Protein–RNA interactions for Protein: Q96JB2

COG3, Conserved oligomeric Golgi complex subunit 3, humanhuman

Predictions only

Length 828 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COG3Q96JB2 LETMD1-201ENST00000262055 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
COG3Q96JB2 LETMD1-203ENST00000418425 2123 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
COG3Q96JB2 UBE2D1-201ENST00000373910 2659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
COG3Q96JB2 PXN-201ENST00000228307 3785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
COG3Q96JB2 ZBTB7C-204ENST00000586438 4899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
COG3Q96JB2 BAX-201ENST00000293288 1358 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
COG3Q96JB2 RHD-203ENST00000357542 1387 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
COG3Q96JB2 STRA6-218ENST00000574278 2455 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
COG3Q96JB2 ZNF174-201ENST00000268655 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
COG3Q96JB2 NAA60-203ENST00000414063 2619 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
COG3Q96JB2 SLC35E2-202ENST00000355439 2078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
COG3Q96JB2 MYRF-203ENST00000389602 2052 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
COG3Q96JB2 DUS2-202ENST00000432752 1864 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
COG3Q96JB2 ABLIM2-209ENST00000505872 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
COG3Q96JB2 JADE2-201ENST00000282605 2748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
COG3Q96JB2 LRP10-201ENST00000359591 6886 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
COG3Q96JB2 PMM2-201ENST00000268261 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
COG3Q96JB2 SREBF1-201ENST00000261646 4178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
COG3Q96JB2 RIMS1-210ENST00000491071 5047 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
COG3Q96JB2 GAD1-201ENST00000344257 1029 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
COG3Q96JB2 STX1A-202ENST00000395154 1022 ntTSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
COG3Q96JB2 UPK1A-AS1-201ENST00000443196 795 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
COG3Q96JB2 CCDC18-AS1-219ENST00000451302 1212 ntTSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
COG3Q96JB2 RN7SL8P-201ENST00000461771 266 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
COG3Q96JB2 AC092535.3-201ENST00000504969 468 ntTSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
COG3Q96JB2 CSTF3-206ENST00000524827 693 ntTSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
COG3Q96JB2 LINC01584-201ENST00000562495 676 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
COG3Q96JB2 DNM1P30-201ENST00000563586 452 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
COG3Q96JB2 TMEM205-210ENST00000588560 840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
COG3Q96JB2 AC136475.1-202ENST00000602429 1151 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
COG3Q96JB2 AC009975.2-202ENST00000634539 854 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
COG3Q96JB2 NOMO2-203ENST00000543392 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
COG3Q96JB2 OSGIN2-202ENST00000451899 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
COG3Q96JB2 USP35-204ENST00000530267 2419 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
COG3Q96JB2 CDK3-202ENST00000448471 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
COG3Q96JB2 STAT1-203ENST00000392323 2723 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
COG3Q96JB2 SLC22A7-203ENST00000372589 2549 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
COG3Q96JB2 TIMP3-201ENST00000266085 4603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
COG3Q96JB2 ELP5-203ENST00000396627 1389 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
COG3Q96JB2 ATP6V0E2-AS1-201ENST00000461019 2973 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
COG3Q96JB2 LINC01648-201ENST00000445180 1519 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
COG3Q96JB2 DDX49-201ENST00000247003 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
COG3Q96JB2 AL353803.2-201ENST00000436510 1846 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
COG3Q96JB2 VDAC1-201ENST00000265333 1953 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
COG3Q96JB2 MEIOC-201ENST00000409122 4604 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
COG3Q96JB2 FBXO45-202ENST00000440469 3689 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
COG3Q96JB2 UBE2V2-205ENST00000521346 1322 ntTSL 3 BASIC19.55■□□□□ 0.72
COG3Q96JB2 PTBP1-204ENST00000394601 3185 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
COG3Q96JB2 AC021683.1-201ENST00000585798 1767 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
COG3Q96JB2 GHDC-207ENST00000587427 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
COG3Q96JB2 GRAP-201ENST00000284154 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
COG3Q96JB2 PIANP-202ENST00000534837 2695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
COG3Q96JB2 LONRF1-201ENST00000398246 3594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
COG3Q96JB2 KIF13B-206ENST00000524189 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
COG3Q96JB2 ST3GAL2-201ENST00000342907 4450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
COG3Q96JB2 AMZ1-201ENST00000312371 5516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
COG3Q96JB2 LGALS12-202ENST00000340246 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
COG3Q96JB2 TCL1B-201ENST00000340722 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
COG3Q96JB2 TMEM230-202ENST00000342308 1562 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
COG3Q96JB2 SUOX-202ENST00000356124 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
COG3Q96JB2 WDTC1-202ENST00000361771 4275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
COG3Q96JB2 YY1AP1-210ENST00000368339 3073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
COG3Q96JB2 HILPDA-202ENST00000435296 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
COG3Q96JB2 SAP30L-203ENST00000440364 792 ntTSL 3 BASIC19.55■□□□□ 0.72
COG3Q96JB2 CD164-210ENST00000512821 964 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
COG3Q96JB2 ANXA5-210ENST00000515017 1190 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
COG3Q96JB2 METAP2-205ENST00000546753 1862 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
COG3Q96JB2 SNHG21-204ENST00000559366 674 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
COG3Q96JB2 RPL17P45-201ENST00000586289 509 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
COG3Q96JB2 APBB1-220ENST00000609331 1574 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
COG3Q96JB2 PDE1C-201ENST00000321453 2898 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
COG3Q96JB2 AC215219.1-201ENST00000400706 1817 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
COG3Q96JB2 ABI2-215ENST00000430418 1676 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
COG3Q96JB2 LACTB2-201ENST00000276590 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
COG3Q96JB2 HLA-DQB1-202ENST00000399079 1501 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
COG3Q96JB2 PAXBP1-202ENST00000331923 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
COG3Q96JB2 TDRD6-203ENST00000544460 8887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
COG3Q96JB2 MGME1-201ENST00000377704 1781 ntTSL 3 BASIC19.55■□□□□ 0.72
COG3Q96JB2 FBXL7-203ENST00000510662 1758 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
COG3Q96JB2 FOXE1-201ENST00000375123 3462 ntAPPRIS P1 BASIC19.55■□□□□ 0.72
COG3Q96JB2 RCAN3-202ENST00000374395 6802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
COG3Q96JB2 TICAM2-201ENST00000427199 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
COG3Q96JB2 AMZ2P1-202ENST00000430983 3425 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
COG3Q96JB2 GMPR2-204ENST00000420554 1864 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
COG3Q96JB2 GMPR2-223ENST00000559836 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
COG3Q96JB2 ACSS1-201ENST00000323482 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
COG3Q96JB2 CCDC32-201ENST00000358005 1704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
COG3Q96JB2 ZCCHC17-202ENST00000373714 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
COG3Q96JB2 LINC02395-201ENST00000546821 3157 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
COG3Q96JB2 NEO1-202ENST00000339362 7342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
COG3Q96JB2 IL9-201ENST00000274520 591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
COG3Q96JB2 TNNT2-202ENST00000360372 969 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
COG3Q96JB2 TNNT2-204ENST00000367317 1050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
COG3Q96JB2 S100A2-203ENST00000368709 457 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.54■□□□□ 0.72
COG3Q96JB2 DYDC1-201ENST00000372202 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.54■□□□□ 0.72
COG3Q96JB2 DEFB123-201ENST00000376309 467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
COG3Q96JB2 VCPKMT-201ENST00000395859 795 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
COG3Q96JB2 PIK3IP1-202ENST00000402249 999 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
COG3Q96JB2 TNNT2-209ENST00000421663 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
COG3Q96JB2 AL109767.1-201ENST00000429450 564 ntTSL 4 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.1 ms