Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2J3

KLHL9, Kelch-like protein 9, humanhuman

Predictions only

Length 617 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL9Q9P2J3 ABCG1-203ENST00000361802 3034 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
KLHL9Q9P2J3 MAGED2-201ENST00000218439 1958 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
KLHL9Q9P2J3 AC009690.1-201ENST00000379915 4374 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
KLHL9Q9P2J3 ZNF683-201ENST00000349618 1610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
KLHL9Q9P2J3 HCRTR1-202ENST00000373706 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
KLHL9Q9P2J3 AC060234.2-201ENST00000428825 1610 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
KLHL9Q9P2J3 AIFM1-209ENST00000535724 2468 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
KLHL9Q9P2J3 DTX3L-201ENST00000296161 5868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
KLHL9Q9P2J3 POLR2I-201ENST00000221859 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
KLHL9Q9P2J3 C1QB-201ENST00000314933 1044 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
KLHL9Q9P2J3 AC006001.1-201ENST00000325130 474 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
KLHL9Q9P2J3 PFDN5-202ENST00000334478 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
KLHL9Q9P2J3 TNFAIP8L2-201ENST00000368910 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
KLHL9Q9P2J3 IGHV3-53-201ENST00000390627 571 ntAPPRIS P1 BASIC13.44□□□□□ -0.26
KLHL9Q9P2J3 MPV17-205ENST00000402310 906 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
KLHL9Q9P2J3 AL355483.2-201ENST00000421637 675 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
KLHL9Q9P2J3 ANAPC15-208ENST00000538393 867 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
KLHL9Q9P2J3 AC078819.1-201ENST00000547454 765 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
KLHL9Q9P2J3 AC012085.1-201ENST00000548270 765 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
KLHL9Q9P2J3 AL355102.5-201ENST00000554769 572 ntTSL 4 BASIC13.44□□□□□ -0.26
KLHL9Q9P2J3 GCHFR-204ENST00000559445 626 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
KLHL9Q9P2J3 DMAC2-208ENST00000589970 979 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
KLHL9Q9P2J3 TXNL4A-212ENST00000592957 546 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
KLHL9Q9P2J3 DMAC2-215ENST00000597457 492 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
KLHL9Q9P2J3 ECM1P1-201ENST00000604092 1279 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
KLHL9Q9P2J3 MIR6775-201ENST00000617557 69 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
KLHL9Q9P2J3 LINC01002-220ENST00000632790 449 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
KLHL9Q9P2J3 TOMM40L-201ENST00000367987 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
KLHL9Q9P2J3 HSD17B6-205ENST00000554643 1751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
KLHL9Q9P2J3 HIST1H2AG-201ENST00000359193 2250 ntAPPRIS P1 BASIC13.44□□□□□ -0.26
KLHL9Q9P2J3 MIF4GD-208ENST00000579297 1419 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
KLHL9Q9P2J3 ZMYND15-204ENST00000573751 2409 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
KLHL9Q9P2J3 TRIM13-202ENST00000378182 7249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
KLHL9Q9P2J3 ACKR3-201ENST00000272928 2203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
KLHL9Q9P2J3 GINS3-203ENST00000426538 1728 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
KLHL9Q9P2J3 LINC01185-202ENST00000452343 1705 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
KLHL9Q9P2J3 LRRC6-205ENST00000519595 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
KLHL9Q9P2J3 MAGEA2-204ENST00000611674 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
KLHL9Q9P2J3 HENMT1-202ENST00000370032 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
KLHL9Q9P2J3 TLX1NB-202ENST00000445873 1862 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
KLHL9Q9P2J3 GOLGA8M-201ENST00000563027 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
KLHL9Q9P2J3 GORASP2-201ENST00000234160 3173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
KLHL9Q9P2J3 CAMK2D-204ENST00000394522 2696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
KLHL9Q9P2J3 CRACR2A-201ENST00000252322 2186 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
KLHL9Q9P2J3 KAT8-201ENST00000219797 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
KLHL9Q9P2J3 AATBC-201ENST00000400385 4598 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
KLHL9Q9P2J3 ROBO4-201ENST00000306534 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
KLHL9Q9P2J3 SGK2-201ENST00000341458 2498 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
KLHL9Q9P2J3 TCHH-201ENST00000368804 6900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
KLHL9Q9P2J3 PRSS54-201ENST00000219301 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
KLHL9Q9P2J3 STOML1-206ENST00000561656 1833 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
KLHL9Q9P2J3 VIPAS39-202ENST00000343765 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
KLHL9Q9P2J3 P4HA1-205ENST00000440381 2790 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
KLHL9Q9P2J3 KDM6B-201ENST00000254846 6713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
KLHL9Q9P2J3 CHST10-203ENST00000409701 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
KLHL9Q9P2J3 AHCYP2-201ENST00000430630 1300 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
KLHL9Q9P2J3 TMEM230-201ENST00000202834 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
KLHL9Q9P2J3 RPP40-202ENST00000380051 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
KLHL9Q9P2J3 TAGLN2-202ENST00000368096 1603 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
KLHL9Q9P2J3 BEND6-203ENST00000370748 3497 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
KLHL9Q9P2J3 PDGFRL-201ENST00000251630 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
KLHL9Q9P2J3 MBLAC2-202ENST00000514906 1936 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
KLHL9Q9P2J3 MTHFR-210ENST00000641407 2387 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
KLHL9Q9P2J3 PIDD1-201ENST00000347755 2998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
KLHL9Q9P2J3 NDFIP2-205ENST00000612570 4648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
KLHL9Q9P2J3 GRSF1-201ENST00000254799 6666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
KLHL9Q9P2J3 BLVRB-201ENST00000263368 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
KLHL9Q9P2J3 GAL-201ENST00000265643 818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
KLHL9Q9P2J3 AXIN2-201ENST00000307078 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
KLHL9Q9P2J3 SS18L1-202ENST00000370848 1238 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
KLHL9Q9P2J3 PHACTR1-202ENST00000379329 707 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
KLHL9Q9P2J3 STX1A-203ENST00000395155 783 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
KLHL9Q9P2J3 MPV17-206ENST00000402722 827 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
KLHL9Q9P2J3 LINC00163-201ENST00000434081 2155 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
KLHL9Q9P2J3 AC128709.1-201ENST00000445908 600 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
KLHL9Q9P2J3 AL590640.2-201ENST00000457038 527 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
KLHL9Q9P2J3 LCN10-203ENST00000474369 564 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
KLHL9Q9P2J3 AC078785.1-201ENST00000496389 734 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
KLHL9Q9P2J3 AC106786.2-201ENST00000506859 561 ntTSL 4 BASIC13.43□□□□□ -0.26
KLHL9Q9P2J3 NUP54-217ENST00000514987 1563 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
KLHL9Q9P2J3 AP002992.1-201ENST00000527519 491 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
KLHL9Q9P2J3 SNX29P1-201ENST00000548357 1007 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
KLHL9Q9P2J3 LINC02299-201ENST00000556669 430 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
KLHL9Q9P2J3 AC091891.1-201ENST00000560688 688 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
KLHL9Q9P2J3 GLIS2-AS1-201ENST00000576080 340 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
KLHL9Q9P2J3 MIR22HG-212ENST00000577164 931 ntTSL 4 BASIC13.43□□□□□ -0.26
KLHL9Q9P2J3 AC011510.1-201ENST00000598541 286 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
KLHL9Q9P2J3 AC112229.3-201ENST00000603767 3202 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
KLHL9Q9P2J3 IER3IP1-202ENST00000639845 832 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
KLHL9Q9P2J3 AC013271.1-201ENST00000640669 3202 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
KLHL9Q9P2J3 PPIL2-202ENST00000398831 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
KLHL9Q9P2J3 POLM-202ENST00000335195 2444 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
KLHL9Q9P2J3 SNX2-201ENST00000379516 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
KLHL9Q9P2J3 PTPN20-206ENST00000395722 1995 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
KLHL9Q9P2J3 CMTR2-201ENST00000338099 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
KLHL9Q9P2J3 ITGAM-202ENST00000544665 4718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
KLHL9Q9P2J3 OPA1-205ENST00000361908 6439 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
KLHL9Q9P2J3 MFSD11-211ENST00000588460 3612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
KLHL9Q9P2J3 F8-201ENST00000330287 2620 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
KLHL9Q9P2J3 GRIK5-201ENST00000262895 3493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.2 ms