Protein–RNA interactions for Protein: Q96LD1

SGCZ, Zeta-sarcoglycan, humanhuman

Predictions only

Length 299 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGCZQ96LD1 AC015688.4-201ENST00000580780 1647 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
SGCZQ96LD1 SIGLEC11-202ENST00000426971 2479 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SGCZQ96LD1 IER3-201ENST00000259874 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SGCZQ96LD1 KRTAP19-5-201ENST00000334151 461 ntAPPRIS P1 BASIC13.44□□□□□ -0.26
SGCZQ96LD1 Metazoa_SRP.6-201ENST00000366384 298 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
SGCZQ96LD1 SF3B5-201ENST00000367569 693 ntAPPRIS P1 BASIC13.44□□□□□ -0.26
SGCZQ96LD1 CTNNBIP1-202ENST00000377258 852 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
SGCZQ96LD1 CRCP-204ENST00000398684 492 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
SGCZQ96LD1 MEMO1-204ENST00000407893 682 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
SGCZQ96LD1 BCYRN1-201ENST00000418539 200 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
SGCZQ96LD1 AC006003.1-201ENST00000448541 613 ntTSL 4 BASIC13.44□□□□□ -0.26
SGCZQ96LD1 AC125604.1-201ENST00000496255 707 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
SGCZQ96LD1 AC008406.1-201ENST00000509530 541 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
SGCZQ96LD1 CCNC-217ENST00000523985 958 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
SGCZQ96LD1 JMJD8-203ENST00000562824 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SGCZQ96LD1 AC005962.1-201ENST00000584100 773 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
SGCZQ96LD1 FXYD6-217ENST00000584394 669 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
SGCZQ96LD1 AC243967.2-201ENST00000601409 567 ntTSL 4 BASIC13.44□□□□□ -0.26
SGCZQ96LD1 AC133540.1-201ENST00000620845 1019 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
SGCZQ96LD1 AL805961.1-203ENST00000641078 1258 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
SGCZQ96LD1 ALAS2-202ENST00000335854 1795 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
SGCZQ96LD1 KHSRPP1-201ENST00000427983 1768 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
SGCZQ96LD1 ZFP36-203ENST00000597629 1786 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SGCZQ96LD1 PCDHA11-201ENST00000398640 6115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SGCZQ96LD1 CDPF1-203ENST00000404583 1439 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
SGCZQ96LD1 IFRD1-205ENST00000429071 1938 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
SGCZQ96LD1 MBLAC2-202ENST00000514906 1936 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
SGCZQ96LD1 NUP88-207ENST00000573584 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SGCZQ96LD1 DNAJC14-203ENST00000357606 3416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
SGCZQ96LD1 PI16-203ENST00000611814 2083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
SGCZQ96LD1 TRIM25-201ENST00000316881 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SGCZQ96LD1 BCAT2-201ENST00000316273 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SGCZQ96LD1 MRFAP1-202ENST00000382581 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SGCZQ96LD1 MRI1-202ENST00000319545 3027 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SGCZQ96LD1 GOLGA8S-201ENST00000562295 1878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
SGCZQ96LD1 FAM90A7P-201ENST00000382628 1395 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
SGCZQ96LD1 FAM90A23P-201ENST00000400136 1395 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
SGCZQ96LD1 UHRF2-201ENST00000276893 3452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SGCZQ96LD1 SPO11-203ENST00000371263 1834 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
SGCZQ96LD1 STOML1-206ENST00000561656 1833 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
SGCZQ96LD1 PPP4R4-201ENST00000304338 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
SGCZQ96LD1 HNRNPK-204ENST00000376263 2942 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
SGCZQ96LD1 KLHDC7A-201ENST00000400664 5145 ntAPPRIS P1 BASIC13.43□□□□□ -0.26
SGCZQ96LD1 R3HDM2P2-201ENST00000401880 2116 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
SGCZQ96LD1 SYBU-235ENST00000533895 3244 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
SGCZQ96LD1 LINC01285-201ENST00000412422 2289 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
SGCZQ96LD1 AC092384.2-204ENST00000565053 2566 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
SGCZQ96LD1 CTSW-204ENST00000528419 1341 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
SGCZQ96LD1 KLK11-207ENST00000594768 1347 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
SGCZQ96LD1 ATP2B3-202ENST00000349466 4280 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
SGCZQ96LD1 CBLN4-201ENST00000064571 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
SGCZQ96LD1 PLA1A-205ENST00000494440 1775 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
SGCZQ96LD1 XKR9-203ENST00000520030 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
SGCZQ96LD1 ARMCX6-207ENST00000538627 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
SGCZQ96LD1 CIT-219ENST00000612548 1799 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
SGCZQ96LD1 PDE4D-203ENST00000340635 8232 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
SGCZQ96LD1 DUS4L-201ENST00000265720 2220 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
SGCZQ96LD1 PXDNL-201ENST00000356297 4805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
SGCZQ96LD1 ASIC4-201ENST00000347842 2684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
SGCZQ96LD1 PIANP-202ENST00000534837 2695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
SGCZQ96LD1 TBC1D8B-203ENST00000357242 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
SGCZQ96LD1 KCNQ2-204ENST00000359125 3253 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
SGCZQ96LD1 GRID2IP-202ENST00000452113 3428 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
SGCZQ96LD1 RP1L1-202ENST00000382483 7973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
SGCZQ96LD1 IGDCC3-201ENST00000327987 4479 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
SGCZQ96LD1 KDM6B-201ENST00000254846 6713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
SGCZQ96LD1 FXYD5-201ENST00000342879 1580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
SGCZQ96LD1 ZNF248-202ENST00000374648 1286 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
SGCZQ96LD1 HCG27-201ENST00000383331 1720 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
SGCZQ96LD1 ZNF529-AS1-201ENST00000448373 1004 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
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SGCZQ96LD1 PLAT-205ENST00000519510 2030 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
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SGCZQ96LD1 SALL3-205ENST00000575389 3996 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
SGCZQ96LD1 NAT9-212ENST00000581136 1011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
SGCZQ96LD1 MED16-207ENST00000589119 2772 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
SGCZQ96LD1 AC011447.3-201ENST00000590606 722 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
SGCZQ96LD1 AL645939.5-201ENST00000606834 243 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
SGCZQ96LD1 AC026740.1-201ENST00000607068 791 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
SGCZQ96LD1 POFUT2-214ENST00000615172 2472 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
SGCZQ96LD1 AC068790.8-201ENST00000618862 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
SGCZQ96LD1 PAPOLA-201ENST00000216277 4519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
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SGCZQ96LD1 PAK4-205ENST00000593690 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
SGCZQ96LD1 LINC01270-201ENST00000371639 2281 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
SGCZQ96LD1 LINC02212-201ENST00000515243 2130 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
SGCZQ96LD1 ZIM2-AS1-201ENST00000595954 2129 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
SGCZQ96LD1 SRRD-201ENST00000215917 4020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
SGCZQ96LD1 CHEK2-204ENST00000382580 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
SGCZQ96LD1 C1QTNF9-201ENST00000332018 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
SGCZQ96LD1 EVA1A-202ENST00000393913 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
SGCZQ96LD1 FSD1L-206ENST00000481272 1804 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
SGCZQ96LD1 SFI1-209ENST00000443011 3579 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
SGCZQ96LD1 NIPAL4-201ENST00000311946 3274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
SGCZQ96LD1 JPH4-201ENST00000356300 4278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
SGCZQ96LD1 AC090515.2-201ENST00000500929 1396 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
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