Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULT6

ZNRF3, E3 ubiquitin-protein ligase ZNRF3, humanhuman

Predictions only

Length 936 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNRF3Q9ULT6 TAGLN3-203ENST00000455401 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ZNRF3Q9ULT6 AC006529.1-201ENST00000459978 637 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
ZNRF3Q9ULT6 MRPL43-211ENST00000477279 903 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ZNRF3Q9ULT6 RNF216P1-212ENST00000493407 659 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ZNRF3Q9ULT6 GDNF-207ENST00000515058 764 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ZNRF3Q9ULT6 NUDCD2-202ENST00000517501 448 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ZNRF3Q9ULT6 CMTM1-209ENST00000528324 749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ZNRF3Q9ULT6 CMTM1-217ENST00000533666 493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ZNRF3Q9ULT6 PMFBP1-208ENST00000537792 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ZNRF3Q9ULT6 TVP23C-210ENST00000584811 2989 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ZNRF3Q9ULT6 BRSK1-203ENST00000585418 1104 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ZNRF3Q9ULT6 AC004528.1-201ENST00000588380 641 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ZNRF3Q9ULT6 AP005264.5-201ENST00000590066 467 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
ZNRF3Q9ULT6 AC008972.2-201ENST00000606587 494 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
ZNRF3Q9ULT6 AL356417.2-202ENST00000608986 532 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ZNRF3Q9ULT6 AL359091.4-201ENST00000610052 409 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
ZNRF3Q9ULT6 CCDC113-206ENST00000616795 891 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ZNRF3Q9ULT6 AL121956.4-201ENST00000629925 581 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ZNRF3Q9ULT6 BNC1-201ENST00000345382 4610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ZNRF3Q9ULT6 CRY2-201ENST00000417225 2053 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ZNRF3Q9ULT6 FOXO3-202ENST00000406360 7341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ZNRF3Q9ULT6 HNF1A-211ENST00000543427 2819 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ZNRF3Q9ULT6 SESN1-204ENST00000436639 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ZNRF3Q9ULT6 TSPAN5-201ENST00000305798 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ZNRF3Q9ULT6 CACNA1A-201ENST00000360228 8627 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ZNRF3Q9ULT6 SNCAIP-207ENST00000504884 1885 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ZNRF3Q9ULT6 HDHD2-201ENST00000300605 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ZNRF3Q9ULT6 SLC5A6-203ENST00000408041 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ZNRF3Q9ULT6 LINC00691-201ENST00000432505 2232 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ZNRF3Q9ULT6 ASIC1-201ENST00000228468 4072 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ZNRF3Q9ULT6 ARFGAP2-202ENST00000426335 2937 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ZNRF3Q9ULT6 IRF9-202ENST00000396864 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ZNRF3Q9ULT6 HSP90B1-201ENST00000299767 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ZNRF3Q9ULT6 SOCS7-201ENST00000612932 7857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ZNRF3Q9ULT6 ADAMTS16-201ENST00000274181 4979 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ZNRF3Q9ULT6 OXA1L-202ENST00000358043 1750 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ZNRF3Q9ULT6 AL162727.3-201ENST00000635661 2787 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
ZNRF3Q9ULT6 HYMAI-201ENST00000635591 3347 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
ZNRF3Q9ULT6 FBXO16-202ENST00000380254 1343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ZNRF3Q9ULT6 CCDC8-201ENST00000307522 3213 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ZNRF3Q9ULT6 XPNPEP2-201ENST00000371105 912 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ZNRF3Q9ULT6 DIO1-203ENST00000388876 606 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ZNRF3Q9ULT6 PPM1N-205ENST00000401705 771 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ZNRF3Q9ULT6 BX679664.3-201ENST00000414070 555 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
ZNRF3Q9ULT6 HTATIP2-202ENST00000421577 886 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ZNRF3Q9ULT6 VENTXP4-201ENST00000449029 958 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
ZNRF3Q9ULT6 RN7SL788P-201ENST00000460504 316 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
ZNRF3Q9ULT6 AC113935.1-201ENST00000471722 555 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
ZNRF3Q9ULT6 AC083801.1-201ENST00000491689 358 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
ZNRF3Q9ULT6 CISD2-202ENST00000503643 808 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ZNRF3Q9ULT6 AC012213.1-201ENST00000517376 722 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ZNRF3Q9ULT6 AC087269.1-202ENST00000519147 400 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ZNRF3Q9ULT6 LINC01485-202ENST00000520324 566 ntTSL 4 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ZNRF3Q9ULT6 DIO1-204ENST00000524406 626 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ZNRF3Q9ULT6 DIO1-213ENST00000532493 406 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ZNRF3Q9ULT6 CRADD-205ENST00000548483 1056 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ZNRF3Q9ULT6 AC090001.1-201ENST00000553194 467 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ZNRF3Q9ULT6 FOXN3-AS2-201ENST00000554071 1262 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
ZNRF3Q9ULT6 ABHD17AP9-201ENST00000561925 548 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
ZNRF3Q9ULT6 MCEMP1-202ENST00000597445 763 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ZNRF3Q9ULT6 ZFP41-201ENST00000330701 4797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ZNRF3Q9ULT6 GIT2-202ENST00000354574 5387 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ZNRF3Q9ULT6 RPARP-AS1-202ENST00000492465 1556 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ZNRF3Q9ULT6 MYRF-203ENST00000389602 2052 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ZNRF3Q9ULT6 TNN-201ENST00000239462 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ZNRF3Q9ULT6 HCG27-201ENST00000383331 1720 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ZNRF3Q9ULT6 FAM46A-201ENST00000320172 5609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ZNRF3Q9ULT6 ETV5-206ENST00000434744 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ZNRF3Q9ULT6 TRIM39-201ENST00000376656 3338 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
ZNRF3Q9ULT6 DNMT3L-204ENST00000628202 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ZNRF3Q9ULT6 KCND3-202ENST00000315987 2716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ZNRF3Q9ULT6 ORC6-201ENST00000219097 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ZNRF3Q9ULT6 CLEC18B-201ENST00000339953 1865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ZNRF3Q9ULT6 NEK2-201ENST00000366998 1865 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ZNRF3Q9ULT6 CLEC18C-202ENST00000536907 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
ZNRF3Q9ULT6 TUFT1-201ENST00000353024 2107 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
ZNRF3Q9ULT6 HYOU1-218ENST00000614668 1569 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ZNRF3Q9ULT6 MED11-201ENST00000293777 833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ZNRF3Q9ULT6 AP002856.2-201ENST00000416553 584 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
ZNRF3Q9ULT6 HLA-DPA2-205ENST00000433582 733 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
ZNRF3Q9ULT6 MIATNB-206ENST00000444388 918 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
ZNRF3Q9ULT6 BPIFB5P-201ENST00000457066 1099 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
ZNRF3Q9ULT6 ALG1L3P-201ENST00000503331 765 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
ZNRF3Q9ULT6 RPS23-207ENST00000511844 530 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
ZNRF3Q9ULT6 NMNAT3-213ENST00000512391 794 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
ZNRF3Q9ULT6 AC011383.1-201ENST00000517474 617 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
ZNRF3Q9ULT6 CYB561A3-208ENST00000536915 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
ZNRF3Q9ULT6 TNFSF13B-206ENST00000542136 495 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ZNRF3Q9ULT6 KLF17P1-201ENST00000547105 1126 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
ZNRF3Q9ULT6 MT2A-202ENST00000561491 581 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
ZNRF3Q9ULT6 C19orf70-203ENST00000587589 577 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
ZNRF3Q9ULT6 APOBEC3H-207ENST00000613996 465 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ZNRF3Q9ULT6 TMEM9-202ENST00000367332 1544 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
ZNRF3Q9ULT6 TACC3-212ENST00000612220 1756 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
ZNRF3Q9ULT6 AXIN2-202ENST00000375702 2541 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ZNRF3Q9ULT6 SIN3B-206ENST00000595541 2767 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
ZNRF3Q9ULT6 KLC1-206ENST00000389744 3250 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ZNRF3Q9ULT6 ASB1-201ENST00000264607 6994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ZNRF3Q9ULT6 ARHGEF4-205ENST00000409359 5489 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
ZNRF3Q9ULT6 MYH14-204ENST00000440075 4247 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.9 ms