Protein–RNA interactions for Protein: A0AVK6

E2F8, Transcription factor E2F8, humanhuman

Predictions only

Length 867 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2F8A0AVK6 TANGO2-205ENST00000401886 1559 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
E2F8A0AVK6 COPS7B-224ENST00000620578 2500 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
E2F8A0AVK6 GNAI2-207ENST00000451956 1486 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
E2F8A0AVK6 C7orf33-201ENST00000307003 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
E2F8A0AVK6 WBP2-215ENST00000591399 2225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
E2F8A0AVK6 AC005089.1-201ENST00000619486 2241 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
E2F8A0AVK6 SLURP2-201ENST00000317543 599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
E2F8A0AVK6 RHCE-202ENST00000340849 1087 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
E2F8A0AVK6 TPD52L2-207ENST00000369927 1094 ntTSL 4 BASIC15.42■□□□□ 0.06
E2F8A0AVK6 RBM38-204ENST00000371219 760 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
E2F8A0AVK6 ZNF248-202ENST00000374648 1286 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
E2F8A0AVK6 AK6-201ENST00000380818 1183 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
E2F8A0AVK6 CD8B-204ENST00000393759 1096 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
E2F8A0AVK6 BLCAP-204ENST00000397135 685 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.42■□□□□ 0.06
E2F8A0AVK6 FAM58BP-201ENST00000439056 645 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
E2F8A0AVK6 TNFRSF14-AS1-206ENST00000452793 569 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
E2F8A0AVK6 EIF4HP1-201ENST00000453115 687 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
E2F8A0AVK6 HIST2H2BC-201ENST00000498492 580 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
E2F8A0AVK6 AC005740.2-201ENST00000511085 419 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
E2F8A0AVK6 HNRNPA1P36-201ENST00000521313 955 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
E2F8A0AVK6 LINC02332-201ENST00000557232 386 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
E2F8A0AVK6 PIGH-209ENST00000559581 1049 ntTSL 4 BASIC15.42■□□□□ 0.06
E2F8A0AVK6 AC100827.2-201ENST00000563214 1194 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
E2F8A0AVK6 TMEM208-207ENST00000563953 887 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
E2F8A0AVK6 NDUFV2P1-201ENST00000596415 907 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
E2F8A0AVK6 BNIP3P13-201ENST00000599968 566 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
E2F8A0AVK6 AC243967.2-201ENST00000601409 567 ntTSL 4 BASIC15.42■□□□□ 0.06
E2F8A0AVK6 LRWD1-209ENST00000626402 138 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
E2F8A0AVK6 LINC01672-205ENST00000635092 633 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
E2F8A0AVK6 B3GNT7-201ENST00000287590 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
E2F8A0AVK6 TMCC2-202ENST00000330675 2780 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
E2F8A0AVK6 ZNF32-AS3-201ENST00000458063 1932 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
E2F8A0AVK6 IDH2-201ENST00000330062 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
E2F8A0AVK6 SLC22A7-202ENST00000372585 2555 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
E2F8A0AVK6 TPO-201ENST00000329066 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
E2F8A0AVK6 CENPK-202ENST00000396679 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
E2F8A0AVK6 TTC7A-202ENST00000394850 4306 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
E2F8A0AVK6 CD27-201ENST00000266557 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
E2F8A0AVK6 GGT1-201ENST00000248923 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
E2F8A0AVK6 TMEM170A-207ENST00000569540 2331 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
E2F8A0AVK6 KIAA2026-201ENST00000381461 6884 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
E2F8A0AVK6 DNAJC7-202ENST00000426588 1774 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
E2F8A0AVK6 TNFRSF11A-202ENST00000586569 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
E2F8A0AVK6 KIAA0319-201ENST00000378214 6802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
E2F8A0AVK6 MEGF11-203ENST00000409699 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
E2F8A0AVK6 SEZ6L-209ENST00000529632 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
E2F8A0AVK6 TMCO5B-204ENST00000529696 1568 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
E2F8A0AVK6 SLC16A9-202ENST00000395348 4178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
E2F8A0AVK6 KLHL33-203ENST00000637228 5404 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
E2F8A0AVK6 AC097359.2-201ENST00000604992 2389 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
E2F8A0AVK6 FABP1-202ENST00000393750 1839 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
E2F8A0AVK6 C4A-259ENST00000498271 5269 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
E2F8A0AVK6 EXT1-201ENST00000378204 8270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
E2F8A0AVK6 FAM219B-201ENST00000357635 3550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
E2F8A0AVK6 PLEKHN1-203ENST00000379410 2404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
E2F8A0AVK6 RAB2A-201ENST00000262646 3848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
E2F8A0AVK6 MRPL55-214ENST00000366741 603 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
E2F8A0AVK6 MRPL55-218ENST00000366747 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
E2F8A0AVK6 DPM3-202ENST00000368399 517 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
E2F8A0AVK6 HIST2H2AA3-201ENST00000369159 549 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
E2F8A0AVK6 MRPL43-206ENST00000370236 866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
E2F8A0AVK6 MRPL43-207ENST00000370241 824 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
E2F8A0AVK6 AL008707.1-201ENST00000422498 534 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
E2F8A0AVK6 AC016700.1-201ENST00000429424 312 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
E2F8A0AVK6 AP000320.1-201ENST00000440403 471 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
E2F8A0AVK6 AC005077.2-201ENST00000449786 690 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
E2F8A0AVK6 REEP1-202ENST00000453231 940 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
E2F8A0AVK6 CNGA4-202ENST00000533426 936 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
E2F8A0AVK6 ACTG1P17-201ENST00000558391 1119 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
E2F8A0AVK6 NRN1L-202ENST00000576147 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
E2F8A0AVK6 MIR4783-201ENST00000580343 82 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
E2F8A0AVK6 FXYD6-217ENST00000584394 669 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
E2F8A0AVK6 AC005324.6-201ENST00000587972 613 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
E2F8A0AVK6 HIST2H2AA4-201ENST00000607355 564 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
E2F8A0AVK6 SFMBT1-201ENST00000394752 4548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
E2F8A0AVK6 PRKAG2-215ENST00000492843 2699 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
E2F8A0AVK6 KDELC2-201ENST00000323468 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
E2F8A0AVK6 CELF2-206ENST00000608830 1892 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
E2F8A0AVK6 TUBA3D-201ENST00000321253 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
E2F8A0AVK6 LINC00476-204ENST00000429781 2825 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
E2F8A0AVK6 MAP3K11-208ENST00000530153 2830 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
E2F8A0AVK6 LINC00839-202ENST00000429940 2253 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
E2F8A0AVK6 BTN1A1-201ENST00000244513 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
E2F8A0AVK6 CAMK2D-205ENST00000394524 5294 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
E2F8A0AVK6 ZFP64-201ENST00000216923 3264 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
E2F8A0AVK6 PREP-201ENST00000369110 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
E2F8A0AVK6 ABR-228ENST00000574437 3196 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
E2F8A0AVK6 SLC40A1-201ENST00000261024 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
E2F8A0AVK6 SEPT12-201ENST00000268231 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
E2F8A0AVK6 KCTD10-208ENST00000540089 3096 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
E2F8A0AVK6 RAF1-201ENST00000251849 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
E2F8A0AVK6 COMP-201ENST00000222271 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
E2F8A0AVK6 DNAJA1-201ENST00000330899 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
E2F8A0AVK6 TAMM41-205ENST00000444133 1619 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
E2F8A0AVK6 AC004223.3-201ENST00000593039 1638 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
E2F8A0AVK6 OR2V1-205ENST00000642036 2609 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
E2F8A0AVK6 XPNPEP1-218ENST00000502935 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
E2F8A0AVK6 DNAJB1-201ENST00000254322 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
E2F8A0AVK6 SALL4P5-201ENST00000419001 1760 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
E2F8A0AVK6 SETD6-203ENST00000394266 3423 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.3 ms