Protein–RNA interactions for Protein: Q9BTV4

TMEM43, Transmembrane protein 43, humanhuman

Predictions only

Length 400 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM43Q9BTV4 BAIAP2-201ENST00000321280 1939 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
TMEM43Q9BTV4 FBXO3-203ENST00000526785 5798 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
TMEM43Q9BTV4 GPAT4-201ENST00000396987 6298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
TMEM43Q9BTV4 SLC35C2-201ENST00000243896 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
TMEM43Q9BTV4 FAM189A2-201ENST00000257515 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
TMEM43Q9BTV4 FBLN7-203ENST00000409450 1394 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
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TMEM43Q9BTV4 TMEM200A-204ENST00000617887 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
TMEM43Q9BTV4 KCNMA1-262ENST00000639489 4302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
TMEM43Q9BTV4 C4B-AS1-205ENST00000415626 2095 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
TMEM43Q9BTV4 C4A-AS1-204ENST00000458633 2095 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
TMEM43Q9BTV4 RNASEH2C-201ENST00000308418 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
TMEM43Q9BTV4 FYTTD1-201ENST00000241502 6866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
TMEM43Q9BTV4 KLHL33-203ENST00000637228 5404 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
TMEM43Q9BTV4 ARFIP1-202ENST00000356064 1302 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
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TMEM43Q9BTV4 FZD5-201ENST00000295417 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
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TMEM43Q9BTV4 PQLC2L-201ENST00000312275 1201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
TMEM43Q9BTV4 MGST3-203ENST00000367885 680 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
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TMEM43Q9BTV4 AC093904.1-201ENST00000474561 455 ntTSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
TMEM43Q9BTV4 SBSN-202ENST00000518157 957 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
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TMEM43Q9BTV4 AC105339.1-202ENST00000559535 1283 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
TMEM43Q9BTV4 AC012645.3-203ENST00000567153 520 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
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TMEM43Q9BTV4 STRADA-221ENST00000582137 1238 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
TMEM43Q9BTV4 HDDC2-203ENST00000608284 538 ntTSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
TMEM43Q9BTV4 AP001002.3-201ENST00000623482 206 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
TMEM43Q9BTV4 PCNX4-203ENST00000406854 4666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
TMEM43Q9BTV4 STK3-201ENST00000419617 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
TMEM43Q9BTV4 COL17A1-201ENST00000353479 5734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
TMEM43Q9BTV4 TMEM143-201ENST00000293261 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
TMEM43Q9BTV4 AKNA-204ENST00000374075 5038 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
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TMEM43Q9BTV4 SFMBT1-201ENST00000394752 4548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
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TMEM43Q9BTV4 RPS6KA4-201ENST00000334205 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
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TMEM43Q9BTV4 SH3KBP1-205ENST00000397821 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
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TMEM43Q9BTV4 LINC02273-201ENST00000499452 1592 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
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TMEM43Q9BTV4 ITSN2-203ENST00000406921 4563 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
TMEM43Q9BTV4 EIF4G1-201ENST00000342981 5667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
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TMEM43Q9BTV4 MAGEB2-201ENST00000378988 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
TMEM43Q9BTV4 ADAM12-201ENST00000368676 3313 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
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TMEM43Q9BTV4 CD6-201ENST00000313421 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
TMEM43Q9BTV4 HAP1-204ENST00000393939 5683 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
TMEM43Q9BTV4 VGLL4-202ENST00000413604 1554 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
TMEM43Q9BTV4 NMBR-201ENST00000258042 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
TMEM43Q9BTV4 TMPRSS6-201ENST00000346753 3197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
TMEM43Q9BTV4 ASAP1-202ENST00000518721 5507 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
TMEM43Q9BTV4 GCNT7-201ENST00000243913 2064 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
TMEM43Q9BTV4 ELN-203ENST00000320492 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
TMEM43Q9BTV4 PEX5L-215ENST00000485199 2992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
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