Protein–RNA interactions for Protein: A6NNM3

RIMBP3B, RIMS-binding protein 3B, humanhuman

Predictions only

Length 1,639 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RIMBP3BA6NNM3 AC145285.1-201ENST00000469929 694 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
RIMBP3BA6NNM3 DIS3L2P1-201ENST00000509197 559 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
RIMBP3BA6NNM3 SEMA6A-AS1-206ENST00000514214 782 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
RIMBP3BA6NNM3 AP001979.2-201ENST00000526254 975 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
RIMBP3BA6NNM3 AC099524.1-203ENST00000565272 756 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
RIMBP3BA6NNM3 MIR6749-201ENST00000617008 69 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
RIMBP3BA6NNM3 ZNF211-201ENST00000240731 2440 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
RIMBP3BA6NNM3 PLEKHN1-203ENST00000379410 2404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RIMBP3BA6NNM3 GRB7-205ENST00000445327 2197 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
RIMBP3BA6NNM3 SPG7-201ENST00000268704 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RIMBP3BA6NNM3 PAK4-201ENST00000321944 2555 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RIMBP3BA6NNM3 CYP2B6-202ENST00000593831 1426 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
RIMBP3BA6NNM3 PARP6-220ENST00000569795 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
RIMBP3BA6NNM3 TMUB2-205ENST00000587172 1598 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
RIMBP3BA6NNM3 GLIPR1L2-201ENST00000320460 1729 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
RIMBP3BA6NNM3 MMADHC-203ENST00000428879 1726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
RIMBP3BA6NNM3 CBX3-201ENST00000337620 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
RIMBP3BA6NNM3 NOS3-210ENST00000484524 2537 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
RIMBP3BA6NNM3 COL4A1-204ENST00000543140 2547 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
RIMBP3BA6NNM3 IL11-201ENST00000264563 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
RIMBP3BA6NNM3 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
RIMBP3BA6NNM3 RDH12-203ENST00000551171 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
RIMBP3BA6NNM3 KRT37-201ENST00000225550 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
RIMBP3BA6NNM3 RFPL2-203ENST00000400237 2407 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
RIMBP3BA6NNM3 INPP5A-203ENST00000368594 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
RIMBP3BA6NNM3 RNF121-211ENST00000530137 2202 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
RIMBP3BA6NNM3 BEGAIN-201ENST00000355173 2674 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
RIMBP3BA6NNM3 RANGRF-201ENST00000226105 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
RIMBP3BA6NNM3 RNA5SP407-201ENST00000410275 110 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
RIMBP3BA6NNM3 AC069277.1-201ENST00000433639 1083 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
RIMBP3BA6NNM3 RPS15P5-201ENST00000449885 432 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
RIMBP3BA6NNM3 TVP23B-202ENST00000476139 2989 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
RIMBP3BA6NNM3 SMUG1-220ENST00000513838 2119 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
RIMBP3BA6NNM3 RMDN1-218ENST00000523911 950 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
RIMBP3BA6NNM3 AP003168.2-201ENST00000531215 471 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
RIMBP3BA6NNM3 LINC02130-201ENST00000566054 518 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
RIMBP3BA6NNM3 AC013472.3-201ENST00000607407 659 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
RIMBP3BA6NNM3 HIST1H4K-201ENST00000611927 312 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
RIMBP3BA6NNM3 TMEM263-204ENST00000548125 3349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
RIMBP3BA6NNM3 SYBU-201ENST00000276646 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RIMBP3BA6NNM3 C1QTNF3-201ENST00000231338 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RIMBP3BA6NNM3 GOLGA8R-201ENST00000327271 1896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
RIMBP3BA6NNM3 DUOXA1-216ENST00000613425 1867 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
RIMBP3BA6NNM3 PRKCD-201ENST00000330452 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RIMBP3BA6NNM3 RAP1GAP-204ENST00000374761 3318 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
RIMBP3BA6NNM3 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
RIMBP3BA6NNM3 RPP30-203ENST00000413330 1004 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
RIMBP3BA6NNM3 MKNK1-205ENST00000428112 1270 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
RIMBP3BA6NNM3 PRSS45-201ENST00000442359 687 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RIMBP3BA6NNM3 AL391822.1-201ENST00000452580 562 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
RIMBP3BA6NNM3 CD81-209ENST00000492627 886 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
RIMBP3BA6NNM3 AC104521.1-201ENST00000598582 279 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
RIMBP3BA6NNM3 OR4C6-202ENST00000641251 1058 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
RIMBP3BA6NNM3 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RIMBP3BA6NNM3 HRH2-202ENST00000377291 2561 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RIMBP3BA6NNM3 RNF166-210ENST00000568683 1768 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
RIMBP3BA6NNM3 AP000704.1-201ENST00000637940 2182 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
RIMBP3BA6NNM3 ZNF786-202ENST00000491431 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RIMBP3BA6NNM3 RABL6-203ENST00000371663 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RIMBP3BA6NNM3 SLC43A1-201ENST00000278426 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RIMBP3BA6NNM3 PES1P2-201ENST00000449745 1735 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
RIMBP3BA6NNM3 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RIMBP3BA6NNM3 ALDOA-202ENST00000395240 1447 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RIMBP3BA6NNM3 COMMD10-207ENST00000632434 1433 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RIMBP3BA6NNM3 NTRK1-202ENST00000368196 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RIMBP3BA6NNM3 ASPH-211ENST00000518068 2744 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RIMBP3BA6NNM3 OR6M1-201ENST00000309154 1053 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RIMBP3BA6NNM3 NAA10-205ENST00000393712 908 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RIMBP3BA6NNM3 SSR4P1-201ENST00000415143 412 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
RIMBP3BA6NNM3 CCDC153-202ENST00000415318 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RIMBP3BA6NNM3 AC090587.1-201ENST00000415809 494 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RIMBP3BA6NNM3 ACP1-207ENST00000439645 605 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RIMBP3BA6NNM3 BX072579.1-201ENST00000449453 344 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RIMBP3BA6NNM3 VEGFA-210ENST00000457104 414 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RIMBP3BA6NNM3 RAB6B-205ENST00000486858 880 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RIMBP3BA6NNM3 VEGFA-218ENST00000518689 630 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RIMBP3BA6NNM3 VEGFA-223ENST00000523125 541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RIMBP3BA6NNM3 SEC11A-203ENST00000558134 971 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RIMBP3BA6NNM3 IGHV3OR16-11-201ENST00000565524 349 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
RIMBP3BA6NNM3 AIPL1-210ENST00000576307 1077 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RIMBP3BA6NNM3 AL109983.1-201ENST00000603234 646 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
RIMBP3BA6NNM3 PIGA-209ENST00000634582 965 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RIMBP3BA6NNM3 CHCHD7-218ENST00000523975 1805 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RIMBP3BA6NNM3 POLR1E-202ENST00000377798 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RIMBP3BA6NNM3 AC087481.3-201ENST00000602886 1894 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
RIMBP3BA6NNM3 UBE2D1-204ENST00000615793 2621 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RIMBP3BA6NNM3 ANKRD23-202ENST00000331001 2455 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RIMBP3BA6NNM3 MBD4-203ENST00000429544 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RIMBP3BA6NNM3 CDK8-201ENST00000381527 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RIMBP3BA6NNM3 PRICKLE3-204ENST00000453382 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RIMBP3BA6NNM3 MAPKAPK3-201ENST00000357955 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RIMBP3BA6NNM3 TRAPPC4-214ENST00000533632 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RIMBP3BA6NNM3 MCCC1-214ENST00000610757 2410 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RIMBP3BA6NNM3 ZNF821-203ENST00000446827 1822 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RIMBP3BA6NNM3 TOR3A-203ENST00000367627 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RIMBP3BA6NNM3 NKIRAS1-201ENST00000388759 2335 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RIMBP3BA6NNM3 ARMCX1-201ENST00000372829 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RIMBP3BA6NNM3 SWI5-204ENST00000419867 1048 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RIMBP3BA6NNM3 AC041040.1-201ENST00000425197 460 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
RIMBP3BA6NNM3 NSRP1-213ENST00000584423 482 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.4 ms