD1P17405 EGOT-201ENST00000414938 1464 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SMPD1P17405 TMEM50A-201ENST00000374358 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SMPD1P17405 GGACT-202ENST00000455100 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SMPD1P17405 ZSCAN5A-206ENST00000587492 1542 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SMPD1P17405 MBD4-206ENST00000507208 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SMPD1P17405 BCAT2-201ENST00000316273 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SMPD1P17405 APBB1-220ENST00000609331 1574 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SMPD1P17405 TCP10-201ENST00000366827 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
SMPD1P17405 INTS11-248ENST00000545578 2263 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.4 ms