Protein–RNA interactions for Protein: P06756

ITGAV, Integrin alpha-V, humanhuman

Predictions only

Length 1,048 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGAVP06756 AP006333.2-201ENST00000544948 732 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
ITGAVP06756 TNNT1-209ENST00000587758 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ITGAVP06756 ZNF347-208ENST00000601804 496 ntTSL 4 BASIC15.25■□□□□ 0.03
ITGAVP06756 BX088702.1-201ENST00000610784 235 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
ITGAVP06756 AC097634.3-201ENST00000613067 820 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
ITGAVP06756 KAT8-201ENST00000219797 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ITGAVP06756 AC008125.1-201ENST00000548488 1538 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
ITGAVP06756 CD68-202ENST00000380498 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ITGAVP06756 MAGEA2-203ENST00000611557 2024 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
ITGAVP06756 AC011498.7-201ENST00000624986 2027 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
ITGAVP06756 SIGLEC16-202ENST00000602139 2510 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
ITGAVP06756 DSE-202ENST00000359564 4037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ITGAVP06756 KIAA1468-202ENST00000398130 6178 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ITGAVP06756 TNXB-209ENST00000613214 6842 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
ITGAVP06756 MAP3K1-201ENST00000399503 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ITGAVP06756 CAMK2D-205ENST00000394524 5294 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
ITGAVP06756 NICN1-201ENST00000273598 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ITGAVP06756 PHAX-201ENST00000297540 4288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ITGAVP06756 APOLD1-201ENST00000326765 4724 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ITGAVP06756 ARMCX1-201ENST00000372829 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ITGAVP06756 AC139712.1-201ENST00000378256 1875 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
ITGAVP06756 TSPAN12-201ENST00000222747 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ITGAVP06756 GCNT7-201ENST00000243913 2064 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ITGAVP06756 DEGS2-201ENST00000305631 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ITGAVP06756 ELN-203ENST00000320492 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ITGAVP06756 SAR1A-204ENST00000373241 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ITGAVP06756 CHL1-202ENST00000397491 5235 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ITGAVP06756 FRMD5-201ENST00000402883 4091 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ITGAVP06756 SC5D-201ENST00000264027 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ITGAVP06756 TMCO5B-204ENST00000529696 1568 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ITGAVP06756 KHSRPP1-201ENST00000427983 1768 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
ITGAVP06756 ASPH-214ENST00000519234 2874 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ITGAVP06756 CLUHP2-201ENST00000426660 1303 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
ITGAVP06756 SOCS2-205ENST00000548537 3733 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ITGAVP06756 CRCP-203ENST00000395326 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ITGAVP06756 SMG9-211ENST00000601170 2387 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ITGAVP06756 UBASH3A-203ENST00000398367 1733 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ITGAVP06756 NPRL3-212ENST00000620134 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ITGAVP06756 ZBTB7C-213ENST00000588982 4949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ITGAVP06756 DDX49-214ENST00000629999 1912 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ITGAVP06756 RAB41-201ENST00000276066 1071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ITGAVP06756 KLK1-201ENST00000301420 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ITGAVP06756 C9orf16-201ENST00000372994 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ITGAVP06756 RAB41-202ENST00000374473 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ITGAVP06756 GPAA1P2-201ENST00000417923 928 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
ITGAVP06756 CNN2P8-201ENST00000421872 913 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
ITGAVP06756 LINC01665-201ENST00000422917 1241 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ITGAVP06756 TMEM107-204ENST00000437139 747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ITGAVP06756 AC018685.1-201ENST00000457813 368 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ITGAVP06756 TMEM198B-204ENST00000484016 896 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
ITGAVP06756 SLC45A2-204ENST00000509381 1040 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ITGAVP06756 AC012568.1-201ENST00000558463 472 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ITGAVP06756 AC025279.2-201ENST00000569730 653 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
ITGAVP06756 GNRHR2-203ENST00000581100 1187 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
ITGAVP06756 AC233723.1-201ENST00000635921 386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ITGAVP06756 KCNJ2-202ENST00000535240 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ITGAVP06756 NUP50-201ENST00000347635 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ITGAVP06756 TRIM67-201ENST00000366653 3936 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ITGAVP06756 EXOC6B-202ENST00000410104 5795 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ITGAVP06756 WNT9B-202ENST00000393461 2654 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ITGAVP06756 C20orf202-201ENST00000400633 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ITGAVP06756 HHEX-202ENST00000472590 1605 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ITGAVP06756 CPN2-202ENST00000429275 2008 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ITGAVP06756 CORO7-222ENST00000574025 2826 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ITGAVP06756 SEMA3F-202ENST00000413852 3212 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ITGAVP06756 MRC2-202ENST00000446119 3201 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ITGAVP06756 CSF1-201ENST00000329608 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ITGAVP06756 APBB1IP-202ENST00000376236 2771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ITGAVP06756 ITSN1-210ENST00000399353 3913 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ITGAVP06756 NBEA-208ENST00000629018 10791 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ITGAVP06756 ITGB2-203ENST00000355153 2913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ITGAVP06756 SLC29A4-203ENST00000406453 2734 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ITGAVP06756 IL17RD-208ENST00000640796 2345 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ITGAVP06756 C9orf47-201ENST00000334490 4829 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ITGAVP06756 ABAT-203ENST00000425191 1923 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ITGAVP06756 HPD-204ENST00000543163 1709 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ITGAVP06756 UNC5A-201ENST00000329542 3812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ITGAVP06756 PEX5-207ENST00000455147 2689 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ITGAVP06756 CDK5RAP3-201ENST00000338399 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ITGAVP06756 C2-205ENST00000418949 1658 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ITGAVP06756 SLC8B1-202ENST00000546737 1656 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ITGAVP06756 ZNF7-202ENST00000446747 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ITGAVP06756 UCN2-201ENST00000273610 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ITGAVP06756 SELENON-203ENST00000374315 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ITGAVP06756 ARFGAP1-202ENST00000370275 3467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ITGAVP06756 BRAT1-201ENST00000340611 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ITGAVP06756 ATP6V1H-201ENST00000355221 2365 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ITGAVP06756 ZKSCAN4-201ENST00000377294 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ITGAVP06756 STOML1-206ENST00000561656 1833 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ITGAVP06756 COX6A2-201ENST00000287490 440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ITGAVP06756 POM121L8P-201ENST00000417732 1281 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
ITGAVP06756 AC099552.2-201ENST00000418523 456 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ITGAVP06756 AC092614.1-201ENST00000419640 909 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ITGAVP06756 U82695.1-202ENST00000428676 700 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ITGAVP06756 POM121L9P-203ENST00000441984 1285 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
ITGAVP06756 GLYCTK-203ENST00000461183 889 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ITGAVP06756 SNHG9-201ENST00000531523 275 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ITGAVP06756 C1RL-212ENST00000545337 813 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ITGAVP06756 TUBB8-202ENST00000562809 820 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ITGAVP06756 AC009133.1-202ENST00000563806 494 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.5 ms