Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0F1

CEP44, Centrosomal protein of 44 kDa, humanhuman

Predictions only

Length 390 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CEP44Q9C0F1 AL139010.1-202ENST00000452528 1041 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CEP44Q9C0F1 RNMTL1P1-201ENST00000454103 560 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
CEP44Q9C0F1 AC005740.2-201ENST00000511085 419 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
CEP44Q9C0F1 NOP2-211ENST00000540228 668 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CEP44Q9C0F1 TSPO-206ENST00000583777 636 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CEP44Q9C0F1 RBM8A-206ENST00000632555 751 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CEP44Q9C0F1 Z98259.2-201ENST00000641583 609 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
CEP44Q9C0F1 AC004923.1-202ENST00000642106 209 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
CEP44Q9C0F1 AC139712.1-201ENST00000378256 1875 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
CEP44Q9C0F1 LRCH1-202ENST00000389797 3314 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CEP44Q9C0F1 HCK-209ENST00000538448 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CEP44Q9C0F1 MAP3K11-208ENST00000530153 2830 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CEP44Q9C0F1 SLC4A7-212ENST00000446700 4000 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CEP44Q9C0F1 TARS2-203ENST00000369054 1998 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CEP44Q9C0F1 SLC13A5-208ENST00000573648 1723 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CEP44Q9C0F1 YTHDF3-216ENST00000623280 5193 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CEP44Q9C0F1 RHOXF1P3-203ENST00000640298 2668 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CEP44Q9C0F1 ELAVL1-205ENST00000596459 1473 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CEP44Q9C0F1 AC138028.6-201ENST00000616106 1482 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
CEP44Q9C0F1 DDX49-201ENST00000247003 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CEP44Q9C0F1 CCNDBP1-201ENST00000300213 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CEP44Q9C0F1 CNKSR1-201ENST00000361530 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CEP44Q9C0F1 PAWR-201ENST00000328827 9129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CEP44Q9C0F1 DPP6-205ENST00000427557 2388 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
CEP44Q9C0F1 LINC02395-201ENST00000546821 3157 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CEP44Q9C0F1 CTSD-201ENST00000236671 2123 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CEP44Q9C0F1 CPEB1-211ENST00000615198 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CEP44Q9C0F1 SLC4A8-204ENST00000514353 3041 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CEP44Q9C0F1 HYAL1-209ENST00000618175 2225 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
CEP44Q9C0F1 CEP164-201ENST00000278935 5630 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CEP44Q9C0F1 SRRD-201ENST00000215917 4020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CEP44Q9C0F1 PDHB-206ENST00000474765 1503 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
CEP44Q9C0F1 NR1H3-211ENST00000441012 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CEP44Q9C0F1 APBB1-221ENST00000609360 2642 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
CEP44Q9C0F1 FOS-201ENST00000303562 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CEP44Q9C0F1 CAMSAP3-202ENST00000446248 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CEP44Q9C0F1 AC004899.1-201ENST00000424687 1714 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
CEP44Q9C0F1 GTSF1-201ENST00000305879 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CEP44Q9C0F1 RPL35-201ENST00000348462 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CEP44Q9C0F1 ATP6V1E1-202ENST00000399796 1208 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
CEP44Q9C0F1 ATP5J-205ENST00000400094 589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
CEP44Q9C0F1 TBC1D8-202ENST00000409318 3803 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
CEP44Q9C0F1 AC105362.1-201ENST00000511234 564 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
CEP44Q9C0F1 SCARNA20.5-201ENST00000516991 142 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
CEP44Q9C0F1 TNNT1-209ENST00000587758 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CEP44Q9C0F1 AL136295.7-201ENST00000619226 1200 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
CEP44Q9C0F1 LRWD1-209ENST00000626402 138 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
CEP44Q9C0F1 RPL35-206ENST00000629845 340 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
CEP44Q9C0F1 MXD1-206ENST00000540449 5580 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CEP44Q9C0F1 MAMLD1-203ENST00000370401 4854 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
CEP44Q9C0F1 ZNF846-201ENST00000397902 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CEP44Q9C0F1 SCML4-201ENST00000369020 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
CEP44Q9C0F1 GNAI2-207ENST00000451956 1486 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
CEP44Q9C0F1 FLI1-201ENST00000281428 4151 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CEP44Q9C0F1 OSBPL3-201ENST00000313367 6760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CEP44Q9C0F1 KCNT1-207ENST00000487664 3845 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
CEP44Q9C0F1 IFT52-201ENST00000373030 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CEP44Q9C0F1 MARK3-202ENST00000303622 3283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CEP44Q9C0F1 PCDHA9-202ENST00000532602 6293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CEP44Q9C0F1 RPH3AL-202ENST00000331302 2606 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
CEP44Q9C0F1 DMTN-203ENST00000381470 2601 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
CEP44Q9C0F1 SLC38A5-213ENST00000620913 1993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
CEP44Q9C0F1 PRMT7-203ENST00000449359 2091 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
CEP44Q9C0F1 SORCS2-201ENST00000329016 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
CEP44Q9C0F1 ZNF252P-AS1-201ENST00000527067 3236 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
CEP44Q9C0F1 ATXN2L-202ENST00000336783 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CEP44Q9C0F1 GPN1-201ENST00000264718 2496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CEP44Q9C0F1 PIANP-202ENST00000534837 2695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CEP44Q9C0F1 AC018529.2-202ENST00000611482 3087 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
CEP44Q9C0F1 SPAG9-201ENST00000262013 8273 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CEP44Q9C0F1 DUS4L-201ENST00000265720 2220 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
CEP44Q9C0F1 NAXD-202ENST00000424185 2311 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
CEP44Q9C0F1 HSD17B4-206ENST00000504811 2740 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
CEP44Q9C0F1 MEGF11-203ENST00000409699 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
CEP44Q9C0F1 MPV17-201ENST00000233545 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CEP44Q9C0F1 ERCC1-203ENST00000340192 949 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CEP44Q9C0F1 IP6K2-202ENST00000340879 1185 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CEP44Q9C0F1 C1orf53-201ENST00000367393 588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CEP44Q9C0F1 HNRNPA1P27-201ENST00000412087 955 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
CEP44Q9C0F1 LINC00278-201ENST00000425031 528 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
CEP44Q9C0F1 AL355994.3-201ENST00000437156 466 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
CEP44Q9C0F1 AL645933.1-201ENST00000440087 609 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
CEP44Q9C0F1 KLF2P1-201ENST00000447438 1042 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
CEP44Q9C0F1 BX284668.4-201ENST00000453917 508 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
CEP44Q9C0F1 IGHV4-4-201ENST00000455737 417 ntAPPRIS P1 BASIC14.92□□□□□ -0.02
CEP44Q9C0F1 PGAP2-214ENST00000465307 1100 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
CEP44Q9C0F1 AC044849.1-201ENST00000519737 1188 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
CEP44Q9C0F1 ADIG-204ENST00000537425 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CEP44Q9C0F1 AP000438.1-201ENST00000543624 749 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
CEP44Q9C0F1 AC013355.1-201ENST00000562625 723 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
CEP44Q9C0F1 AL451050.2-201ENST00000606967 682 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
CEP44Q9C0F1 AC138649.2-201ENST00000615886 705 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
CEP44Q9C0F1 C7orf33-201ENST00000307003 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CEP44Q9C0F1 KRT8P28-201ENST00000433288 1390 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
CEP44Q9C0F1 SCUBE1-202ENST00000360835 9808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CEP44Q9C0F1 C12orf76-209ENST00000615315 1580 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
CEP44Q9C0F1 TRAK1-203ENST00000396175 5033 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
CEP44Q9C0F1 OGFOD1-209ENST00000568397 1681 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
CEP44Q9C0F1 LINC01864-201ENST00000587218 1661 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CEP44Q9C0F1 FAM83A-201ENST00000276699 1858 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53 ms