Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0E8

LNPK, Protein lunapark, humanhuman

Predictions only

Length 428 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LNPKQ9C0E8 GNAO1-201ENST00000262493 3337 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
LNPKQ9C0E8 TM9SF1-202ENST00000396854 2055 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
LNPKQ9C0E8 DDX20-201ENST00000369702 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
LNPKQ9C0E8 ATXN2L-204ENST00000382686 3739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
LNPKQ9C0E8 TBC1D1-214ENST00000508802 4119 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.5
LNPKQ9C0E8 PLTP-203ENST00000372431 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
LNPKQ9C0E8 HPD-204ENST00000543163 1709 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
LNPKQ9C0E8 CABLES2-201ENST00000279101 3785 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
LNPKQ9C0E8 BLK-201ENST00000259089 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
LNPKQ9C0E8 OSGIN1-201ENST00000343939 2391 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
LNPKQ9C0E8 SPRY1-208ENST00000622283 2352 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
LNPKQ9C0E8 ITSN1-212ENST00000399367 5722 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
LNPKQ9C0E8 GRIN1-203ENST00000371550 3940 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
LNPKQ9C0E8 TAGLN2-202ENST00000368096 1603 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
LNPKQ9C0E8 APBB1-203ENST00000389906 2684 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
LNPKQ9C0E8 NACC2-201ENST00000277554 6899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
LNPKQ9C0E8 TEX44-201ENST00000313965 1383 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
LNPKQ9C0E8 NHEG1-202ENST00000432330 1357 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
LNPKQ9C0E8 KRT8P28-201ENST00000433288 1390 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
LNPKQ9C0E8 CLDND1-215ENST00000507874 1380 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
LNPKQ9C0E8 CYB561D2-202ENST00000418577 1533 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
LNPKQ9C0E8 UBE3B-212ENST00000540230 1541 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
LNPKQ9C0E8 AC008125.1-201ENST00000548488 1538 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
LNPKQ9C0E8 MAP2K6-209ENST00000613873 1509 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
LNPKQ9C0E8 MAP3K12-201ENST00000267079 4319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
LNPKQ9C0E8 CALCB-203ENST00000533448 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
LNPKQ9C0E8 AL357054.3-201ENST00000607084 2055 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
LNPKQ9C0E8 C2-205ENST00000418949 1658 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
LNPKQ9C0E8 IL32-202ENST00000325568 1105 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
LNPKQ9C0E8 IL32-203ENST00000382213 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
LNPKQ9C0E8 IGLV4-69-201ENST00000390282 419 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
LNPKQ9C0E8 GRAP-202ENST00000395635 834 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
LNPKQ9C0E8 RHCE-206ENST00000413854 1198 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
LNPKQ9C0E8 CNN2P8-201ENST00000421872 913 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
LNPKQ9C0E8 C19orf24-202ENST00000469144 668 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
LNPKQ9C0E8 AC078785.1-201ENST00000496389 734 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
LNPKQ9C0E8 RAMP2-202ENST00000587142 549 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
LNPKQ9C0E8 SLC35G4-201ENST00000588001 1017 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
LNPKQ9C0E8 RAMP2-203ENST00000588576 573 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
LNPKQ9C0E8 SCGB1C2-201ENST00000595228 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
LNPKQ9C0E8 SCN1B-204ENST00000596348 1176 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
LNPKQ9C0E8 FAM66A-202ENST00000602658 546 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
LNPKQ9C0E8 RIC8A-217ENST00000626818 159 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
LNPKQ9C0E8 PDLIM3-213ENST00000629667 1016 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
LNPKQ9C0E8 APBB1-221ENST00000609360 2642 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
LNPKQ9C0E8 CPD-201ENST00000225719 9394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
LNPKQ9C0E8 CU639417.3-201ENST00000624240 1404 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
LNPKQ9C0E8 RGMA-202ENST00000425933 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
LNPKQ9C0E8 TNIK-202ENST00000341852 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
LNPKQ9C0E8 PGBD5-202ENST00000525115 1569 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
LNPKQ9C0E8 MAP3K4-201ENST00000348824 5295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
LNPKQ9C0E8 RSPO3-201ENST00000356698 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
LNPKQ9C0E8 NBEA-208ENST00000629018 10791 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
LNPKQ9C0E8 FBRS-201ENST00000287468 2811 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
LNPKQ9C0E8 PNPLA6-202ENST00000414982 4522 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
LNPKQ9C0E8 NEK10-206ENST00000429845 4250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
LNPKQ9C0E8 ZBTB7B-202ENST00000368426 3594 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
LNPKQ9C0E8 CNN2-201ENST00000263097 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
LNPKQ9C0E8 CNN2-205ENST00000562958 2194 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
LNPKQ9C0E8 MKRN3-201ENST00000314520 2337 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
LNPKQ9C0E8 IL17RD-203ENST00000463523 2348 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
LNPKQ9C0E8 PLPPR1-201ENST00000374874 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
LNPKQ9C0E8 UHRF1BP1L-201ENST00000279907 5168 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
LNPKQ9C0E8 GCFC2-211ENST00000541687 4318 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
LNPKQ9C0E8 ADAM33-201ENST00000350009 3480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
LNPKQ9C0E8 MUTYH-210ENST00000450313 1929 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
LNPKQ9C0E8 NFYC-215ENST00000456393 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
LNPKQ9C0E8 ARHGAP4-201ENST00000350060 3235 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
LNPKQ9C0E8 AC089987.1-201ENST00000551654 2209 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
LNPKQ9C0E8 TGOLN2-203ENST00000398263 6138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
LNPKQ9C0E8 AL354989.2-201ENST00000435838 1540 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
LNPKQ9C0E8 CSRP1-201ENST00000340006 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
LNPKQ9C0E8 SLC6A12-207ENST00000536824 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
LNPKQ9C0E8 FRMD3-201ENST00000304195 5297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
LNPKQ9C0E8 PCDH19-202ENST00000373034 9756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
LNPKQ9C0E8 AJUBA-201ENST00000262713 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
LNPKQ9C0E8 IFT20-202ENST00000357896 974 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
LNPKQ9C0E8 DNAJC21-202ENST00000382021 6208 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
LNPKQ9C0E8 AC099552.1-201ENST00000431083 744 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
LNPKQ9C0E8 KLF3-AS1-204ENST00000505240 567 ntTSL 4 BASIC18.19■□□□□ 0.5
LNPKQ9C0E8 NDUFC1-210ENST00000539387 725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
LNPKQ9C0E8 MAX-211ENST00000555667 574 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
LNPKQ9C0E8 MIR3197-201ENST00000582241 73 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
LNPKQ9C0E8 ANXA2R-202ENST00000616064 1265 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
LNPKQ9C0E8 KLF3-AS1-207ENST00000620339 558 ntTSL 4 BASIC18.19■□□□□ 0.5
LNPKQ9C0E8 AC006453.4-201ENST00000636949 1252 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
LNPKQ9C0E8 MKRN2-201ENST00000170447 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
LNPKQ9C0E8 ANKHD1-EIF4EBP3-203ENST00000532219 8246 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
LNPKQ9C0E8 CDCA3-207ENST00000538862 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
LNPKQ9C0E8 ADAM12-201ENST00000368676 3313 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
LNPKQ9C0E8 KIFC3-204ENST00000465878 3225 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
LNPKQ9C0E8 R3HDM2P2-201ENST00000401880 2116 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
LNPKQ9C0E8 PHKG1-210ENST00000537360 2139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
LNPKQ9C0E8 RCN2-203ENST00000394885 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
LNPKQ9C0E8 PSEN2-202ENST00000366783 2306 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
LNPKQ9C0E8 CPN2-202ENST00000429275 2008 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
LNPKQ9C0E8 KDM1B-201ENST00000297792 3811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
LNPKQ9C0E8 SLC1A6-201ENST00000221742 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
LNPKQ9C0E8 CCDC51-201ENST00000395694 1560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
LNPKQ9C0E8 GK-204ENST00000378945 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.7 ms