Protein–RNA interactions for Protein: Q96P20

NLRP3, NACHT, LRR and PYD domains-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,036 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NLRP3Q96P20 AC009961.1-203ENST00000607836 2520 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
NLRP3Q96P20 PDE8B-204ENST00000342343 2677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
NLRP3Q96P20 FAM83A-202ENST00000518448 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
NLRP3Q96P20 C16orf54-201ENST00000329410 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
NLRP3Q96P20 ZNF174-201ENST00000268655 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
NLRP3Q96P20 LETMD1-201ENST00000262055 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
NLRP3Q96P20 LETMD1-203ENST00000418425 2123 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
NLRP3Q96P20 CYP20A1-203ENST00000429815 1812 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
NLRP3Q96P20 IL9RP3-201ENST00000442856 1674 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
NLRP3Q96P20 LACTB2-201ENST00000276590 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
NLRP3Q96P20 KCNC1-202ENST00000379472 7965 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
NLRP3Q96P20 TIGD2-202ENST00000603357 3217 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.93■□□□□ 0.46
NLRP3Q96P20 TNIP1-202ENST00000389378 2935 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
NLRP3Q96P20 MAGED4B-207ENST00000485287 2618 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
NLRP3Q96P20 GMEB1-202ENST00000361872 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
NLRP3Q96P20 CDH15-201ENST00000289746 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
NLRP3Q96P20 TMTC2-203ENST00000548305 2682 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
NLRP3Q96P20 EDNRB-204ENST00000626030 1571 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
NLRP3Q96P20 PAK1-201ENST00000278568 2543 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
NLRP3Q96P20 ICA1L-201ENST00000358299 3457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
NLRP3Q96P20 ATP2A3-206ENST00000397043 3197 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
NLRP3Q96P20 BAK1P1-201ENST00000317045 636 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
NLRP3Q96P20 LIMS1-201ENST00000332345 1235 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
NLRP3Q96P20 AL606748.1-201ENST00000423919 655 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
NLRP3Q96P20 ERP29P1-201ENST00000442902 706 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
NLRP3Q96P20 TXNRD2-206ENST00000462330 1129 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
NLRP3Q96P20 AC233724.6-201ENST00000503184 1088 ntAPPRIS P1 BASIC17.93■□□□□ 0.46
NLRP3Q96P20 AL691482.3-201ENST00000504773 987 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
NLRP3Q96P20 SNCB-203ENST00000506696 552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
NLRP3Q96P20 CRTC3-AS1-202ENST00000559531 657 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
NLRP3Q96P20 AC011472.1-201ENST00000588634 569 ntTSL 4 BASIC17.93■□□□□ 0.46
NLRP3Q96P20 DUSP22-213ENST00000605035 1231 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
NLRP3Q96P20 AC009975.2-202ENST00000634539 854 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
NLRP3Q96P20 SMAD3-201ENST00000327367 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
NLRP3Q96P20 DUS2-201ENST00000358896 1933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
NLRP3Q96P20 STAC-201ENST00000273183 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
NLRP3Q96P20 SYBU-205ENST00000422135 3226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
NLRP3Q96P20 BRAT1-201ENST00000340611 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
NLRP3Q96P20 APBB3-205ENST00000412920 1455 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
NLRP3Q96P20 LAP3P2-201ENST00000454686 1454 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
NLRP3Q96P20 C12orf76-207ENST00000549724 1302 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
NLRP3Q96P20 ZMYM3-203ENST00000373981 1841 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
NLRP3Q96P20 RBM12-201ENST00000359646 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
NLRP3Q96P20 RAB37-216ENST00000613645 1653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
NLRP3Q96P20 C7orf72-201ENST00000297001 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
NLRP3Q96P20 TBC1D3G-201ENST00000569055 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
NLRP3Q96P20 TBC1D3H-201ENST00000610350 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
NLRP3Q96P20 TBC1D3L-202ENST00000617678 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
NLRP3Q96P20 NIN-203ENST00000382041 6496 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
NLRP3Q96P20 ASIC4-201ENST00000347842 2684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
NLRP3Q96P20 JRK-203ENST00000571961 2687 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
NLRP3Q96P20 HDAC5-202ENST00000336057 5040 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
NLRP3Q96P20 KRT23-201ENST00000209718 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
NLRP3Q96P20 ALOX12B-201ENST00000319144 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
NLRP3Q96P20 EFHC1-212ENST00000635984 3293 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
NLRP3Q96P20 MAPK3-204ENST00000395200 997 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
NLRP3Q96P20 AL137058.1-201ENST00000418237 673 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
NLRP3Q96P20 AC084030.1-201ENST00000455068 561 ntTSL 4 BASIC17.92■□□□□ 0.46
NLRP3Q96P20 DPY19L2P5-201ENST00000456300 331 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
NLRP3Q96P20 NCK1-AS1-203ENST00000474250 827 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
NLRP3Q96P20 AL157792.1-201ENST00000488281 530 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
NLRP3Q96P20 AC132803.1-201ENST00000504204 493 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
NLRP3Q96P20 ALG1L13P-204ENST00000523017 765 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
NLRP3Q96P20 WDYHV1-206ENST00000523356 869 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
NLRP3Q96P20 NACA-221ENST00000552540 1074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
NLRP3Q96P20 AC005586.2-201ENST00000563946 837 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
NLRP3Q96P20 ZSCAN10-205ENST00000572548 618 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
NLRP3Q96P20 AC010335.1-201ENST00000594590 599 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
NLRP3Q96P20 HIST1H3F-201ENST00000618052 411 ntAPPRIS P1 BASIC17.92■□□□□ 0.46
NLRP3Q96P20 IRF9-202ENST00000396864 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
NLRP3Q96P20 MTCL1-203ENST00000400050 6042 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
NLRP3Q96P20 ERRFI1-201ENST00000377482 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
NLRP3Q96P20 ILF2-201ENST00000361891 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
NLRP3Q96P20 RCOR1-201ENST00000262241 5754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
NLRP3Q96P20 GMPR2-204ENST00000420554 1864 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
NLRP3Q96P20 GMPR2-223ENST00000559836 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
NLRP3Q96P20 USP47-207ENST00000527733 4525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
NLRP3Q96P20 GBA2-202ENST00000378094 3757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
NLRP3Q96P20 RELL1-201ENST00000314117 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
NLRP3Q96P20 APTX-211ENST00000463596 1345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
NLRP3Q96P20 ZNF425-201ENST00000378061 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
NLRP3Q96P20 INSC-208ENST00000530161 1702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
NLRP3Q96P20 TMED7-TICAM2-202ENST00000333314 3453 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
NLRP3Q96P20 RAB3IL1-201ENST00000301773 2125 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
NLRP3Q96P20 STAG3L2-201ENST00000426587 2130 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
NLRP3Q96P20 FLAD1-201ENST00000292180 2160 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
NLRP3Q96P20 SLC6A13-201ENST00000343164 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
NLRP3Q96P20 SH3BP5-206ENST00000426925 2190 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
NLRP3Q96P20 CCHCR1-208ENST00000451521 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
NLRP3Q96P20 GLB1L2-201ENST00000339772 3152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
NLRP3Q96P20 SSFA2-202ENST00000409001 4987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
NLRP3Q96P20 SETD1B-201ENST00000267197 5772 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
NLRP3Q96P20 ZNF804B-201ENST00000333190 4659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
NLRP3Q96P20 GSK3B-201ENST00000264235 7711 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
NLRP3Q96P20 PPP1R1B-202ENST00000394265 1419 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
NLRP3Q96P20 CBARP-204ENST00000590083 4261 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
NLRP3Q96P20 ARVCF-204ENST00000406522 2682 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
NLRP3Q96P20 NETO2-202ENST00000562435 7481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
NLRP3Q96P20 KAT5-216ENST00000534650 1875 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
NLRP3Q96P20 DUOXA1-216ENST00000613425 1867 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 76.3 ms