Protein–RNA interactions for Protein: Q9HD43

PTPRH, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase H, humanhuman

Predictions only

Length 1,115 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRHQ9HD43 AC110285.1-205ENST00000572301 559 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
PTPRHQ9HD43 AL645941.3-201ENST00000580587 577 ntTSL 4 BASIC15.82■□□□□ 0.12
PTPRHQ9HD43 C17orf50-202ENST00000604830 477 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
PTPRHQ9HD43 ALG1L-202ENST00000611639 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
PTPRHQ9HD43 TNR-201ENST00000263525 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
PTPRHQ9HD43 AC064801.2-201ENST00000625052 1303 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
PTPRHQ9HD43 UBL7-201ENST00000361351 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
PTPRHQ9HD43 KIAA1211-206ENST00000541073 4117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PTPRHQ9HD43 LINC00905-203ENST00000588838 1414 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PTPRHQ9HD43 IDH3B-212ENST00000613370 1400 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PTPRHQ9HD43 ATG4B-205ENST00000404914 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PTPRHQ9HD43 ZNF324B-201ENST00000336614 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PTPRHQ9HD43 SRPK1-204ENST00000373825 4592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PTPRHQ9HD43 AC109466.1-209ENST00000486913 1618 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
PTPRHQ9HD43 KRT20-201ENST00000167588 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PTPRHQ9HD43 KNSTRN-201ENST00000249776 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PTPRHQ9HD43 CKMT1B-201ENST00000300283 1779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
PTPRHQ9HD43 CKMT1A-204ENST00000434505 1779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
PTPRHQ9HD43 RN7SL832P-201ENST00000607781 1756 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
PTPRHQ9HD43 MMP25-201ENST00000336577 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PTPRHQ9HD43 SGCE-202ENST00000415788 1871 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
PTPRHQ9HD43 FAM110C-201ENST00000327669 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PTPRHQ9HD43 ARMCX6-208ENST00000539247 1928 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.82■□□□□ 0.12
PTPRHQ9HD43 SDK1-210ENST00000615806 10258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
PTPRHQ9HD43 MYRF-203ENST00000389602 2052 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
PTPRHQ9HD43 NCBP2-206ENST00000447325 2216 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
PTPRHQ9HD43 GNPNAT1-203ENST00000554230 2238 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
PTPRHQ9HD43 MAGED4B-202ENST00000360134 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PTPRHQ9HD43 LYSMD4-204ENST00000409796 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
PTPRHQ9HD43 UBE2J1-201ENST00000435041 4290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
PTPRHQ9HD43 RIPK1-201ENST00000259808 4160 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
PTPRHQ9HD43 DIABLO-201ENST00000267169 1316 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
PTPRHQ9HD43 BNIP2-201ENST00000267859 6325 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
PTPRHQ9HD43 ABCB7-202ENST00000339447 2234 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
PTPRHQ9HD43 MOCS1-201ENST00000340692 2747 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
PTPRHQ9HD43 NIT1-203ENST00000368009 1362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
PTPRHQ9HD43 VWA2-202ENST00000392982 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
PTPRHQ9HD43 LBH-202ENST00000401506 485 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
PTPRHQ9HD43 TBCE-202ENST00000406207 2012 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
PTPRHQ9HD43 ISCA2P1-201ENST00000425548 448 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
PTPRHQ9HD43 CYP20A1-203ENST00000429815 1812 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
PTPRHQ9HD43 CSTF3-202ENST00000431742 715 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
PTPRHQ9HD43 FKBP11-202ENST00000444214 630 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
PTPRHQ9HD43 BSDC1-205ENST00000446293 1505 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
PTPRHQ9HD43 AC007388.1-204ENST00000449569 2517 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
PTPRHQ9HD43 GRID2IP-202ENST00000452113 3428 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
PTPRHQ9HD43 HIF3A-206ENST00000472815 1709 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
PTPRHQ9HD43 PPP2CA-203ENST00000481195 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
PTPRHQ9HD43 TNNT1-203ENST00000536926 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
PTPRHQ9HD43 TMEM91-211ENST00000544232 725 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
PTPRHQ9HD43 PPFIBP1-216ENST00000545334 2805 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
PTPRHQ9HD43 PCBP2-215ENST00000549863 1619 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
PTPRHQ9HD43 AC015660.1-201ENST00000560103 395 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
PTPRHQ9HD43 AC009065.3-201ENST00000562027 627 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
PTPRHQ9HD43 L34079.1-201ENST00000594374 393 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
PTPRHQ9HD43 LAP3-210ENST00000606142 1876 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
PTPRHQ9HD43 CCDC197-206ENST00000640978 1429 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
PTPRHQ9HD43 NAP1L6-202ENST00000641404 1222 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
PTPRHQ9HD43 PTGFRN-201ENST00000393203 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
PTPRHQ9HD43 NBPF9-207ENST00000615421 5835 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
PTPRHQ9HD43 CADPS2-205ENST00000449022 4073 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
PTPRHQ9HD43 KLF5-201ENST00000377687 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
PTPRHQ9HD43 E2F6-202ENST00000381525 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
PTPRHQ9HD43 NOS1AP-205ENST00000493151 5559 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
PTPRHQ9HD43 FXN-201ENST00000377270 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
PTPRHQ9HD43 WARS-203ENST00000358655 2466 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
PTPRHQ9HD43 LINC00299-202ENST00000442956 2342 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
PTPRHQ9HD43 CCND3-201ENST00000372987 2233 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
PTPRHQ9HD43 CAPN7-201ENST00000253693 4353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PTPRHQ9HD43 BLOC1S6-212ENST00000566753 1996 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
PTPRHQ9HD43 ABCG4-205ENST00000619701 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PTPRHQ9HD43 LDHA-203ENST00000379412 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
PTPRHQ9HD43 PRICKLE3-204ENST00000453382 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
PTPRHQ9HD43 TBC1D8-202ENST00000409318 3803 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
PTPRHQ9HD43 KNSTRN-202ENST00000416151 1899 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
PTPRHQ9HD43 MAP3K10-201ENST00000253055 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PTPRHQ9HD43 PORCN-204ENST00000361988 1672 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
PTPRHQ9HD43 LINC01165-201ENST00000445190 1623 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
PTPRHQ9HD43 ITGB7-201ENST00000267082 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PTPRHQ9HD43 SLC26A11-202ENST00000411502 2872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
PTPRHQ9HD43 TUBA3C-202ENST00000618094 1386 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PTPRHQ9HD43 TMEM40-201ENST00000264728 984 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
PTPRHQ9HD43 AC239868.1-201ENST00000369385 493 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
PTPRHQ9HD43 EDF1-202ENST00000371648 809 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PTPRHQ9HD43 AC007952.1-202ENST00000399083 1173 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PTPRHQ9HD43 SLC25A24P2-201ENST00000415059 510 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
PTPRHQ9HD43 LINC01006-204ENST00000435354 545 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
PTPRHQ9HD43 AL358393.1-201ENST00000456771 532 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
PTPRHQ9HD43 RN7SL11P-201ENST00000471305 293 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
PTPRHQ9HD43 MSRB3-206ENST00000535664 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PTPRHQ9HD43 AC104758.2-201ENST00000562716 483 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
PTPRHQ9HD43 ZSCAN32-210ENST00000573830 668 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
PTPRHQ9HD43 RN7SL574P-201ENST00000581512 297 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
PTPRHQ9HD43 ACP7-202ENST00000594229 1149 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
PTPRHQ9HD43 HIST2H2BB-202ENST00000609585 563 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
PTPRHQ9HD43 AF254983.2-201ENST00000612331 135 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
PTPRHQ9HD43 AC106017.2-201ENST00000631194 1173 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
PTPRHQ9HD43 LINC01668-201ENST00000635001 513 ntTSL 4 BASIC15.8■□□□□ 0.12
PTPRHQ9HD43 CCDC22-201ENST00000376227 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PTPRHQ9HD43 RPS23-201ENST00000296674 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
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