Protein–RNA interactions for Protein: P10586

PTPRF, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase F, humanhuman

Predictions only

Length 1,907 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRFP10586 AP000439.3-201ENST00000545202 2376 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PTPRFP10586 MAOB-201ENST00000378069 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PTPRFP10586 PLCH2-205ENST00000449969 5450 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PTPRFP10586 NIPAL2-202ENST00000430223 4496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PTPRFP10586 HOXB3-205ENST00000470495 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PTPRFP10586 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PTPRFP10586 CNBP-205ENST00000500450 1516 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PTPRFP10586 RNF31-201ENST00000324103 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PTPRFP10586 PLEKHG5-212ENST00000537245 4794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PTPRFP10586 PGLYRP3-201ENST00000290722 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PTPRFP10586 HBB-201ENST00000335295 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PTPRFP10586 RHOC-205ENST00000369636 786 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PTPRFP10586 LINC01656-201ENST00000415702 630 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PTPRFP10586 PSAT1P2-201ENST00000426107 972 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
PTPRFP10586 DLEU2-205ENST00000443587 705 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PTPRFP10586 NMNAT3-213ENST00000512391 794 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PTPRFP10586 TMEM202-AS1-201ENST00000562573 723 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PTPRFP10586 ACSM5-206ENST00000575584 1130 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PTPRFP10586 ATF7-212ENST00000591397 860 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PTPRFP10586 AL160191.2-201ENST00000603975 601 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
PTPRFP10586 PPP1R21-202ENST00000294952 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PTPRFP10586 CRACR2A-201ENST00000252322 2186 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PTPRFP10586 MAP2K4-201ENST00000353533 3826 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PTPRFP10586 CECR7-202ENST00000441006 2726 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PTPRFP10586 CHID1-201ENST00000323578 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PTPRFP10586 KLHDC8A-201ENST00000367155 2928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PTPRFP10586 ARHGEF28-211ENST00000512883 2936 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PTPRFP10586 AC015909.5-201ENST00000624336 2266 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
PTPRFP10586 MRPS17-201ENST00000285298 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PTPRFP10586 CRYBB3-201ENST00000215855 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PTPRFP10586 XG-202ENST00000419513 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PTPRFP10586 KRT18P4-201ENST00000422599 1288 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
PTPRFP10586 AC012506.1-201ENST00000423706 525 ntTSL 4 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PTPRFP10586 AL451000.1-201ENST00000451300 1186 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
PTPRFP10586 AC107464.2-201ENST00000502923 569 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PTPRFP10586 AC026191.1-204ENST00000517846 608 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PTPRFP10586 MYL6-218ENST00000550697 901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PTPRFP10586 AC012174.1-201ENST00000562349 714 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PTPRFP10586 AC005498.2-204ENST00000590613 413 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PTPRFP10586 APOC1-209ENST00000592885 562 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PTPRFP10586 RNF103-CHMP3-202ENST00000604011 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PTPRFP10586 SGSM2-202ENST00000426855 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PTPRFP10586 FGGY-203ENST00000371212 1640 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PTPRFP10586 DACT1-202ENST00000395153 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PTPRFP10586 CLDN22-201ENST00000323319 2581 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PTPRFP10586 MRPL55-205ENST00000366731 1423 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PTPRFP10586 DNASE2-201ENST00000222219 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PTPRFP10586 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PTPRFP10586 AC093797.1-201ENST00000411847 1789 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PTPRFP10586 RN7SL832P-201ENST00000607781 1756 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
PTPRFP10586 AC144831.1-201ENST00000573312 2656 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
PTPRFP10586 KCNB1-203ENST00000635465 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PTPRFP10586 CPSF1-213ENST00000620219 4462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PTPRFP10586 UBASH3A-203ENST00000398367 1733 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PTPRFP10586 ZNF219-202ENST00000421093 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PTPRFP10586 PLPPR5-202ENST00000370188 4139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
PTPRFP10586 CALD1-222ENST00000495522 2199 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
PTPRFP10586 ZMIZ1-205ENST00000611351 2196 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
PTPRFP10586 APBB3-202ENST00000356738 1804 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
PTPRFP10586 MRPL33-201ENST00000296102 518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
PTPRFP10586 HIST1H2BJ-201ENST00000339812 381 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.21
PTPRFP10586 SURF4-202ENST00000371989 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
PTPRFP10586 ZNRD1-203ENST00000376782 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
PTPRFP10586 MRPL33-202ENST00000379666 404 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
PTPRFP10586 AL353658.1-201ENST00000436263 789 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
PTPRFP10586 KCNK16-204ENST00000437525 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
PTPRFP10586 LINC00173-201ENST00000470091 435 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
PTPRFP10586 AC008026.2-201ENST00000495438 348 ntBASIC16.33■□□□□ 0.21
PTPRFP10586 AC009779.3-204ENST00000549424 367 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.21
PTPRFP10586 AC005323.2-202ENST00000581304 493 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.21
PTPRFP10586 AQP7-213ENST00000624075 1270 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
PTPRFP10586 ALDH3A1-201ENST00000225740 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
PTPRFP10586 ULK4-203ENST00000420927 1904 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
PTPRFP10586 INPP5B-201ENST00000373021 3934 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
PTPRFP10586 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
PTPRFP10586 CORO2B-201ENST00000261861 3569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
PTPRFP10586 AL139158.3-201ENST00000641212 1562 ntBASIC16.33■□□□□ 0.21
PTPRFP10586 CBLN4-201ENST00000064571 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
PTPRFP10586 TMC7-201ENST00000304381 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
PTPRFP10586 LUC7L2-208ENST00000541170 1525 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
PTPRFP10586 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
PTPRFP10586 TOR2A-202ENST00000373281 2477 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
PTPRFP10586 CSRP1-202ENST00000367306 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
PTPRFP10586 KRT85-201ENST00000257901 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
PTPRFP10586 ARL1-202ENST00000536227 1322 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
PTPRFP10586 EDEM2-202ENST00000374492 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
PTPRFP10586 CHD1L-203ENST00000369259 2358 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
PTPRFP10586 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
PTPRFP10586 HOXA3-202ENST00000396352 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
PTPRFP10586 GRB2-202ENST00000316804 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
PTPRFP10586 FBXL5-201ENST00000341285 3385 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
PTPRFP10586 LST1-204ENST00000376086 554 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
PTPRFP10586 PPARG-205ENST00000397010 2017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
PTPRFP10586 SERF2-206ENST00000409291 807 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
PTPRFP10586 AC106869.1-201ENST00000448713 577 ntTSL 4 BASIC16.33■□□□□ 0.2
PTPRFP10586 LINC00892-203ENST00000454385 686 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
PTPRFP10586 RNF216P1-212ENST00000493407 659 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
PTPRFP10586 RN7SKP155-201ENST00000516031 288 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
PTPRFP10586 CD44-224ENST00000526669 870 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
PTPRFP10586 NFATC4-226ENST00000556279 2924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.4 ms