Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXC9

BBS2, Bardet-Biedl syndrome 2 protein, humanhuman

Predictions only

Length 721 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BBS2Q9BXC9 AL139412.1-202ENST00000452465 675 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
BBS2Q9BXC9 SNHG14-209ENST00000456576 544 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
BBS2Q9BXC9 AC093904.2-201ENST00000495580 418 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
BBS2Q9BXC9 FADS2-212ENST00000522639 360 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
BBS2Q9BXC9 AC090857.1-201ENST00000527400 390 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
BBS2Q9BXC9 AL161670.2-201ENST00000557650 1227 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
BBS2Q9BXC9 FADS2-215ENST00000574708 385 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
BBS2Q9BXC9 FBXL12-212ENST00000592067 879 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
BBS2Q9BXC9 CYP1B1-AS1-221ENST00000627172 995 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
BBS2Q9BXC9 ZFY-201ENST00000155093 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
BBS2Q9BXC9 ATP5F1-202ENST00000369722 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
BBS2Q9BXC9 ADD2-208ENST00000430656 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
BBS2Q9BXC9 C1R-202ENST00000536053 2347 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
BBS2Q9BXC9 C3orf62-201ENST00000343010 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
BBS2Q9BXC9 F10-203ENST00000409306 1450 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
BBS2Q9BXC9 KCTD3-201ENST00000259154 3931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
BBS2Q9BXC9 FAM110C-201ENST00000327669 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
BBS2Q9BXC9 SYBU-208ENST00000440310 3072 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
BBS2Q9BXC9 CASP6-202ENST00000352981 1347 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
BBS2Q9BXC9 CALM1-216ENST00000626705 1341 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
BBS2Q9BXC9 PODN-202ENST00000371500 3287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
BBS2Q9BXC9 NUP88-207ENST00000573584 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
BBS2Q9BXC9 TMEM117-201ENST00000266534 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
BBS2Q9BXC9 GSG1L-203ENST00000447459 4916 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
BBS2Q9BXC9 MAEL-202ENST00000367872 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
BBS2Q9BXC9 MVB12B-206ENST00000489637 2666 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
BBS2Q9BXC9 FXYD5-201ENST00000342879 1580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
BBS2Q9BXC9 UBXN11-202ENST00000357089 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
BBS2Q9BXC9 PKD2L2-205ENST00000508638 2333 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
BBS2Q9BXC9 RGS6-217ENST00000555571 1764 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
BBS2Q9BXC9 SPATA20-201ENST00000006658 2719 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
BBS2Q9BXC9 LINC01107-201ENST00000446979 1975 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
BBS2Q9BXC9 MYL6-219ENST00000551589 1438 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
BBS2Q9BXC9 ARHGAP9-201ENST00000393791 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
BBS2Q9BXC9 NTRK3-203ENST00000357724 2980 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
BBS2Q9BXC9 SDHAF2-201ENST00000301761 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
BBS2Q9BXC9 BRF1-211ENST00000547530 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
BBS2Q9BXC9 NOP2-222ENST00000617555 2017 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
BBS2Q9BXC9 LINC02551-202ENST00000533812 2203 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
BBS2Q9BXC9 KIF17-201ENST00000247986 3969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
BBS2Q9BXC9 F8-201ENST00000330287 2620 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
BBS2Q9BXC9 KIAA1468-201ENST00000256858 5579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
BBS2Q9BXC9 ATP6V1E1-202ENST00000399796 1208 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
BBS2Q9BXC9 CMC1-204ENST00000423894 549 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
BBS2Q9BXC9 LINC01006-204ENST00000435354 545 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
BBS2Q9BXC9 CLDN11-207ENST00000486975 1139 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
BBS2Q9BXC9 NUP210P1-202ENST00000504322 710 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
BBS2Q9BXC9 ZNF419-208ENST00000518999 746 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
BBS2Q9BXC9 ANO1-AS2-202ENST00000533327 498 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
BBS2Q9BXC9 MRPL48-210ENST00000542303 661 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
BBS2Q9BXC9 RBM8B-201ENST00000555532 525 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
BBS2Q9BXC9 PYY-202ENST00000592796 580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
BBS2Q9BXC9 C11orf16-202ENST00000525780 1685 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
BBS2Q9BXC9 AC144522.1-201ENST00000625111 1658 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
BBS2Q9BXC9 MED15-202ENST00000292733 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
BBS2Q9BXC9 SLC4A7-210ENST00000440156 4120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
BBS2Q9BXC9 SLC6A9-203ENST00000372306 1926 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
BBS2Q9BXC9 SH3KBP1-201ENST00000379697 1944 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
BBS2Q9BXC9 PTPRU-204ENST00000428026 5550 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
BBS2Q9BXC9 OSTF1-201ENST00000346234 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
BBS2Q9BXC9 MEGF11-204ENST00000422354 5914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
BBS2Q9BXC9 IL1RAP-209ENST00000422940 1957 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
BBS2Q9BXC9 MECR-202ENST00000373791 2416 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
BBS2Q9BXC9 TERF1-201ENST00000276602 3268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
BBS2Q9BXC9 RANBP1-208ENST00000430524 1389 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
BBS2Q9BXC9 ADAMTS14-201ENST00000373207 5260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
BBS2Q9BXC9 WNT16-201ENST00000222462 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
BBS2Q9BXC9 LMNA-201ENST00000347559 3137 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
BBS2Q9BXC9 TBC1D3G-201ENST00000569055 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
BBS2Q9BXC9 TBC1D3H-201ENST00000610350 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
BBS2Q9BXC9 TBC1D3L-202ENST00000617678 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
BBS2Q9BXC9 NATD1-201ENST00000611551 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
BBS2Q9BXC9 RABL6-211ENST00000629216 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
BBS2Q9BXC9 PCYOX1-201ENST00000264441 2959 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
BBS2Q9BXC9 RHOH-218ENST00000613272 1865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
BBS2Q9BXC9 REM1-201ENST00000201979 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
BBS2Q9BXC9 PHLDB2-203ENST00000412622 5996 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
BBS2Q9BXC9 LRRC57-202ENST00000397130 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
BBS2Q9BXC9 KIF1A-201ENST00000320389 8832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
BBS2Q9BXC9 MICAL1-201ENST00000358577 3142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
BBS2Q9BXC9 HMGN3-201ENST00000275036 831 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
BBS2Q9BXC9 MAP2K3-201ENST00000316920 1246 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
BBS2Q9BXC9 HIST1H1B-201ENST00000331442 681 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
BBS2Q9BXC9 ALG1L-201ENST00000340333 805 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
BBS2Q9BXC9 HMGN3-202ENST00000344726 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
BBS2Q9BXC9 HNRNPA1P27-201ENST00000412087 955 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
BBS2Q9BXC9 BX284668.5-201ENST00000422124 406 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
BBS2Q9BXC9 AC078875.1-201ENST00000431907 724 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
BBS2Q9BXC9 AC006122.1-201ENST00000493323 440 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
BBS2Q9BXC9 HDAC2-AS2-213ENST00000520891 603 ntTSL 4 BASIC15.1■□□□□ 0.01
BBS2Q9BXC9 AC025259.3-202ENST00000564363 687 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
BBS2Q9BXC9 FGFR3P5-201ENST00000564496 886 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
BBS2Q9BXC9 RN7SL574P-201ENST00000581512 297 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
BBS2Q9BXC9 ALG1L-202ENST00000611639 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
BBS2Q9BXC9 MUC1-226ENST00000614519 1093 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
BBS2Q9BXC9 F2RL1-201ENST00000296677 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
BBS2Q9BXC9 MARC1-201ENST00000366910 7439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
BBS2Q9BXC9 ALDH3A2-221ENST00000581518 2785 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
BBS2Q9BXC9 MBNL1-205ENST00000355460 5941 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
BBS2Q9BXC9 HTR7-201ENST00000277874 3028 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.4 ms