Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y4C2

TCAF1, TRPM8 channel-associated factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 921 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCAF1Q9Y4C2 GAS2L1-209ENST00000618518 3382 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
TCAF1Q9Y4C2 SOCS2-205ENST00000548537 3733 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
TCAF1Q9Y4C2 C1R-201ENST00000535233 2211 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
TCAF1Q9Y4C2 CYP20A1-203ENST00000429815 1812 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
TCAF1Q9Y4C2 PAF1-204ENST00000595564 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
TCAF1Q9Y4C2 CHD4-201ENST00000357008 6496 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
TCAF1Q9Y4C2 NARFL-202ENST00000540986 3212 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
TCAF1Q9Y4C2 KCTD3-201ENST00000259154 3931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
TCAF1Q9Y4C2 PHAX-201ENST00000297540 4288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
TCAF1Q9Y4C2 AC009093.10-201ENST00000641956 1442 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
TCAF1Q9Y4C2 NAALADL1-202ENST00000355721 2100 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
TCAF1Q9Y4C2 ALPL-207ENST00000540617 2131 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
TCAF1Q9Y4C2 ARNT2-204ENST00000527771 2458 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
TCAF1Q9Y4C2 FBXL4-201ENST00000229971 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
TCAF1Q9Y4C2 KIF7-201ENST00000394412 4551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
TCAF1Q9Y4C2 RCN2-203ENST00000394885 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
TCAF1Q9Y4C2 SLC1A6-201ENST00000221742 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
TCAF1Q9Y4C2 UHRF1BP1L-201ENST00000279907 5168 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
TCAF1Q9Y4C2 CPEB2-209ENST00000538197 6878 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
TCAF1Q9Y4C2 DDX17-202ENST00000396821 4791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
TCAF1Q9Y4C2 ZFP30-201ENST00000351218 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
TCAF1Q9Y4C2 RSPH9-202ENST00000372165 2586 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
TCAF1Q9Y4C2 PRICKLE3-204ENST00000453382 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
TCAF1Q9Y4C2 DIP2A-201ENST00000400274 7023 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
TCAF1Q9Y4C2 PFDN5-202ENST00000334478 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
TCAF1Q9Y4C2 MUC1-202ENST00000338684 1107 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
TCAF1Q9Y4C2 CDK2-202ENST00000354056 1260 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
TCAF1Q9Y4C2 ATP6V1E1-202ENST00000399796 1208 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
TCAF1Q9Y4C2 THAP4-202ENST00000402136 785 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
TCAF1Q9Y4C2 AL035633.1-201ENST00000406139 838 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
TCAF1Q9Y4C2 AL450469.1-201ENST00000418953 461 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
TCAF1Q9Y4C2 VGLL4-214ENST00000451674 938 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
TCAF1Q9Y4C2 RASA3-IT1-201ENST00000454005 380 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
TCAF1Q9Y4C2 AP000345.1-201ENST00000454863 569 ntTSL 4 BASIC14.75□□□□□ -0.05
TCAF1Q9Y4C2 CICP12-201ENST00000455801 843 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
TCAF1Q9Y4C2 GS1-24F4.2-201ENST00000500823 1110 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
TCAF1Q9Y4C2 TPD52L1-208ENST00000528193 789 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
TCAF1Q9Y4C2 NR2C2AP-207ENST00000544883 899 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
TCAF1Q9Y4C2 DIO3OS-203ENST00000554441 1068 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
TCAF1Q9Y4C2 AC243562.3-201ENST00000559866 1212 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
TCAF1Q9Y4C2 C2orf69P2-201ENST00000562032 1123 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
TCAF1Q9Y4C2 CLEC11A-202ENST00000599973 1026 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
TCAF1Q9Y4C2 ZACNP1-201ENST00000612259 710 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
TCAF1Q9Y4C2 AL160412.1-202ENST00000616819 663 ntTSL 4 BASIC14.75□□□□□ -0.05
TCAF1Q9Y4C2 AL590644.3-201ENST00000635428 1228 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
TCAF1Q9Y4C2 RHOXF1P1-202ENST00000635473 501 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
TCAF1Q9Y4C2 C9orf139-202ENST00000623196 4990 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
TCAF1Q9Y4C2 AL139260.2-201ENST00000622355 2171 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
TCAF1Q9Y4C2 HSD17B4-222ENST00000515320 2494 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
TCAF1Q9Y4C2 TDP2-201ENST00000341060 2120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
TCAF1Q9Y4C2 ZNF663P-201ENST00000400371 2722 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
TCAF1Q9Y4C2 ABCG1-201ENST00000343687 3037 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
TCAF1Q9Y4C2 FAM219A-209ENST00000445726 3644 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
TCAF1Q9Y4C2 TDRD12-202ENST00000444215 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
TCAF1Q9Y4C2 CSF1-201ENST00000329608 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
TCAF1Q9Y4C2 STARD8-202ENST00000374597 4820 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
TCAF1Q9Y4C2 SMG8-201ENST00000300917 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
TCAF1Q9Y4C2 TBC1D17-201ENST00000221543 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
TCAF1Q9Y4C2 TBC1D17-209ENST00000622860 2370 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
TCAF1Q9Y4C2 COL11A2-203ENST00000374708 6209 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
TCAF1Q9Y4C2 ACTA1-202ENST00000366684 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
TCAF1Q9Y4C2 KRT8P4-201ENST00000509735 1454 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
TCAF1Q9Y4C2 KIAA1468-201ENST00000256858 5579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
TCAF1Q9Y4C2 NPRL3-212ENST00000620134 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
TCAF1Q9Y4C2 TFDP1-201ENST00000375370 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
TCAF1Q9Y4C2 WAC-AS1-202ENST00000528337 2608 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
TCAF1Q9Y4C2 MKRN3-201ENST00000314520 2337 ntAPPRIS P1 BASIC14.75□□□□□ -0.05
TCAF1Q9Y4C2 LINC02396-202ENST00000550636 2324 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
TCAF1Q9Y4C2 CPN2-202ENST00000429275 2008 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
TCAF1Q9Y4C2 STYXL1-201ENST00000248600 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
TCAF1Q9Y4C2 GGACT-201ENST00000376250 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
TCAF1Q9Y4C2 PRKN-204ENST00000366896 2514 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
TCAF1Q9Y4C2 NOS2P2-202ENST00000639528 1659 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
TCAF1Q9Y4C2 NOX5-203ENST00000448182 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
TCAF1Q9Y4C2 ACSL1-208ENST00000507295 2490 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
TCAF1Q9Y4C2 TCL1A-203ENST00000554012 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
TCAF1Q9Y4C2 AC010547.4-201ENST00000561754 1378 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
TCAF1Q9Y4C2 FGGY-203ENST00000371212 1640 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
TCAF1Q9Y4C2 TINF2-215ENST00000626689 1643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
TCAF1Q9Y4C2 PPM1F-201ENST00000263212 5143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
TCAF1Q9Y4C2 CAMK2D-204ENST00000394522 2696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
TCAF1Q9Y4C2 AHCYP2-201ENST00000430630 1300 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
TCAF1Q9Y4C2 GORASP2-201ENST00000234160 3173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
TCAF1Q9Y4C2 COL6A2-202ENST00000310645 3446 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
TCAF1Q9Y4C2 APBB1-220ENST00000609331 1574 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
TCAF1Q9Y4C2 CEP135-202ENST00000422247 2092 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
TCAF1Q9Y4C2 RET-201ENST00000340058 4149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
TCAF1Q9Y4C2 MKRN2-201ENST00000170447 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
TCAF1Q9Y4C2 TMEM141-201ENST00000290079 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
TCAF1Q9Y4C2 AGRP-201ENST00000290953 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
TCAF1Q9Y4C2 COPE-202ENST00000349893 948 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
TCAF1Q9Y4C2 AC020915.1-202ENST00000427361 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
TCAF1Q9Y4C2 C1QTNF6-203ENST00000434784 975 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
TCAF1Q9Y4C2 SFTPC-202ENST00000437090 773 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
TCAF1Q9Y4C2 AC010745.3-201ENST00000439745 415 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
TCAF1Q9Y4C2 C11orf98-201ENST00000524958 654 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
TCAF1Q9Y4C2 AC008011.2-201ENST00000538113 792 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
TCAF1Q9Y4C2 AP000812.2-201ENST00000538934 718 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
TCAF1Q9Y4C2 ORAOV1-211ENST00000542341 775 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
TCAF1Q9Y4C2 LINC02299-201ENST00000556669 430 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.9 ms