Protein–RNA interactions for Protein: Q9C000

NLRP1, NACHT, LRR and PYD domains-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,473 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NLRP1Q9C000 TAF12-201ENST00000263974 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
NLRP1Q9C000 PRL-201ENST00000306482 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
NLRP1Q9C000 NECTIN1-203ENST00000341398 1377 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
NLRP1Q9C000 PDE4C-204ENST00000539010 1699 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
NLRP1Q9C000 ADHFE1-203ENST00000396623 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
NLRP1Q9C000 LINC01285-201ENST00000412422 2289 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
NLRP1Q9C000 C1orf87-202ENST00000450089 1307 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
NLRP1Q9C000 FBXL12-201ENST00000247977 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
NLRP1Q9C000 NRCAM-217ENST00000613830 3025 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
NLRP1Q9C000 AQP7-202ENST00000377425 1068 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
NLRP1Q9C000 NQO2-204ENST00000380454 851 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
NLRP1Q9C000 ATP5J-202ENST00000400087 826 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
NLRP1Q9C000 UBE2I-206ENST00000403747 1217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
NLRP1Q9C000 LY6G6E-227ENST00000409239 776 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC20.46■□□□□ 0.87
NLRP1Q9C000 CTBP2P6-201ENST00000526402 1229 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
NLRP1Q9C000 SORD2P-201ENST00000558556 1069 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
NLRP1Q9C000 RPL18A-203ENST00000599870 1084 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
NLRP1Q9C000 PRMT1P1-201ENST00000604252 1009 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
NLRP1Q9C000 AC080013.5-201ENST00000607044 679 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
NLRP1Q9C000 URAHP-205ENST00000610227 398 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
NLRP1Q9C000 LINC01869-204ENST00000635639 1047 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
NLRP1Q9C000 AL592295.3-201ENST00000637155 863 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
NLRP1Q9C000 SLC25A31-201ENST00000281154 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
NLRP1Q9C000 INA-201ENST00000369849 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
NLRP1Q9C000 TMEM97-201ENST00000226230 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
NLRP1Q9C000 TUB-AS1-201ENST00000506601 2021 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
NLRP1Q9C000 MAPT-213ENST00000571987 2277 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
NLRP1Q9C000 EXOC3L1-201ENST00000314586 2510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
NLRP1Q9C000 GSKIP-207ENST00000556095 3834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
NLRP1Q9C000 RNF34-211ENST00000613529 1449 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
NLRP1Q9C000 DPEP2-202ENST00000393847 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
NLRP1Q9C000 LRRN2-203ENST00000367177 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
NLRP1Q9C000 SATB2-206ENST00000457245 2656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
NLRP1Q9C000 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
NLRP1Q9C000 NMBR-201ENST00000258042 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
NLRP1Q9C000 ADPRHL1-201ENST00000356501 1877 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
NLRP1Q9C000 LCK-206ENST00000373564 2137 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
NLRP1Q9C000 SKOR1-201ENST00000341418 3332 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.87
NLRP1Q9C000 DDIAS-203ENST00000525361 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
NLRP1Q9C000 RTFDC1-203ENST00000395881 1572 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
NLRP1Q9C000 FAM76A-203ENST00000373949 2273 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
NLRP1Q9C000 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC20.45■□□□□ 0.86
NLRP1Q9C000 CNDP1-201ENST00000358821 2215 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
NLRP1Q9C000 ENDOV-213ENST00000520367 2680 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
NLRP1Q9C000 C11orf53-201ENST00000280325 1208 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
NLRP1Q9C000 G0S2-201ENST00000367029 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
NLRP1Q9C000 PLA2G12B-201ENST00000373032 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
NLRP1Q9C000 AL137026.2-201ENST00000437014 841 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
NLRP1Q9C000 AC099548.2-201ENST00000491047 571 ntTSL 4 BASIC20.45■□□□□ 0.86
NLRP1Q9C000 AC011921.1-201ENST00000559739 557 ntTSL 4 BASIC20.45■□□□□ 0.86
NLRP1Q9C000 AC009163.5-202ENST00000571737 466 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
NLRP1Q9C000 AC023389.1-201ENST00000577846 576 ntTSL 4 BASIC20.45■□□□□ 0.86
NLRP1Q9C000 QRICH1-201ENST00000357496 3083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
NLRP1Q9C000 TMEM56-RWDD3-202ENST00000604534 1491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
NLRP1Q9C000 PGRMC1-201ENST00000217971 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
NLRP1Q9C000 HOXD3-202ENST00000410016 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
NLRP1Q9C000 PLD3-204ENST00000409281 2115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
NLRP1Q9C000 CRAT-201ENST00000318080 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
NLRP1Q9C000 TMEM9B-202ENST00000525069 1433 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
NLRP1Q9C000 EPS8L2-218ENST00000530636 2469 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
NLRP1Q9C000 CYP20A1-203ENST00000429815 1812 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
NLRP1Q9C000 CNOT8-202ENST00000403027 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
NLRP1Q9C000 GLIDR-204ENST00000638724 1765 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
NLRP1Q9C000 ABCB6-201ENST00000265316 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
NLRP1Q9C000 NGFR-201ENST00000172229 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
NLRP1Q9C000 STXBP5-207ENST00000546097 2160 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
NLRP1Q9C000 PLCG1-201ENST00000244007 5285 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
NLRP1Q9C000 KCNA7-201ENST00000221444 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
NLRP1Q9C000 PLTP-203ENST00000372431 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
NLRP1Q9C000 SLC37A4-201ENST00000330775 2102 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
NLRP1Q9C000 WDR81-204ENST00000419248 3315 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
NLRP1Q9C000 SNX15-201ENST00000352068 771 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
NLRP1Q9C000 LINC01656-201ENST00000415702 630 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
NLRP1Q9C000 AL121787.1-202ENST00000445838 876 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
NLRP1Q9C000 AC078785.1-204ENST00000460707 764 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
NLRP1Q9C000 AC087071.1-201ENST00000469264 427 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
NLRP1Q9C000 SOX2-OT-209ENST00000485035 561 ntTSL 4 BASIC20.44■□□□□ 0.86
NLRP1Q9C000 AC008443.1-202ENST00000506340 687 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
NLRP1Q9C000 AC025171.3-201ENST00000509036 472 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
NLRP1Q9C000 AP003351.1-201ENST00000522743 668 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
NLRP1Q9C000 C12orf57-204ENST00000540506 551 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
NLRP1Q9C000 AC004801.1-201ENST00000549557 360 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
NLRP1Q9C000 AC009055.1-201ENST00000562656 781 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
NLRP1Q9C000 SLC9A3R2-204ENST00000563587 1037 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
NLRP1Q9C000 SOX2-OT-222ENST00000595084 853 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
NLRP1Q9C000 SOX2-OT-232ENST00000600386 792 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
NLRP1Q9C000 AC008906.2-201ENST00000606656 474 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
NLRP1Q9C000 AC233280.19-201ENST00000633223 136 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
NLRP1Q9C000 ETV5-206ENST00000434744 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
NLRP1Q9C000 FGGY-203ENST00000371212 1640 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
NLRP1Q9C000 LIPA-205ENST00000456827 2527 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
NLRP1Q9C000 TDRD10-201ENST00000368480 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
NLRP1Q9C000 RRAGA-201ENST00000380527 1589 ntAPPRIS P1 BASIC20.44■□□□□ 0.86
NLRP1Q9C000 GSPT2-201ENST00000340438 2802 ntAPPRIS P1 BASIC20.44■□□□□ 0.86
NLRP1Q9C000 SIGLEC10-201ENST00000339313 2256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
NLRP1Q9C000 F10-201ENST00000375551 1509 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
NLRP1Q9C000 PAK1-210ENST00000528203 1878 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
NLRP1Q9C000 AC064801.2-201ENST00000625052 1303 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
NLRP1Q9C000 FAM86C1-201ENST00000346333 2010 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
NLRP1Q9C000 ZNF620-202ENST00000418905 2022 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 74.7 ms