Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZW2

SLC13A1, Solute carrier family 13 member 1, humanhuman

Predictions only

Length 595 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC13A1Q9BZW2 CARTPT-201ENST00000296777 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SLC13A1Q9BZW2 CACNG5-201ENST00000307139 926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SLC13A1Q9BZW2 FAM86MP-201ENST00000340703 885 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
SLC13A1Q9BZW2 NUS1P3-201ENST00000423502 862 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
SLC13A1Q9BZW2 AL355994.2-201ENST00000447882 704 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
SLC13A1Q9BZW2 POLR2F-208ENST00000470701 584 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SLC13A1Q9BZW2 SLC45A2-204ENST00000509381 1040 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SLC13A1Q9BZW2 NME2-206ENST00000513177 692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SLC13A1Q9BZW2 AP002992.1-201ENST00000527519 491 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SLC13A1Q9BZW2 SDR39U1-212ENST00000555365 976 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SLC13A1Q9BZW2 AC090825.1-203ENST00000558188 582 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SLC13A1Q9BZW2 MIR22HG-212ENST00000577164 931 ntTSL 4 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SLC13A1Q9BZW2 ANAPC11-215ENST00000578550 599 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SLC13A1Q9BZW2 HBP1-201ENST00000222574 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SLC13A1Q9BZW2 TRAF1-201ENST00000373887 6324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SLC13A1Q9BZW2 PLEKHO2-202ENST00000616065 3569 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SLC13A1Q9BZW2 GLB1L2-205ENST00000535456 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SLC13A1Q9BZW2 GAD2-203ENST00000376261 5858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SLC13A1Q9BZW2 AC092135.3-201ENST00000624151 1846 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
SLC13A1Q9BZW2 ZNF596-201ENST00000308811 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SLC13A1Q9BZW2 POLRMT-202ENST00000588649 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SLC13A1Q9BZW2 EIF5-202ENST00000392715 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SLC13A1Q9BZW2 TUBB1P2-201ENST00000422712 1306 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
SLC13A1Q9BZW2 TUBB1P1-201ENST00000503144 1300 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
SLC13A1Q9BZW2 SNHG20-204ENST00000566583 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SLC13A1Q9BZW2 AL360270.3-201ENST00000609118 1348 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
SLC13A1Q9BZW2 GPR37-201ENST00000303921 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SLC13A1Q9BZW2 ACSM1-201ENST00000307493 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SLC13A1Q9BZW2 PRMT7-203ENST00000449359 2091 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SLC13A1Q9BZW2 AICDA-201ENST00000229335 2819 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SLC13A1Q9BZW2 PLA1A-201ENST00000273371 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SLC13A1Q9BZW2 ADCYAP1R1-204ENST00000409489 1761 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SLC13A1Q9BZW2 TMPRSS3-204ENST00000433957 2403 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SLC13A1Q9BZW2 ARHGAP36-201ENST00000276211 3083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SLC13A1Q9BZW2 TRIM41-201ENST00000315073 3637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SLC13A1Q9BZW2 GPSM3-207ENST00000375043 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SLC13A1Q9BZW2 C7orf49-201ENST00000393114 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SLC13A1Q9BZW2 CDT1-201ENST00000301019 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SLC13A1Q9BZW2 CASC2-202ENST00000426021 3232 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SLC13A1Q9BZW2 HELZ2-204ENST00000467148 8064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SLC13A1Q9BZW2 PITX2-205ENST00000394598 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SLC13A1Q9BZW2 JARID2-202ENST00000397311 5595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SLC13A1Q9BZW2 VCAN-211ENST00000513984 1825 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SLC13A1Q9BZW2 VSIG10L-201ENST00000335624 3397 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SLC13A1Q9BZW2 LHB-201ENST00000221421 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SLC13A1Q9BZW2 DYNLRB2-201ENST00000305904 497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SLC13A1Q9BZW2 TRMT112-201ENST00000308774 561 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SLC13A1Q9BZW2 ZNRD1-201ENST00000332435 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SLC13A1Q9BZW2 MPV17-206ENST00000402722 827 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SLC13A1Q9BZW2 PRAP1-201ENST00000433452 971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SLC13A1Q9BZW2 TMEM107-204ENST00000437139 747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SLC13A1Q9BZW2 AL049698.1-202ENST00000441716 757 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SLC13A1Q9BZW2 BX322559.1-201ENST00000456613 319 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SLC13A1Q9BZW2 STAG3L5P-205ENST00000473757 1255 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SLC13A1Q9BZW2 AC113383.1-201ENST00000514696 582 ntTSL 4 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SLC13A1Q9BZW2 PAFAH1B3-202ENST00000538771 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SLC13A1Q9BZW2 CD63-208ENST00000549117 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SLC13A1Q9BZW2 AC023310.1-201ENST00000554836 735 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
SLC13A1Q9BZW2 IFI27L1-210ENST00000556381 804 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SLC13A1Q9BZW2 LINC02299-201ENST00000556669 430 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SLC13A1Q9BZW2 AL133153.2-201ENST00000557524 303 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SLC13A1Q9BZW2 HIRIP3-204ENST00000564026 988 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SLC13A1Q9BZW2 AC025279.2-201ENST00000569730 653 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
SLC13A1Q9BZW2 GNRHR2-203ENST00000581100 1187 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
SLC13A1Q9BZW2 INO80C-210ENST00000590757 595 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SLC13A1Q9BZW2 AC010328.2-201ENST00000597698 1111 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
SLC13A1Q9BZW2 KIAA0319-204ENST00000537886 6622 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SLC13A1Q9BZW2 SFXN3-201ENST00000224807 3089 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SLC13A1Q9BZW2 ICA1-207ENST00000406470 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SLC13A1Q9BZW2 RNASEH1-201ENST00000315212 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SLC13A1Q9BZW2 ELP6-201ENST00000296149 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SLC13A1Q9BZW2 DARS-AS1-209ENST00000594219 1420 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SLC13A1Q9BZW2 TPM3-205ENST00000328159 1771 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SLC13A1Q9BZW2 CDKN1A-208ENST00000615513 2102 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SLC13A1Q9BZW2 TOR2A-202ENST00000373281 2477 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SLC13A1Q9BZW2 CDH16-202ENST00000394055 2821 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SLC13A1Q9BZW2 LINC00094-204ENST00000599836 1689 ntAPPRIS P5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SLC13A1Q9BZW2 TATDN3-202ENST00000366974 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SLC13A1Q9BZW2 IKBKB-217ENST00000520810 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SLC13A1Q9BZW2 MAP2K1-201ENST00000307102 3410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SLC13A1Q9BZW2 ILF2-205ENST00000615950 1906 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SLC13A1Q9BZW2 AGRN-201ENST00000379370 7323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SLC13A1Q9BZW2 SRPX-206ENST00000544439 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SLC13A1Q9BZW2 ZC3HAV1-203ENST00000464606 4776 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SLC13A1Q9BZW2 LINC01205-202ENST00000497996 1493 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SLC13A1Q9BZW2 ACP2-205ENST00000527256 1499 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SLC13A1Q9BZW2 AC104758.3-201ENST00000563349 1453 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SLC13A1Q9BZW2 JADE2-203ENST00000395003 6465 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SLC13A1Q9BZW2 HNRNPH3-201ENST00000265866 2339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SLC13A1Q9BZW2 FAN1-207ENST00000565466 2304 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SLC13A1Q9BZW2 BARHL2-201ENST00000370445 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SLC13A1Q9BZW2 PPIL2-202ENST00000398831 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SLC13A1Q9BZW2 TRAFD1-201ENST00000257604 3178 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SLC13A1Q9BZW2 KIF1A-201ENST00000320389 8832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SLC13A1Q9BZW2 GPN1-201ENST00000264718 2496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SLC13A1Q9BZW2 NEK2-201ENST00000366998 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SLC13A1Q9BZW2 FAM118B-210ENST00000627851 1862 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SLC13A1Q9BZW2 PLLP-205ENST00000613167 7578 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SLC13A1Q9BZW2 POLR2I-201ENST00000221859 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SLC13A1Q9BZW2 AKIP1-202ENST00000309357 1232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.9 ms