Protein–RNA interactions for Protein: Q9BX26

SYCP2, Synaptonemal complex protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,530 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYCP2Q9BX26 SLC37A1-201ENST00000352133 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SYCP2Q9BX26 LINC00299-202ENST00000442956 2342 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SYCP2Q9BX26 TARBP2-202ENST00000394357 1402 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SYCP2Q9BX26 MKRN2-202ENST00000411987 1436 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SYCP2Q9BX26 PTPN21-208ENST00000556564 6166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SYCP2Q9BX26 SMARCD1-202ENST00000394963 3658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SYCP2Q9BX26 ZNF662-201ENST00000328199 3186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SYCP2Q9BX26 ZDHHC20-202ENST00000382466 5338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SYCP2Q9BX26 AC106707.1-201ENST00000475981 1640 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SYCP2Q9BX26 ELP4-228ENST00000640954 1612 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SYCP2Q9BX26 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SYCP2Q9BX26 MFSD13A-201ENST00000238936 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SYCP2Q9BX26 RBBP4-204ENST00000414241 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SYCP2Q9BX26 MPIG6B-204ENST00000375809 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SYCP2Q9BX26 HPGD-201ENST00000296521 1171 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SYCP2Q9BX26 OR51A9P-201ENST00000422578 911 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
SYCP2Q9BX26 AC103702.2-203ENST00000425510 379 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SYCP2Q9BX26 LINC02063-201ENST00000503415 566 ntTSL 4 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SYCP2Q9BX26 MIR5001-201ENST00000580185 100 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
SYCP2Q9BX26 AC004528.1-201ENST00000588380 641 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SYCP2Q9BX26 TUBB6-214ENST00000592683 481 ntTSL 4 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SYCP2Q9BX26 AC010127.1-202ENST00000597623 713 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SYCP2Q9BX26 ANO10-213ENST00000451430 2019 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SYCP2Q9BX26 WNK2-204ENST00000427277 6108 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SYCP2Q9BX26 CECR7-202ENST00000441006 2726 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SYCP2Q9BX26 CHPF2-204ENST00000495645 2709 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SYCP2Q9BX26 ADAM15-201ENST00000271836 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SYCP2Q9BX26 USP39-220ENST00000613444 2161 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SYCP2Q9BX26 SLC20A2-207ENST00000520179 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SYCP2Q9BX26 AC015909.5-201ENST00000624336 2266 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
SYCP2Q9BX26 LMNB2-201ENST00000325327 4671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SYCP2Q9BX26 AMMECR1-201ENST00000262844 5504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SYCP2Q9BX26 OBSL1-203ENST00000373876 5503 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SYCP2Q9BX26 PPP1R37-201ENST00000221462 3163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SYCP2Q9BX26 WIPF3-202ENST00000409123 3491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SYCP2Q9BX26 ERLIN2-205ENST00000518586 2623 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SYCP2Q9BX26 ARVCF-204ENST00000406522 2682 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SYCP2Q9BX26 GGACT-202ENST00000455100 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SYCP2Q9BX26 ATP6V1B2-201ENST00000276390 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SYCP2Q9BX26 AP000866.1-201ENST00000499143 2886 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SYCP2Q9BX26 LRP11-201ENST00000239367 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SYCP2Q9BX26 AC025171.1-202ENST00000499871 2271 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
SYCP2Q9BX26 IFNLR1-204ENST00000374419 953 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
SYCP2Q9BX26 ZNF286A-201ENST00000395893 654 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1
SYCP2Q9BX26 RPL3P5-201ENST00000441645 1232 ntBASIC21.33■■□□□ 1
SYCP2Q9BX26 AC109479.3-201ENST00000520163 360 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1
SYCP2Q9BX26 AC005845.1-201ENST00000539206 653 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1
SYCP2Q9BX26 TROAP-213ENST00000550709 778 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
SYCP2Q9BX26 ADAMTS9-AS1-216ENST00000626280 882 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
SYCP2Q9BX26 GSN-209ENST00000449733 2702 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
SYCP2Q9BX26 FKBP4P8-201ENST00000610931 1369 ntBASIC21.33■■□□□ 1
SYCP2Q9BX26 ADGRA3-202ENST00000334304 4566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
SYCP2Q9BX26 TBC1D27-202ENST00000424239 1573 ntBASIC21.33■■□□□ 1
SYCP2Q9BX26 WDR5-201ENST00000358625 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
SYCP2Q9BX26 APBB3-202ENST00000356738 1804 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
SYCP2Q9BX26 ABHD14B-201ENST00000315877 2236 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
SYCP2Q9BX26 ORMDL3-202ENST00000394169 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
SYCP2Q9BX26 PCSK2-205ENST00000536609 2275 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
SYCP2Q9BX26 DNAJA1-201ENST00000330899 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SYCP2Q9BX26 AC105917.1-201ENST00000506637 2539 ntBASIC21.32■■□□□ 1
SYCP2Q9BX26 SLC19A2-202ENST00000367804 2976 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SYCP2Q9BX26 DGKZ-201ENST00000318201 3213 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
SYCP2Q9BX26 SMO-201ENST00000249373 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SYCP2Q9BX26 DDX49-201ENST00000247003 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SYCP2Q9BX26 PPT2-245ENST00000361568 1759 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SYCP2Q9BX26 HLA-DRB5-201ENST00000374975 1260 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
SYCP2Q9BX26 TRMT10B-202ENST00000377753 2027 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
SYCP2Q9BX26 AC103592.1-201ENST00000394513 664 ntBASIC21.32■■□□□ 1
SYCP2Q9BX26 VCX3A-202ENST00000398729 808 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
SYCP2Q9BX26 LINC01983-201ENST00000413586 574 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
SYCP2Q9BX26 IGLV9-49-201ENST00000427632 409 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
SYCP2Q9BX26 ABHD16A-202ENST00000440843 1906 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
SYCP2Q9BX26 AL157392.3-204ENST00000440878 397 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
SYCP2Q9BX26 AL512622.1-202ENST00000443922 478 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
SYCP2Q9BX26 STAG1-206ENST00000480733 1304 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
SYCP2Q9BX26 LRRC75A-AS1-214ENST00000487066 763 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
SYCP2Q9BX26 FAM167A-AS1-202ENST00000533578 1222 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
SYCP2Q9BX26 B3GNT4-206ENST00000546192 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
SYCP2Q9BX26 DHRS7-209ENST00000557185 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SYCP2Q9BX26 IGHV3OR15-7-201ENST00000558565 359 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
SYCP2Q9BX26 AC100778.2-201ENST00000580150 483 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
SYCP2Q9BX26 RIOK3-207ENST00000581585 1966 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
SYCP2Q9BX26 ZNF556-202ENST00000586426 1643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SYCP2Q9BX26 HKR1-220ENST00000591259 734 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SYCP2Q9BX26 OR2V1-205ENST00000642036 2609 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
SYCP2Q9BX26 DLC1-203ENST00000358919 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SYCP2Q9BX26 SUGP2-202ENST00000337018 3640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SYCP2Q9BX26 KLHDC8A-201ENST00000367155 2928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
SYCP2Q9BX26 PLEKHG5-212ENST00000537245 4794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
SYCP2Q9BX26 BUD13-201ENST00000260210 2196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SYCP2Q9BX26 MCM4-201ENST00000262105 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SYCP2Q9BX26 ZNF853-201ENST00000457543 3857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
SYCP2Q9BX26 TMEM45A-202ENST00000403410 1910 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
SYCP2Q9BX26 DAG1-220ENST00000539901 5665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
SYCP2Q9BX26 HERPUD1-203ENST00000379792 1782 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
SYCP2Q9BX26 ACVR1C-204ENST00000409680 1786 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SYCP2Q9BX26 AC093797.1-201ENST00000411847 1789 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SYCP2Q9BX26 ANXA6-211ENST00000521512 1793 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
SYCP2Q9BX26 TRIM39-201ENST00000376656 3338 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
SYCP2Q9BX26 IMMT-212ENST00000620815 1520 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.2 ms