Protein–RNA interactions for Protein: B2RUZ4

SMIM1, Small integral membrane protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 78 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM1B2RUZ4 KLHL13-204ENST00000371882 3256 ntTSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
SMIM1B2RUZ4 TCOF1-207ENST00000504761 4467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
SMIM1B2RUZ4 SPAST-201ENST00000315285 5117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
SMIM1B2RUZ4 ZNF202-206ENST00000529691 3384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.97□□□□□ -0.81
SMIM1B2RUZ4 GFY-202ENST00000610896 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.97□□□□□ -0.81
SMIM1B2RUZ4 AC134312.1-201ENST00000378417 3468 ntTSL 2 BASIC9.97□□□□□ -0.81
SMIM1B2RUZ4 RTN4-202ENST00000337526 4790 ntTSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
SMIM1B2RUZ4 NDRG2-251ENST00000556147 2880 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.81
SMIM1B2RUZ4 C15orf41-208ENST00000566621 2866 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.81
SMIM1B2RUZ4 ARMC5-201ENST00000268314 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.81
SMIM1B2RUZ4 ZFP36L2-201ENST00000282388 3696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
SMIM1B2RUZ4 KCNT1-212ENST00000628528 7057 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.96□□□□□ -0.81
SMIM1B2RUZ4 AHCY-205ENST00000538132 2366 ntTSL 2 BASIC9.96□□□□□ -0.81
SMIM1B2RUZ4 TUNAR-201ENST00000503525 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
SMIM1B2RUZ4 Z82170.1-201ENST00000625081 3192 ntBASIC9.96□□□□□ -0.81
SMIM1B2RUZ4 ZNF772-202ENST00000356584 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.96□□□□□ -0.81
SMIM1B2RUZ4 CD68-202ENST00000380498 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
SMIM1B2RUZ4 TFEB-205ENST00000394283 2595 ntTSL 2 BASIC9.96□□□□□ -0.81
SMIM1B2RUZ4 FARP2-201ENST00000264042 4051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
SMIM1B2RUZ4 CLCN6-201ENST00000312413 5631 ntTSL 2 BASIC9.96□□□□□ -0.81
SMIM1B2RUZ4 AC125611.4-201ENST00000553259 4166 ntTSL 2 BASIC9.96□□□□□ -0.81
SMIM1B2RUZ4 ELAVL4-207ENST00000448907 1951 ntTSL 2 BASIC9.96□□□□□ -0.81
SMIM1B2RUZ4 CACNA2D2-204ENST00000424201 5206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
SMIM1B2RUZ4 SVIL-AS1-204ENST00000427063 2025 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
SMIM1B2RUZ4 PGBD2-202ENST00000355360 2879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
SMIM1B2RUZ4 SRA1-201ENST00000336283 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
SMIM1B2RUZ4 MRPS18A-202ENST00000372133 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
SMIM1B2RUZ4 LRRC37A5P-201ENST00000374304 1103 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
SMIM1B2RUZ4 BRF1-202ENST00000379932 884 ntTSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.82
SMIM1B2RUZ4 RETN-202ENST00000381324 249 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
SMIM1B2RUZ4 C2orf15-202ENST00000409684 1058 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.96□□□□□ -0.82
SMIM1B2RUZ4 AL161638.1-201ENST00000420354 481 ntTSL 3 BASIC9.96□□□□□ -0.82
SMIM1B2RUZ4 VAT1-202ENST00000420567 1069 ntTSL 2 BASIC9.96□□□□□ -0.82
SMIM1B2RUZ4 MARK2-206ENST00000425897 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
SMIM1B2RUZ4 RANGRF-203ENST00000439238 1140 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
SMIM1B2RUZ4 DNAJB3-201ENST00000446806 729 ntBASIC9.96□□□□□ -0.82
SMIM1B2RUZ4 FDX1P1-201ENST00000449115 551 ntBASIC9.96□□□□□ -0.82
SMIM1B2RUZ4 MEIS3P1-201ENST00000495167 958 ntBASIC9.96□□□□□ -0.82
SMIM1B2RUZ4 AC009567.1-201ENST00000515071 525 ntTSL 4 BASIC9.96□□□□□ -0.82
SMIM1B2RUZ4 SPCS2-202ENST00000526361 772 ntTSL 2 BASIC9.96□□□□□ -0.82
SMIM1B2RUZ4 DPP3-209ENST00000531863 2974 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
SMIM1B2RUZ4 AC036164.1-201ENST00000570544 333 ntBASIC9.96□□□□□ -0.82
SMIM1B2RUZ4 AC087645.2-202ENST00000586583 643 ntTSL 4 BASIC9.96□□□□□ -0.82
SMIM1B2RUZ4 AC010624.2-201ENST00000600998 575 ntTSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.82
SMIM1B2RUZ4 AL049840.4-201ENST00000602422 811 ntBASIC9.96□□□□□ -0.82
SMIM1B2RUZ4 BX539320.1-201ENST00000623759 877 ntBASIC9.96□□□□□ -0.82
SMIM1B2RUZ4 AC073592.8-201ENST00000624126 511 ntBASIC9.96□□□□□ -0.82
SMIM1B2RUZ4 LINC01635-202ENST00000635097 1023 ntTSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.82
SMIM1B2RUZ4 CPNE5-201ENST00000244751 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
SMIM1B2RUZ4 AC004899.2-201ENST00000622993 3860 ntBASIC9.96□□□□□ -0.82
SMIM1B2RUZ4 EMILIN1-201ENST00000380320 3943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
SMIM1B2RUZ4 OS9-218ENST00000551035 2246 ntTSL 2 BASIC9.96□□□□□ -0.82
SMIM1B2RUZ4 FAM155B-201ENST00000252338 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
SMIM1B2RUZ4 CBX6-201ENST00000216083 3191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.96□□□□□ -0.82
SMIM1B2RUZ4 GAPVD1-205ENST00000394084 3190 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
SMIM1B2RUZ4 SLC4A8-205ENST00000535225 2262 ntTSL 2 BASIC9.96□□□□□ -0.82
SMIM1B2RUZ4 LDOC1-201ENST00000370526 1381 ntAPPRIS P1 BASIC9.96□□□□□ -0.82
SMIM1B2RUZ4 WDR45-240ENST00000635003 1376 ntTSL 3 BASIC9.96□□□□□ -0.82
SMIM1B2RUZ4 SLIT3-206ENST00000519560 9706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
SMIM1B2RUZ4 KCNJ9-201ENST00000368088 4170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
SMIM1B2RUZ4 PROKR1-201ENST00000303786 4273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.82
SMIM1B2RUZ4 RRN3P3-202ENST00000551766 3366 ntTSL 2 BASIC9.96□□□□□ -0.82
SMIM1B2RUZ4 DEK-202ENST00000397239 3427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
SMIM1B2RUZ4 AC239799.1-201ENST00000612520 3411 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.82
SMIM1B2RUZ4 ACTA1-202ENST00000366684 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
SMIM1B2RUZ4 RPP40-202ENST00000380051 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.82
SMIM1B2RUZ4 JUN-201ENST00000371222 3540 ntAPPRIS P1 BASIC9.96□□□□□ -0.82
SMIM1B2RUZ4 FKBP6-202ENST00000413573 1507 ntTSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.82
SMIM1B2RUZ4 NAP1L2-201ENST00000373517 2550 ntAPPRIS P1 BASIC9.96□□□□□ -0.82
SMIM1B2RUZ4 GLB1L-202ENST00000392089 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
SMIM1B2RUZ4 PPIP5K1-209ENST00000420765 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.82
SMIM1B2RUZ4 BCKDHB-201ENST00000320393 3692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
SMIM1B2RUZ4 OCIAD1-202ENST00000381473 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
SMIM1B2RUZ4 FGGY-203ENST00000371212 1640 ntTSL 2 BASIC9.96□□□□□ -0.82
SMIM1B2RUZ4 CCNE1-203ENST00000444983 1680 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
SMIM1B2RUZ4 RFC5-204ENST00000454402 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
SMIM1B2RUZ4 SPHK2-206ENST00000598088 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
SMIM1B2RUZ4 AGFG1-204ENST00000409315 2912 ntTSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.82
SMIM1B2RUZ4 TET2-207ENST00000513237 10166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
SMIM1B2RUZ4 TET2-209ENST00000540549 10166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
SMIM1B2RUZ4 LANCL3-202ENST00000378621 10298 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
SMIM1B2RUZ4 CDK5RAP3-201ENST00000338399 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
SMIM1B2RUZ4 DUS2-201ENST00000358896 1933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.95□□□□□ -0.82
SMIM1B2RUZ4 MKS1-201ENST00000313863 2091 ntTSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
SMIM1B2RUZ4 SETD1A-201ENST00000262519 6451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
SMIM1B2RUZ4 UBE3A-224ENST00000635914 9352 ntTSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
SMIM1B2RUZ4 MSTO1-202ENST00000368341 2245 ntTSL 2 BASIC9.95□□□□□ -0.82
SMIM1B2RUZ4 PCM1-202ENST00000327578 8287 ntTSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
SMIM1B2RUZ4 INTS11-248ENST00000545578 2263 ntTSL 2 BASIC9.95□□□□□ -0.82
SMIM1B2RUZ4 GALNT4-201ENST00000529983 5399 ntAPPRIS P1 BASIC9.95□□□□□ -0.82
SMIM1B2RUZ4 CLEC18B-204ENST00000617101 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
SMIM1B2RUZ4 SLC16A1-201ENST00000369626 3910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
SMIM1B2RUZ4 SEC14L3-204ENST00000403066 2474 ntTSL 2 BASIC9.95□□□□□ -0.82
SMIM1B2RUZ4 AL356275.1-201ENST00000638446 7440 ntTSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
SMIM1B2RUZ4 PNPLA5-205ENST00000597664 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
SMIM1B2RUZ4 LRRC32-201ENST00000260061 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
SMIM1B2RUZ4 LINC00882-204ENST00000484698 2718 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
SMIM1B2RUZ4 SLC22A5-201ENST00000245407 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
SMIM1B2RUZ4 FER1L4-204ENST00000430275 3281 ntTSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
SMIM1B2RUZ4 SCARF1-201ENST00000263071 3443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35 ms