Protein–RNA interactions for Protein: Q9P1Z9

CCDC180, Coiled-coil domain-containing protein 180, humanhuman

Predictions only

Length 1,646 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC180Q9P1Z9 PRMT7-203ENST00000449359 2091 ntTSL 2 BASIC28.65■■■□□ 2.18
CCDC180Q9P1Z9 PNMA1-201ENST00000316836 2590 ntAPPRIS P1 BASIC28.65■■■□□ 2.18
CCDC180Q9P1Z9 AC092384.2-204ENST00000565053 2566 ntTSL 2 BASIC28.65■■■□□ 2.18
CCDC180Q9P1Z9 NEUROD1-201ENST00000295108 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
CCDC180Q9P1Z9 AKAP1-201ENST00000314126 2380 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
CCDC180Q9P1Z9 PYGM-202ENST00000377432 2611 ntTSL 2 BASIC28.65■■■□□ 2.18
CCDC180Q9P1Z9 BRF1-206ENST00000446501 2858 ntTSL 2 BASIC28.65■■■□□ 2.18
CCDC180Q9P1Z9 TCP10-210ENST00000617120 2182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
CCDC180Q9P1Z9 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
CCDC180Q9P1Z9 EXT2-210ENST00000533608 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
CCDC180Q9P1Z9 ATP5C1-201ENST00000335698 1078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
CCDC180Q9P1Z9 HDGF-202ENST00000368206 960 ntTSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
CCDC180Q9P1Z9 MIR632-201ENST00000385193 94 ntBASIC28.65■■■□□ 2.18
CCDC180Q9P1Z9 CASP8-206ENST00000392258 1060 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
CCDC180Q9P1Z9 AL513211.1-201ENST00000429053 483 ntTSL 3 BASIC28.65■■■□□ 2.18
CCDC180Q9P1Z9 AC015818.1-201ENST00000451011 244 ntBASIC28.65■■■□□ 2.18
CCDC180Q9P1Z9 AP000533.1-201ENST00000456143 1177 ntBASIC28.65■■■□□ 2.18
CCDC180Q9P1Z9 SMIM26-203ENST00000608034 670 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.65■■■□□ 2.18
CCDC180Q9P1Z9 AL353658.2-201ENST00000629794 519 ntTSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
CCDC180Q9P1Z9 DDX5-201ENST00000225792 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
CCDC180Q9P1Z9 CTNND2-202ENST00000458100 1962 ntTSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.18
CCDC180Q9P1Z9 CRISP2-201ENST00000339139 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
CCDC180Q9P1Z9 HGSNAT-207ENST00000521576 2332 ntTSL 2 BASIC28.64■■■□□ 2.18
CCDC180Q9P1Z9 LINC00479-201ENST00000412102 2033 ntTSL 2 BASIC28.64■■■□□ 2.18
CCDC180Q9P1Z9 ZNF620-202ENST00000418905 2022 ntTSL 2 BASIC28.64■■■□□ 2.18
CCDC180Q9P1Z9 MOV10L1-202ENST00000354853 1701 ntTSL 2 BASIC28.64■■■□□ 2.18
CCDC180Q9P1Z9 ATP6V0A1-204ENST00000537728 2774 ntTSL 2 BASIC28.64■■■□□ 2.18
CCDC180Q9P1Z9 LINC01502-201ENST00000445997 2471 ntTSL 2 BASIC28.64■■■□□ 2.18
CCDC180Q9P1Z9 CD24-204ENST00000619133 2513 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.64■■■□□ 2.18
CCDC180Q9P1Z9 ARHGAP9-203ENST00000424809 2569 ntTSL 2 BASIC28.64■■■□□ 2.18
CCDC180Q9P1Z9 GYG2-201ENST00000353656 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.18
CCDC180Q9P1Z9 GLRX2-202ENST00000367440 1131 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
CCDC180Q9P1Z9 HMGA1P1-201ENST00000415560 1062 ntBASIC28.64■■■□□ 2.18
CCDC180Q9P1Z9 AC002996.1-201ENST00000546840 784 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.18
CCDC180Q9P1Z9 EIF3F-209ENST00000640290 372 ntTSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.18
CCDC180Q9P1Z9 FUCA2-201ENST00000002165 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
CCDC180Q9P1Z9 EGLN2-207ENST00000593726 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.17
CCDC180Q9P1Z9 HPD-204ENST00000543163 1709 ntTSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.17
CCDC180Q9P1Z9 RTKN-202ENST00000272430 2142 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.17
CCDC180Q9P1Z9 FBLIM1-202ENST00000375766 3695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.64■■■□□ 2.17
CCDC180Q9P1Z9 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.17
CCDC180Q9P1Z9 AC093525.2-201ENST00000564543 1944 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.63■■■□□ 2.17
CCDC180Q9P1Z9 PICALM-219ENST00000532317 3474 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
CCDC180Q9P1Z9 TUBB8-206ENST00000568584 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
CCDC180Q9P1Z9 AL512288.1-201ENST00000448015 491 ntTSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
CCDC180Q9P1Z9 AC008440.1-201ENST00000455835 439 ntTSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
CCDC180Q9P1Z9 APOPT1-215ENST00000556253 783 ntTSL 3 BASIC28.63■■■□□ 2.17
CCDC180Q9P1Z9 INO80E-209ENST00000567254 625 ntTSL 2 BASIC28.63■■■□□ 2.17
CCDC180Q9P1Z9 LINC00514-203ENST00000573465 313 ntTSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
CCDC180Q9P1Z9 MIR5091-201ENST00000578707 93 ntBASIC28.63■■■□□ 2.17
CCDC180Q9P1Z9 MIR4326-201ENST00000582203 59 ntBASIC28.63■■■□□ 2.17
CCDC180Q9P1Z9 LINC01588-216ENST00000623502 975 ntTSL 2 BASIC28.63■■■□□ 2.17
CCDC180Q9P1Z9 AC005609.5-201ENST00000624712 1053 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
CCDC180Q9P1Z9 ARNT2-209ENST00000622346 2932 ntTSL 2 BASIC28.63■■■□□ 2.17
CCDC180Q9P1Z9 MPZL3-204ENST00000527472 1381 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
CCDC180Q9P1Z9 AC011455.3-201ENST00000599996 1967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.63■■■□□ 2.17
CCDC180Q9P1Z9 MAP2K4-201ENST00000353533 3826 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
CCDC180Q9P1Z9 PPP1R32-201ENST00000338608 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
CCDC180Q9P1Z9 AC138035.3-201ENST00000622706 2791 ntBASIC28.63■■■□□ 2.17
CCDC180Q9P1Z9 ZNF460-202ENST00000537645 2037 ntTSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
CCDC180Q9P1Z9 REG3G-202ENST00000393897 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
CCDC180Q9P1Z9 AC009065.4-201ENST00000563734 543 ntTSL 3 BASIC28.62■■■□□ 2.17
CCDC180Q9P1Z9 LINC00969-253ENST00000625338 804 ntTSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
CCDC180Q9P1Z9 MMP17-206ENST00000535291 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
CCDC180Q9P1Z9 OASL-202ENST00000339275 1492 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
CCDC180Q9P1Z9 AL390038.1-201ENST00000419814 2481 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
CCDC180Q9P1Z9 AL359258.1-201ENST00000438965 2481 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
CCDC180Q9P1Z9 MAGEC3-205ENST00000544766 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
CCDC180Q9P1Z9 PTGDR-201ENST00000306051 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
CCDC180Q9P1Z9 SAP18-201ENST00000382533 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
CCDC180Q9P1Z9 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
CCDC180Q9P1Z9 C1QTNF1-202ENST00000339142 3100 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
CCDC180Q9P1Z9 PMM1-201ENST00000216259 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
CCDC180Q9P1Z9 S100B-201ENST00000291700 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
CCDC180Q9P1Z9 PDE4DIP-202ENST00000369347 1137 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
CCDC180Q9P1Z9 KRT8P6-201ENST00000399259 1207 ntBASIC28.61■■■□□ 2.17
CCDC180Q9P1Z9 HNRNPA3P12-201ENST00000437410 1063 ntBASIC28.61■■■□□ 2.17
CCDC180Q9P1Z9 PGAP2-207ENST00000463452 931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
CCDC180Q9P1Z9 AC233724.9-201ENST00000511694 407 ntBASIC28.61■■■□□ 2.17
CCDC180Q9P1Z9 OR52V1P-201ENST00000515557 898 ntBASIC28.61■■■□□ 2.17
CCDC180Q9P1Z9 RN7SL134P-201ENST00000579756 303 ntBASIC28.61■■■□□ 2.17
CCDC180Q9P1Z9 SEPT14P19-201ENST00000587432 336 ntTSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
CCDC180Q9P1Z9 STAG3L1-204ENST00000619870 1192 ntTSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
CCDC180Q9P1Z9 LINC01012-203ENST00000628762 743 ntTSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
CCDC180Q9P1Z9 DUOXA1-205ENST00000558422 1678 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
CCDC180Q9P1Z9 DRC3-203ENST00000399187 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
CCDC180Q9P1Z9 TMEM145-203ENST00000598766 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
CCDC180Q9P1Z9 TBC1D3G-201ENST00000569055 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
CCDC180Q9P1Z9 TBC1D3H-201ENST00000610350 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
CCDC180Q9P1Z9 TBC1D3L-202ENST00000617678 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
CCDC180Q9P1Z9 RPN2-202ENST00000373622 2348 ntTSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
CCDC180Q9P1Z9 NIPAL3-203ENST00000358028 1757 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
CCDC180Q9P1Z9 TMEM230-202ENST00000342308 1562 ntTSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
CCDC180Q9P1Z9 ECI2-201ENST00000361538 1380 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
CCDC180Q9P1Z9 LINC02449-201ENST00000304751 795 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
CCDC180Q9P1Z9 S100A2-202ENST00000368708 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
CCDC180Q9P1Z9 MIR1307-201ENST00000408840 149 ntBASIC28.61■■■□□ 2.17
CCDC180Q9P1Z9 MKNK1-205ENST00000428112 1270 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
CCDC180Q9P1Z9 TSTD1-206ENST00000466967 477 ntTSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
CCDC180Q9P1Z9 TCEAL4-206ENST00000468024 1135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37 ms