Protein–RNA interactions for Protein: O43365

HOXA3, Homeobox protein Hox-A3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 443 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA3O43365 ACOT7-210ENST00000608083 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
HOXA3O43365 AGPAT1-202ENST00000375104 2017 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
HOXA3O43365 TRAK1-208ENST00000484786 2008 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
HOXA3O43365 MAGEA2-209ENST00000623806 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
HOXA3O43365 ATP6V0E2-207ENST00000479613 1666 ntTSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
HOXA3O43365 FURIN-207ENST00000618099 4345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
HOXA3O43365 BBS1-225ENST00000630659 1934 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
HOXA3O43365 TMEM106A-202ENST00000541594 1330 ntTSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
HOXA3O43365 TMEM92-201ENST00000300433 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
HOXA3O43365 AC007182.1-201ENST00000455232 2159 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
HOXA3O43365 SLC25A33-201ENST00000302692 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
HOXA3O43365 AC019205.2-202ENST00000441363 2403 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
HOXA3O43365 TSPAN14-210ENST00000616406 2436 ntTSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
HOXA3O43365 HYAL2-201ENST00000357750 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.51
HOXA3O43365 GRB2-201ENST00000316615 3181 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.51
HOXA3O43365 ZBTB7C-213ENST00000588982 4949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
HOXA3O43365 GRM1-203ENST00000361719 6754 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
HOXA3O43365 MSTO1-202ENST00000368341 2245 ntTSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
HOXA3O43365 MYEF2-201ENST00000267836 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
HOXA3O43365 MBD1-203ENST00000339998 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
HOXA3O43365 SFRP4-201ENST00000436072 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
HOXA3O43365 C15orf59-204ENST00000569673 6573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
HOXA3O43365 DENND3-211ENST00000519811 5482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
HOXA3O43365 ASF1A-201ENST00000229595 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
HOXA3O43365 FOXO4-201ENST00000341558 1353 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
HOXA3O43365 FAM90A7P-201ENST00000382628 1395 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
HOXA3O43365 ADGRB2-205ENST00000398547 4857 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
HOXA3O43365 FAM90A23P-201ENST00000400136 1395 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
HOXA3O43365 PCED1B-201ENST00000432328 1862 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.83□□□□□ -0.52
HOXA3O43365 LINC00665-203ENST00000438368 1863 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
HOXA3O43365 SYNPO2L-202ENST00000394810 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
HOXA3O43365 ZC3H14-204ENST00000336693 2007 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
HOXA3O43365 TBC1D17-202ENST00000535102 2025 ntTSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
HOXA3O43365 NR4A1-213ENST00000550082 2029 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
HOXA3O43365 ACTL6A-203ENST00000450518 1750 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
HOXA3O43365 AL139082.1-201ENST00000613982 3433 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
HOXA3O43365 RAB5B-202ENST00000448789 1530 ntTSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
HOXA3O43365 EDF1-202ENST00000371648 809 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
HOXA3O43365 C6orf136-202ENST00000376471 614 ntTSL 3 BASIC11.83□□□□□ -0.52
HOXA3O43365 Z82214.1-201ENST00000419643 988 ntTSL 3 BASIC11.83□□□□□ -0.52
HOXA3O43365 TMEM243-202ENST00000423734 601 ntTSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
HOXA3O43365 AL035414.1-201ENST00000451327 857 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
HOXA3O43365 AC234782.1-201ENST00000451950 919 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
HOXA3O43365 MPRIPP1-201ENST00000452433 1089 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
HOXA3O43365 IGLV3-15-201ENST00000518356 244 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
HOXA3O43365 TP53AIP1-204ENST00000530777 363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
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HOXA3O43365 PRKXP1-201ENST00000561423 1122 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
HOXA3O43365 MIR4706-201ENST00000582134 82 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
HOXA3O43365 AC011825.3-201ENST00000583184 565 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
HOXA3O43365 FAM236A-201ENST00000593662 453 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
HOXA3O43365 AC008743.1-201ENST00000596350 813 ntTSL 4 BASIC11.83□□□□□ -0.52
HOXA3O43365 FAM236B-201ENST00000596535 465 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
HOXA3O43365 AC008763.1-201ENST00000601797 843 ntTSL 3 BASIC11.83□□□□□ -0.52
HOXA3O43365 AF254983.2-201ENST00000612331 135 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
HOXA3O43365 AL353770.1-201ENST00000614915 403 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
HOXA3O43365 KRT85-201ENST00000257901 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
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HOXA3O43365 SUGP2-215ENST00000601879 5546 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
HOXA3O43365 SYNRG-217ENST00000612223 8229 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
HOXA3O43365 LANCL2-201ENST00000254770 4353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
HOXA3O43365 EXO5-203ENST00000372703 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
HOXA3O43365 DBN1-202ENST00000309007 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
HOXA3O43365 LINC01010-201ENST00000431422 2069 ntTSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
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HOXA3O43365 BAG1-210ENST00000634734 3786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
HOXA3O43365 RAI2-204ENST00000451717 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
HOXA3O43365 TARDBP-201ENST00000240185 5367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
HOXA3O43365 AXL-201ENST00000301178 4737 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
HOXA3O43365 AC005324.3-201ENST00000455584 5514 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
HOXA3O43365 MAGEA1-201ENST00000356661 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
HOXA3O43365 MAGEA8-204ENST00000535454 2112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.83□□□□□ -0.52
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HOXA3O43365 ABCG4-205ENST00000619701 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
HOXA3O43365 UCN2-201ENST00000273610 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
HOXA3O43365 ARL8B-208ENST00000611208 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
HOXA3O43365 CAPN3-207ENST00000397200 1643 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
HOXA3O43365 AC087164.1-202ENST00000583062 2158 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
HOXA3O43365 MIEF2-203ENST00000395704 2879 ntTSL 2 BASIC11.82□□□□□ -0.52
HOXA3O43365 NYAP1-201ENST00000300179 3581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.82□□□□□ -0.52
HOXA3O43365 NEBL-203ENST00000417816 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
HOXA3O43365 SH3PXD2B-203ENST00000519643 1394 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
HOXA3O43365 AC073347.1-201ENST00000421633 2643 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
HOXA3O43365 IQCA1L-203ENST00000615129 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
HOXA3O43365 CRY2-201ENST00000417225 2053 ntTSL 2 BASIC11.82□□□□□ -0.52
HOXA3O43365 FRMD3-201ENST00000304195 5297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
HOXA3O43365 NUDT16-202ENST00000521288 6108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
HOXA3O43365 RGPD5-202ENST00000272454 2907 ntTSL 2 BASIC11.82□□□□□ -0.52
HOXA3O43365 SNAPC1-201ENST00000216294 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
HOXA3O43365 DDX55-201ENST00000238146 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
HOXA3O43365 CSRP1-201ENST00000340006 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
HOXA3O43365 TMEM181-201ENST00000367090 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
HOXA3O43365 PSMB5-202ENST00000361611 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
HOXA3O43365 GAD1-203ENST00000375272 1252 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
HOXA3O43365 THAP4-202ENST00000402136 785 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
HOXA3O43365 AC083949.1-201ENST00000422013 657 ntTSL 3 BASIC11.82□□□□□ -0.52
HOXA3O43365 PSMB5-203ENST00000425762 900 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
HOXA3O43365 GLIS3-AS1-201ENST00000451340 734 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
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