Protein–RNA interactions for Protein: Q99698

LYST, Lysosomal-trafficking regulator, humanhuman

Predictions only

Length 3,801 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LYSTQ99698 EPHX2-209ENST00000521780 2038 ntTSL 2 BASIC9.83□□□□□ -0.84
LYSTQ99698 GTF2IRD1-201ENST00000265755 3430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
LYSTQ99698 SLA2-202ENST00000360672 2171 ntTSL 5 BASIC9.83□□□□□ -0.84
LYSTQ99698 RAB40B-206ENST00000571995 3859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
LYSTQ99698 PACSIN2-201ENST00000263246 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
LYSTQ99698 PRL-201ENST00000306482 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
LYSTQ99698 LOXHD1-203ENST00000398686 1958 ntTSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
LYSTQ99698 RAPGEFL1-212ENST00000620260 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
LYSTQ99698 NCK2-203ENST00000393349 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
LYSTQ99698 ABHD14B-201ENST00000315877 2236 ntTSL 5 BASIC9.83□□□□□ -0.84
LYSTQ99698 GALNTL6-205ENST00000511251 2905 ntTSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
LYSTQ99698 ZNF385A-201ENST00000338010 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
LYSTQ99698 PSG4-203ENST00000433626 1887 ntTSL 2 BASIC9.83□□□□□ -0.84
LYSTQ99698 METAP2-205ENST00000546753 1862 ntTSL 2 BASIC9.83□□□□□ -0.84
LYSTQ99698 MAGEA2B-202ENST00000370293 1714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.83□□□□□ -0.84
LYSTQ99698 TMEM176B-204ENST00000447204 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
LYSTQ99698 THAP4-203ENST00000402545 833 ntTSL 5 BASIC9.83□□□□□ -0.84
LYSTQ99698 SAPCD1-AS1-202ENST00000419679 461 ntTSL 3 BASIC9.83□□□□□ -0.84
LYSTQ99698 DDX39B-AS1-208ENST00000420520 516 ntTSL 3 BASIC9.83□□□□□ -0.84
LYSTQ99698 ST13P19-201ENST00000442505 1124 ntBASIC9.83□□□□□ -0.84
LYSTQ99698 AC009093.2-201ENST00000563477 546 ntTSL 4 BASIC9.83□□□□□ -0.84
LYSTQ99698 MYMX-201ENST00000573382 817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.83□□□□□ -0.84
LYSTQ99698 CDC25C-207ENST00000513970 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.83□□□□□ -0.84
LYSTQ99698 EOMES-201ENST00000295743 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
LYSTQ99698 LACTB2-201ENST00000276590 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
LYSTQ99698 HTR7-201ENST00000277874 3028 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
LYSTQ99698 HTR3D-201ENST00000334128 1459 ntTSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
LYSTQ99698 EHF-210ENST00000531794 1481 ntTSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
LYSTQ99698 AC073869.1-201ENST00000415574 2762 ntBASIC9.83□□□□□ -0.84
LYSTQ99698 LRFN2-201ENST00000338305 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
LYSTQ99698 CAB39L-204ENST00000409130 1411 ntTSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
LYSTQ99698 KRTAP19-5-201ENST00000334151 461 ntAPPRIS P1 BASIC9.83□□□□□ -0.84
LYSTQ99698 MDS2-201ENST00000374555 1029 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
LYSTQ99698 CCDC12-202ENST00000425441 1097 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.83□□□□□ -0.84
LYSTQ99698 LINC02063-201ENST00000503415 566 ntTSL 4 BASIC9.83□□□□□ -0.84
LYSTQ99698 AC108474.1-201ENST00000507776 421 ntTSL 3 BASIC9.83□□□□□ -0.84
LYSTQ99698 EMP3-204ENST00000596315 761 ntTSL 2 BASIC9.83□□□□□ -0.84
LYSTQ99698 Metazoa_SRP.156-201ENST00000622344 262 ntBASIC9.83□□□□□ -0.84
LYSTQ99698 SERP1-201ENST00000239944 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
LYSTQ99698 HS1BP3-201ENST00000304031 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
LYSTQ99698 COLEC11-203ENST00000382062 1633 ntTSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
LYSTQ99698 POLL-206ENST00000370172 2308 ntTSL 2 BASIC9.83□□□□□ -0.84
LYSTQ99698 TFB2M-201ENST00000366514 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
LYSTQ99698 FER1L4-213ENST00000621044 2778 ntTSL 2 BASIC9.82□□□□□ -0.84
LYSTQ99698 AC006063.2-201ENST00000640161 1696 ntTSL 5 BASIC9.82□□□□□ -0.84
LYSTQ99698 SVOPL-202ENST00000419765 1523 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.82□□□□□ -0.84
LYSTQ99698 ZNF180-202ENST00000391956 3049 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.82□□□□□ -0.84
LYSTQ99698 TADA3-204ENST00000440161 1617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.82□□□□□ -0.84
LYSTQ99698 AC004805.1-201ENST00000577662 1616 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.82□□□□□ -0.84
LYSTQ99698 Metazoa_SRP.6-201ENST00000366384 298 ntBASIC9.82□□□□□ -0.84
LYSTQ99698 KRTAP4-12-201ENST00000394014 1077 ntAPPRIS P1 BASIC9.82□□□□□ -0.84
LYSTQ99698 OR8T1P-201ENST00000421347 918 ntBASIC9.82□□□□□ -0.84
LYSTQ99698 LINC00303-203ENST00000427799 1028 ntTSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
LYSTQ99698 LINC00686-201ENST00000435412 332 ntTSL 3 BASIC9.82□□□□□ -0.84
LYSTQ99698 AC133141.1-201ENST00000443015 339 ntBASIC9.82□□□□□ -0.84
LYSTQ99698 TIMP1-205ENST00000456754 1095 ntTSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
LYSTQ99698 GABARAPL1-213ENST00000544284 531 ntTSL 3 BASIC9.82□□□□□ -0.84
LYSTQ99698 KRT8P1-201ENST00000557533 1207 ntBASIC9.82□□□□□ -0.84
LYSTQ99698 DIRC2-201ENST00000261038 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
LYSTQ99698 MECP2-217ENST00000628176 1712 ntTSL 3 BASIC9.82□□□□□ -0.84
LYSTQ99698 CSTB-201ENST00000291568 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
LYSTQ99698 PSMD2-201ENST00000310118 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
LYSTQ99698 DHCR7-202ENST00000407721 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
LYSTQ99698 RARS2-201ENST00000369536 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
LYSTQ99698 CHN2-201ENST00000222792 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
LYSTQ99698 UROC1-202ENST00000383579 2735 ntTSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
LYSTQ99698 WNT9B-202ENST00000393461 2654 ntTSL 2 BASIC9.82□□□□□ -0.84
LYSTQ99698 ELAVL2-208ENST00000544538 3789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.82□□□□□ -0.84
LYSTQ99698 COLCA2-202ENST00000526216 1332 ntTSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
LYSTQ99698 LILRB5-202ENST00000345866 1864 ntTSL 2 BASIC9.82□□□□□ -0.84
LYSTQ99698 RNF34-211ENST00000613529 1449 ntTSL 2 BASIC9.82□□□□□ -0.84
LYSTQ99698 OLIG2-201ENST00000333337 3262 ntAPPRIS P1 BASIC9.82□□□□□ -0.84
LYSTQ99698 SFTPA2-201ENST00000372325 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
LYSTQ99698 SLC29A1-209ENST00000427851 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
LYSTQ99698 AGT-201ENST00000366667 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
LYSTQ99698 GPN3-203ENST00000543199 1604 ntTSL 5 BASIC9.82□□□□□ -0.84
LYSTQ99698 UROC1-201ENST00000290868 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
LYSTQ99698 PLAU-202ENST00000446342 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.82□□□□□ -0.84
LYSTQ99698 ABAT-203ENST00000425191 1923 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.82□□□□□ -0.84
LYSTQ99698 LYPD5-202ENST00000414615 2137 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC9.82□□□□□ -0.84
LYSTQ99698 GSTZ1-210ENST00000554279 795 ntTSL 2 BASIC9.82□□□□□ -0.84
LYSTQ99698 ANXA8L1-206ENST00000619162 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
LYSTQ99698 SNRPA1-216ENST00000626000 539 ntTSL 5 BASIC9.82□□□□□ -0.84
LYSTQ99698 LINC01136-203ENST00000457348 2539 ntTSL 2 BASIC9.82□□□□□ -0.84
LYSTQ99698 LDB3-204ENST00000372066 1598 ntTSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
LYSTQ99698 AC021683.1-201ENST00000585798 1767 ntTSL 5 BASIC9.82□□□□□ -0.84
LYSTQ99698 AP2M1-207ENST00000439647 1950 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC9.82□□□□□ -0.84
LYSTQ99698 ASNS-201ENST00000175506 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
LYSTQ99698 MAGIX-208ENST00000616266 3295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.82□□□□□ -0.84
LYSTQ99698 LONRF1-201ENST00000398246 3594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.82□□□□□ -0.84
LYSTQ99698 BSDC1-205ENST00000446293 1505 ntTSL 2 BASIC9.82□□□□□ -0.84
LYSTQ99698 CCDC32-201ENST00000358005 1704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.82□□□□□ -0.84
LYSTQ99698 STOML1-206ENST00000561656 1833 ntTSL 3 BASIC9.82□□□□□ -0.84
LYSTQ99698 LINC00926-201ENST00000501726 2530 ntTSL 2 BASIC9.82□□□□□ -0.84
LYSTQ99698 CICP16-201ENST00000502609 2813 ntBASIC9.82□□□□□ -0.84
LYSTQ99698 EPHA5-202ENST00000354839 3427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
LYSTQ99698 DYRK1A-203ENST00000398956 1590 ntTSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
LYSTQ99698 AKT3-IT1-201ENST00000417120 517 ntTSL 5 BASIC9.82□□□□□ -0.84
LYSTQ99698 AC011247.2-201ENST00000457097 233 ntTSL 4 BASIC9.82□□□□□ -0.84
LYSTQ99698 LINC02352-201ENST00000557928 468 ntTSL 5 BASIC9.82□□□□□ -0.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 74.3 ms