Protein–RNA interactions for Protein: Q9UDT6

CLIP2, CAP-Gly domain-containing linker protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,046 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLIP2Q9UDT6 C11orf52-201ENST00000278601 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CLIP2Q9UDT6 MBD3L5-201ENST00000329753 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CLIP2Q9UDT6 HIST1H2AJ-201ENST00000333151 387 ntAPPRIS P1 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CLIP2Q9UDT6 NRSN2-201ENST00000382285 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CLIP2Q9UDT6 VAMP1-203ENST00000400911 1068 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CLIP2Q9UDT6 LINC02158-201ENST00000432377 897 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CLIP2Q9UDT6 NKAIN1P1-201ENST00000435754 582 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
CLIP2Q9UDT6 AC244250.1-201ENST00000438185 451 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CLIP2Q9UDT6 RNMTL1P1-201ENST00000454103 560 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
CLIP2Q9UDT6 SERPINA13P-202ENST00000478994 924 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
CLIP2Q9UDT6 AC091804.1-201ENST00000486888 567 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
CLIP2Q9UDT6 LINC01672-205ENST00000635092 633 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CLIP2Q9UDT6 C12orf49-201ENST00000261318 8404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CLIP2Q9UDT6 PTPRA-201ENST00000216877 3725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CLIP2Q9UDT6 ALG3-207ENST00000455059 1697 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CLIP2Q9UDT6 TMEM258-207ENST00000543510 1692 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CLIP2Q9UDT6 SLC4A7-210ENST00000440156 4120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CLIP2Q9UDT6 ANKMY1-204ENST00000391987 3221 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CLIP2Q9UDT6 RAPGEF4-201ENST00000397081 4299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CLIP2Q9UDT6 ATG2A-201ENST00000377264 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CLIP2Q9UDT6 FBXO5-202ENST00000367241 2221 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CLIP2Q9UDT6 SMARCA2-203ENST00000349721 5761 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CLIP2Q9UDT6 FAF1-202ENST00000396153 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CLIP2Q9UDT6 POMT1-204ENST00000402686 3038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CLIP2Q9UDT6 PES1-201ENST00000335214 1988 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CLIP2Q9UDT6 PIK3R1-211ENST00000521381 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CLIP2Q9UDT6 CUX1-214ENST00000550008 4350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CLIP2Q9UDT6 CENPK-202ENST00000396679 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CLIP2Q9UDT6 NKIRAS2-201ENST00000307641 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CLIP2Q9UDT6 COL6A2-201ENST00000300527 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CLIP2Q9UDT6 RPTOR-201ENST00000306801 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CLIP2Q9UDT6 RNF122-201ENST00000256257 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CLIP2Q9UDT6 TLX1NB-202ENST00000445873 1862 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CLIP2Q9UDT6 PALD1-201ENST00000263563 4555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CLIP2Q9UDT6 ALDOA-203ENST00000395248 2447 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CLIP2Q9UDT6 TBCE-202ENST00000406207 2012 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CLIP2Q9UDT6 FP565260.6-204ENST00000620528 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CLIP2Q9UDT6 COL6A2-202ENST00000310645 3446 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CLIP2Q9UDT6 KRT8P29-201ENST00000420409 1371 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
CLIP2Q9UDT6 C15orf52-206ENST00000559313 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CLIP2Q9UDT6 FGFR3-203ENST00000352904 3733 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CLIP2Q9UDT6 NFATC4-206ENST00000539237 5686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CLIP2Q9UDT6 FKBP6-201ENST00000252037 1500 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CLIP2Q9UDT6 PDHB-206ENST00000474765 1503 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CLIP2Q9UDT6 GPANK1-205ENST00000375906 2793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CLIP2Q9UDT6 PAK2-201ENST00000327134 6139 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CLIP2Q9UDT6 ARMC5-202ENST00000408912 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CLIP2Q9UDT6 KIAA0895L-202ENST00000561621 3500 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CLIP2Q9UDT6 SIGLEC9-202ENST00000440804 1960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CLIP2Q9UDT6 KDM2B-201ENST00000377069 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CLIP2Q9UDT6 DIS3-202ENST00000377780 5232 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CLIP2Q9UDT6 WARS2-202ENST00000369426 2811 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CLIP2Q9UDT6 SRSF5-203ENST00000553521 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CLIP2Q9UDT6 FIS1-201ENST00000223136 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CLIP2Q9UDT6 CTNNBIP1-202ENST00000377258 852 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CLIP2Q9UDT6 PSME1-202ENST00000382708 1136 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CLIP2Q9UDT6 AC010141.1-201ENST00000411585 623 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
CLIP2Q9UDT6 AL139420.1-201ENST00000439394 653 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CLIP2Q9UDT6 LAMA5-AS1-203ENST00000478167 690 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CLIP2Q9UDT6 NME2-204ENST00000503064 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CLIP2Q9UDT6 TMEM208-207ENST00000563953 887 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CLIP2Q9UDT6 DUX4L46-201ENST00000566845 751 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
CLIP2Q9UDT6 MLLT10-216ENST00000621220 381 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CLIP2Q9UDT6 SNX12-206ENST00000622259 661 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CLIP2Q9UDT6 AL162426.1-201ENST00000624141 743 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
CLIP2Q9UDT6 EEF1AKMT3-201ENST00000300209 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CLIP2Q9UDT6 TMCO5B-204ENST00000529696 1568 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CLIP2Q9UDT6 FECH-201ENST00000262093 3853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CLIP2Q9UDT6 BTN1A1-201ENST00000244513 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CLIP2Q9UDT6 AC026688.2-201ENST00000518984 1734 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CLIP2Q9UDT6 HVCN1-202ENST00000356742 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CLIP2Q9UDT6 SEPT12-201ENST00000268231 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CLIP2Q9UDT6 CYB5D2-201ENST00000301391 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CLIP2Q9UDT6 ZNF7-202ENST00000446747 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CLIP2Q9UDT6 ZNF384-202ENST00000355772 2514 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CLIP2Q9UDT6 CMTM6-201ENST00000205636 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CLIP2Q9UDT6 ZMYND15-202ENST00000433935 2411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CLIP2Q9UDT6 LETMD1-203ENST00000418425 2123 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CLIP2Q9UDT6 GSDMA-203ENST00000635792 1546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CLIP2Q9UDT6 CCNF-202ENST00000397066 4283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CLIP2Q9UDT6 NACC2-201ENST00000277554 6899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CLIP2Q9UDT6 CCT3-201ENST00000295688 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CLIP2Q9UDT6 ATP6V1H-202ENST00000359530 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CLIP2Q9UDT6 ARHGEF3-212ENST00000495373 2024 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CLIP2Q9UDT6 TRIM46-202ENST00000368382 3127 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CLIP2Q9UDT6 AMIGO2-201ENST00000266581 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CLIP2Q9UDT6 USP36-201ENST00000312010 5234 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CLIP2Q9UDT6 KIFC3-207ENST00000543930 3018 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CLIP2Q9UDT6 FZR1-201ENST00000313639 1215 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CLIP2Q9UDT6 VSIG2-201ENST00000326621 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CLIP2Q9UDT6 HIST1H2AD-201ENST00000341023 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CLIP2Q9UDT6 CSHL1-203ENST00000346606 659 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CLIP2Q9UDT6 MRPL43-206ENST00000370236 866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CLIP2Q9UDT6 MRPL43-207ENST00000370241 824 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CLIP2Q9UDT6 ZNF248-202ENST00000374648 1286 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CLIP2Q9UDT6 PLA2G5-201ENST00000375108 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CLIP2Q9UDT6 AK6-201ENST00000380818 1183 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CLIP2Q9UDT6 TBC1D8-202ENST00000409318 3803 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CLIP2Q9UDT6 CALR4P-201ENST00000431943 946 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
CLIP2Q9UDT6 AC100827.2-201ENST00000563214 1194 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.4 ms