Protein–RNA interactions for Protein: A7XYQ1

SOBP, Sine oculis-binding protein homolog, humanhuman

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Length 873 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOBPA7XYQ1 AL031282.1-201ENST00000577672 409 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SOBPA7XYQ1 FAAP24-204ENST00000590179 784 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SOBPA7XYQ1 KRTAP10-4-203ENST00000622352 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SOBPA7XYQ1 CDK7-214ENST00000626796 358 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SOBPA7XYQ1 CNOT7-213ENST00000628418 432 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SOBPA7XYQ1 CDK7-215ENST00000629350 1149 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SOBPA7XYQ1 WSCD1-210ENST00000574946 5884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SOBPA7XYQ1 TOR2A-202ENST00000373281 2477 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SOBPA7XYQ1 SLC4A9-203ENST00000506545 2838 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SOBPA7XYQ1 GAS2L2-201ENST00000604063 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SOBPA7XYQ1 ELN-208ENST00000380575 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SOBPA7XYQ1 NEK11-205ENST00000507910 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SOBPA7XYQ1 TLL1-206ENST00000513213 1829 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SOBPA7XYQ1 C3orf33-205ENST00000534941 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SOBPA7XYQ1 CIAPIN1-201ENST00000394391 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SOBPA7XYQ1 AC006486.2-201ENST00000624246 2199 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
SOBPA7XYQ1 NIPAL3-202ENST00000339255 1676 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SOBPA7XYQ1 TNF-208ENST00000449264 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SOBPA7XYQ1 MARK3-202ENST00000303622 3283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SOBPA7XYQ1 POLR2B-205ENST00000441246 3839 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SOBPA7XYQ1 SLC25A18-201ENST00000327451 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SOBPA7XYQ1 PSG4-203ENST00000433626 1887 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SOBPA7XYQ1 IRAK1-203ENST00000369980 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SOBPA7XYQ1 ZMYND15-204ENST00000573751 2409 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SOBPA7XYQ1 AC007191.1-201ENST00000623179 2995 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
SOBPA7XYQ1 ALDH3B2-201ENST00000349015 2649 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SOBPA7XYQ1 SLC1A6-201ENST00000221742 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SOBPA7XYQ1 CCNH-201ENST00000256897 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SOBPA7XYQ1 ANXA6-215ENST00000523714 2451 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SOBPA7XYQ1 TLE3-202ENST00000440567 2657 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SOBPA7XYQ1 HNRNPH1-201ENST00000329433 2114 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SOBPA7XYQ1 MFSD14B-201ENST00000375344 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SOBPA7XYQ1 AC007743.1-201ENST00000596663 3075 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SOBPA7XYQ1 ARVCF-202ENST00000401994 2700 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SOBPA7XYQ1 TPO-203ENST00000346956 2923 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SOBPA7XYQ1 PNPLA5-204ENST00000593866 2197 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SOBPA7XYQ1 LINC00528-201ENST00000600723 2160 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
SOBPA7XYQ1 STOML1-206ENST00000561656 1833 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SOBPA7XYQ1 PMP22-209ENST00000612492 1822 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SOBPA7XYQ1 AC009133.1-201ENST00000569981 2449 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SOBPA7XYQ1 CDKN2AIP-201ENST00000302350 2646 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SOBPA7XYQ1 AC091046.1-201ENST00000331871 207 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
SOBPA7XYQ1 ARMC12-203ENST00000373869 1111 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SOBPA7XYQ1 MAD2L2-206ENST00000376672 1002 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SOBPA7XYQ1 GSG1L-201ENST00000380897 1173 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SOBPA7XYQ1 CIDEC-202ENST00000383817 1199 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SOBPA7XYQ1 CALCA-203ENST00000396372 581 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SOBPA7XYQ1 BX276092.5-201ENST00000439926 886 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SOBPA7XYQ1 AL392046.1-202ENST00000457255 521 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SOBPA7XYQ1 AC009487.3-201ENST00000505579 560 ntTSL 4 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SOBPA7XYQ1 AC008438.1-201ENST00000507521 549 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SOBPA7XYQ1 LINC02380-201ENST00000510956 1038 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SOBPA7XYQ1 IGLV3-15-201ENST00000518356 244 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
SOBPA7XYQ1 LY6E-208ENST00000520531 490 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SOBPA7XYQ1 MTND2P7-201ENST00000521337 640 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
SOBPA7XYQ1 TMEM223-202ENST00000525631 736 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SOBPA7XYQ1 NDUFC1-209ENST00000539002 1198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SOBPA7XYQ1 NDUFC1-211ENST00000544855 1257 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SOBPA7XYQ1 AC093752.3-201ENST00000567343 901 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
SOBPA7XYQ1 AC079336.4-201ENST00000584219 408 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SOBPA7XYQ1 SNRPD2-206ENST00000588301 702 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SOBPA7XYQ1 AL109837.1-201ENST00000603272 613 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
SOBPA7XYQ1 AC009560.1-201ENST00000620208 434 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
SOBPA7XYQ1 CCDC197-205ENST00000636493 1279 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SOBPA7XYQ1 EGOT-201ENST00000414938 1464 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SOBPA7XYQ1 KIAA1211-203ENST00000504228 4628 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SOBPA7XYQ1 KIAA1683-209ENST00000612316 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SOBPA7XYQ1 APBA2-205ENST00000558330 3349 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SOBPA7XYQ1 ARC-201ENST00000356613 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SOBPA7XYQ1 ELMO3-202ENST00000393997 2531 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SOBPA7XYQ1 AL359183.1-201ENST00000623796 2132 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
SOBPA7XYQ1 PTPRS-205ENST00000588012 5993 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SOBPA7XYQ1 CTBP1-AS2-205ENST00000578730 2757 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SOBPA7XYQ1 EEF1AKMT3-201ENST00000300209 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SOBPA7XYQ1 CIT-219ENST00000612548 1799 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SOBPA7XYQ1 NMBR-201ENST00000258042 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SOBPA7XYQ1 CCDC51-202ENST00000412398 1385 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SOBPA7XYQ1 ATP6V1H-202ENST00000359530 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SOBPA7XYQ1 GSN-203ENST00000373808 2664 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SOBPA7XYQ1 JAKMIP1-205ENST00000410077 1835 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SOBPA7XYQ1 BICD2-202ENST00000375512 4636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SOBPA7XYQ1 HNRNPU-201ENST00000283179 3120 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SOBPA7XYQ1 AC139749.1-202ENST00000617529 3139 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
SOBPA7XYQ1 DIAPH2-202ENST00000355827 3782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SOBPA7XYQ1 PCBP2-215ENST00000549863 1619 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SOBPA7XYQ1 AC005252.3-201ENST00000623855 2258 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
SOBPA7XYQ1 EOMES-201ENST00000295743 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SOBPA7XYQ1 ZBTB32-202ENST00000392197 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SOBPA7XYQ1 AC018442.1-201ENST00000421439 2061 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
SOBPA7XYQ1 ADARB2-203ENST00000381312 8421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SOBPA7XYQ1 RGS3-201ENST00000317613 2542 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SOBPA7XYQ1 DGKI-201ENST00000288490 3895 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SOBPA7XYQ1 FAM208A-201ENST00000355628 5239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SOBPA7XYQ1 AXL-202ENST00000359092 3206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SOBPA7XYQ1 KCNN3-202ENST00000358505 1658 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SOBPA7XYQ1 AL358216.1-201ENST00000451601 1657 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SOBPA7XYQ1 PWP2-201ENST00000291576 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SOBPA7XYQ1 AP000439.3-201ENST00000545202 2376 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SOBPA7XYQ1 CCDC85A-201ENST00000407595 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SOBPA7XYQ1 TOMM40L-201ENST00000367987 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
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